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魚類分類２０１２



　種小名はフィッシュベース FishBase 準拠。
　標準和名及び公的機関の報告書等にある名称は太字。
""は暫定（未確認の標準和名・通称・現地語・英名音読み・直訳・意訳・管理人造語）。趣味家間・ショップの表記等で問題無し。
"（使用不可）"は農林水産省による食用魚表記に関する指示。知識としてはあってもよいが、公の場で使用しない。
　消滅種小名追加と種小名語尾変化統一（暫定）。対応済み。→検索・引用に注意。
　ワシントン条約対象魚種。CITES APPENDIX I/II/III。対応済み。
　国際自然保護連合リスト。対応済み。
　特定外来生物による生態系等に係る被害の防止に関する法律。特定外来生物・未判定外来生物及び要注意外来生物指定魚種。対応済み。
　絶滅のおそれのある野生動植物の種の保存に関する法律＝種の保存法対象魚種。対応済み。
　環境省レッドリスト＝環（ＲＬ）。対応済み（２０１３年第４次記載分まで）。
　大西洋まぐろ類保存国際委員会（ＩＣＣＡＴ）による管理対象魚種。対応済み。
　合衆国魚類及び野生生物保護局対象魚種。対応済み。
　ベルン条約（Convention on the Conservation of European Wildlife and Natural Habitats）対象魚種（Appendix TUVW）。対応済み。
　独立行政法人水産総合研究センター開発魚。対応済み。
　西表石垣国立公園海中公園地区における指定動植物種（採集禁止）。対応済み。
　関連する（可能性のある）地方条例一覧。対応済み。
　水族館級魚類飼育目安添付（混泳はサイズを合わせることが大前提。水温データはアトラスより、分布域により要調整）。＋フィッシュベース。
　エピソード・コメント。随時。英文献読解補助。
　現在絶滅魚種の確認作業中です（終了予定：２０１３年末）。確認を終えた絶滅魚種には記載者名・記載年月日が付されています（無いものはネット上などから収集しリスト化ただけの状態。誤り等ある可能性）。注）.現生魚種の記載者・記載年はフィッシュベース基準・確認もそちらで。
　参照・参考文献はこのページ最下段プルダウンボックス内にあります。利便性を考えれば各ページ毎に振り分けたほうが良いのでしょうが、その時間がありません。
　使用している切手のデータはこちら（魚類の情報はありません）。

＊水槽の基準
　３０ｃｍ水槽＝（Ｗ）３０〜３５×（Ｄ）１５〜３５×（Ｈ）１５〜４０ｃｍ、プラケース含む。
　４５ｃｍ水槽＝（Ｗ）４５×（Ｄ）３０〜４５×（Ｈ）３６〜４５ｃｍ。
　６０ｃｍ水槽＝（Ｗ）６０〜７５×（Ｄ）３０〜４５×（Ｈ）３６〜４５ｃｍ。
　９０ｃｍ水槽＝（Ｗ）９０×（Ｄ）４５〜６０×（Ｈ）４５〜６０ｃｍ。及び（Ｗ）１２０〜１８０×（Ｄ）４５×（Ｈ）４５ｃｍ。
　１２０ｃｍ水槽＝（Ｗ）１２０×（Ｄ）６０〜９０×（Ｈ）４５〜６０ｃｍ。規格水槽は９０ｃｍ水槽扱い。
　１８０ｃｍ水槽＝（Ｗ）１８０×（Ｄ）９０〜１２０×（Ｈ）４５〜９０ｃｍ。規格水槽は９０ｃｍ水槽扱い。
　水族館クラス＝上記規格以上、及びパノラマ水槽・プール。
　
　文字化けする方へ
　文字化けは大抵こちらのページにかけてあるTimes New Romanが原因です（リンクで飛ぶと変わってしまうのもこれ）。ブラウザのエンコードを都度調整する・ブラウザを最新のバージョンにする（当方のＩＥ８・ＦＩＲＥ ＦＯＸ４．０．１で表示確認）などしてみて下さい。

　ＦＩＲＥ ＦＯＸでは正常な表示が出来ない部分があります（文字の色・リンクが押せない等）。ＩＥを介して訪問して下さい。


●自分自身で調べたい方に役立つウェブサイト●



Phylum Vertebrata LINNE 1758

SUPER-CLASS AGNATHA COPE 1889 無顎上綱　※以下全て（哺乳類まで）Craniata（有頭動物）。
　CLASS ANASPIDI　欠甲綱 (絶滅)　"前ヤツメウナギ類"　※＝Anaspida。→CEPHALASPIDOMORPHI。
　　Order Anaspidiformes　欠甲目 (絶滅)
　　　Family Birkeniidae　ビルケニア科 (絶滅)　※＋Pterygolepididae、Ramsaasalepididae。シルル紀。
　　　Family Lasaniidae　ラサニウス科 (絶滅)　※←LASANIIFORMES。→Birkeniidae？
　　　Family Pharyngolepididae　ファリンゴレピス科 (絶滅)　※→Birkeniidae。
　　　Family Rhyncholepididae　リンコレピス科 (絶滅)　※→Birkeniidae。
　　　Family Septentrioniidae　セプテントリオニア科 (絶滅)
　　　Family Tahulalepididae　タフラレピス科 (絶滅)
　　　Family uncertain
　　　　Genus Ruhnulepis BLOM, MÄRSS & MILLER 2001　ルーヌレピス属 (絶滅)
　　　　　Ruhnulepis longicostata Blom, Märss & Miller 2001 (絶滅)
　　Order Jamoytiiformes　ヤモイティウス目 (絶滅)　
　　　Family Achanarellidae　アカナレルラ科 (絶滅)
　　　Family Euphaneropidae　エウファネロプス科 (絶滅)　※＋Endeiolepididae。
　　　Family Jamoytiidae　ヤモイティウス科 (絶滅)
　CLASS CEPHALASPIDOMORPHI ケファラスピス綱
　　Order Cephalaspidiformes　ケファラスピス目 (絶滅)
　　　Family Ateleaspididae　アテレアスピス科 (絶滅)　※←Atelaspidiformes。＋Hemicyclaspididae。Osteostraciformes？
　　　Family Benneviaspididae　ベンネウィアスピス科 (絶滅)
　　　Family Boreaspididae　ボレアスピス科 (絶滅)
　　　Family Cephalaspididae　ケファラスピス科 (絶滅)
　　　Family Escuminaspididae　エスクミナスピス科 (絶滅)　※→Cephalaspididae。
　　　Family Kiaeraspididae　キアエラスピス科 (絶滅)
　　　Family Parameteoraspididae　パラメテオラスピス科 (絶滅)
　　　Family Thyestidae　ティエステス科 (絶滅)　※　※＋Sclerodontidae(＝Sclerotidae)。→Tremataspididae。
　　Order Eugaleaspidiformes　エウガレアスピス目 (絶滅)　※＝Galeaspida、Galeaspidiformes。
　　　Family Duyunolepididae　ドゥユノレピス科 (絶滅)
　　　Family Eugaleaspididae　エウガレアスピス科 (絶滅)　※＝Galeaspididae。
　　　Family Hanyangaspididae　ハンヤンガスピス科 (絶滅)
　　　Family Huananaspididae　フナナスピス科 (絶滅)　※←Huananaspidiformes。＋Gantarostrataspididae、Sanchaspididae。
　　　Family Lungmenshanaspididae　ルングメンサナスピス科 (絶滅)
　　　Family Nanpanaspididae　ナンパナスピス科 (絶滅)　※Nanpanaspidiformes、Polybranchiaspidiformes？
　　　Family Sanqiaspididae　サンクイアスピス科 (絶滅)
　　　Family Tridensaspididae　トリデンサスピス科 (絶滅)
　　Order Osteostraciformes　骨甲目 (絶滅)　※＝Osteostraci POWRIE & LANKESTER 1968。
　　　Family Boreaspididae　ボレアスピス科 (絶滅)
　　　Family Tremataspididae　トレマタスピス科 (絶滅)
　　　　Sub-Family Dartmuthiinae　ダルトムティア亜科 (絶滅)　※←Dartmuthiidae。
　　　　Sub-Family Didymaspidinae　ディディマスピス亜科 (絶滅)　※←Didymaspididae。
　　　　Sub-Family Oeselaspidinae　オエセラスピス亜科 (絶滅)　※←Oeselaspididae。
　　　　Sub-Family Tremataspidinae　トレマタスピス亜科 (絶滅)
　　　Family Zenaspididae　ゼナスピス科 (絶滅)　※＝Zenaspidida。
　　Order Polybranchiaspidiformes　ポリブランキアスピス目 (絶滅)
　　　Family Dayongaspididae　ダヨンガスピス科 (絶滅)　※→Hanyangaspidae。
　　　Family Polybranchiaspididae　ポリブランキアスピス科 (絶滅)　※＋Geraspididae。
　　　Family Xiushuiaspididae　キシウスイアスピス科 (絶滅)
　　　Family Zhaotongaspididae　ザオトンガスピス科 (絶滅)
　　Order Pituriaspidiformes　ピトゥリアスピス目 (絶滅)
　　　Family Pituriaspididae　ピトゥリアスピス科 (絶滅)　※＋Neeyambaspididae。
　　Order Scolenaspidiformes　スコレナスピス目 (絶滅)
　　　Family Scolenaspididae　スコレナスピス科 (絶滅)
　　　　　※→Zenaspididae。＋Pattenaspididae。
　　Order uncertain
　　　Genus Diploholcaspis WANG, WANG & ZHU 2009　ディプロホルカスピス属 (絶滅)　※デボン紀。
　　　　Diploholcaspis daleensis Wang, Wang & Zhu 2009 (絶滅)
CONODONTA 　CLASS Conodontomorphi 錐歯綱　"コノドント類" (絶滅)　※＝Conodonta PANDER 1856、Conodontophorida EICHENBERG 1930。
　　Order Ozarkodiniformes　オザルコディナ目 (絶滅)　※＝Ozarkodinida。
　　　　Family Anchignathodontidae　アンキグナトドゥス科 (絶滅)
　　　　Family Ancyrognathidae　アンキログナトゥス科 (絶滅)　※←Spathognathodontidaeより。→Eognathodontidae。
　　　　Family Bactrognathidae　バクトログナトゥス科 (絶滅)　※Sub-Family Coleodontinaeより。→Coleodontidae。
　　　　Family Belodontidae　ベロドゥス科 (絶滅)
　　　　Family Cavusgnathidae　カウスグナトゥス科 (絶滅)
　　　　Family Coleodontidae　コレオドゥス科 (絶滅)
　　　　　Sub-Family Coleodontinae　コレオドゥス亜科 (絶滅)
　　　　　Sub-Family Cyrtoniodontinae　キルトニオドゥス亜科 (絶滅)　※←Cyrtoniodontidae HASS 1959。
　　　　　Sub-Family Hindeodellinae　ヒッバルデルラ亜科 (絶滅)　※Prioniodinidaeより。
　　　　　Sub-Family Hindeodellinae　ヒンデオデルラ亜科 (絶滅)
　　　　　Sub-Family Ligonodininae　リゴノディナ亜科 (絶滅)　※Prioniodinidaeより。
　　　　　Sub-Family Neoprioniodontinae　ネオプリオニオドゥス亜科 (絶滅)
　　　　Family Cordylodontidae　コルディロドゥス科 (絶滅)　※←Proconodontiformesより。Belodidae？
　　　　Family Elictognathidae　エリクトグナトゥス科 (絶滅)
　　　　Family Eognathodontidae　エオグナトドゥス科 (絶滅)
　　　　Family Eopolygnathidae　エオグナトドゥス科 (絶滅)
　　　　Family Francodinidae　フランコディナ科 (絶滅)
　　　　Family Gnathodontidae　グナトドゥス科 (絶滅)
　　　　Family Gondolellidae　ゴンドレルラ科 (絶滅)　※Polygnathidaeより。
　　　　Family Idiognathodontidae　イディオグナトドン科 (絶滅)
　　　　Family Kockelellidae　コッケレルラ科 (絶滅)　※＋Ctenognathidae (但し Ctenognathus は現在昆虫が使用)。
　　　　Family Mestognathidae　メストグナトゥス科 (絶滅)
　　　　Family Neospathodontidae　ネオスパトドゥス科 (絶滅)
　　　　"Family Ozarkodinidae　オザルコディナ科" (絶滅)
　　　　Family Palmatolepididae　パルマトレピス科 (絶滅)
　　　　Family Periodontidae　ペリオドン科 (絶滅)　※←Proconodontiformesより。
　　　　Family Plectodinidae　プレクトディナ科 (絶滅)
　　　　Family Polygnathidae　ポリグナトゥス科 (絶滅)　※＋Neurodontiformes。
　　　　Family Pterospathodontidae　プテロスパトドゥス科 (絶滅)
　　　　Family Spathognathodontidae　スパトグナトドゥス科 (絶滅)
　　　　Family Sweetognathidae　スウェエトグナトゥス科 (絶滅)
　　　　Family Trucherognathidae　トゥルケログナトゥス科 (絶滅)　※Sub-Family Coleodontinaeより。→Coleodontidae？
　　"Order Panderodontiformes　パンデロドゥス目" (絶滅)　※＝Panderodontida。＋Belodellida。
　　　　Family Ansellidae　アンセルラ科 (絶滅)　※Belodellida。
　　　　Family Belodellidae　ベロデルラ科 (絶滅)　※Belodellida。→Panderodontidae。
　　　　Family Panderodontidae　パンデロドゥス科 (絶滅)
　　　　Family Scolopodontidae　スコロポドゥス科 (絶滅)　※Distacodontidaeより。
　　"Order Prionidontiformes　プリオニオドゥス目" (絶滅)　※＝Prionidontida。
　　　　Family Acodontidae　アコドゥス科 (絶滅)　※Distacodontidaeより。
　　　　Family Balognathidae　バログナトゥス科 (絶滅)
　　　　Family Chirognathidae　キログナトゥス科 (絶滅)
　　　　Family Distacodontidae　ディスタコドゥス科 (絶滅)　※＝Distacodidae。
　　　　Family Distomodontidae　ディストモドゥス科 (絶滅)
　　　　Family Gamachignathidae　ガマキグナトゥス科 (絶滅)
　　　　Family Icriodellidae　イクリオデルラ科 (絶滅)　※→Balognathidae？
　　　　Family Icriodontidae　イクリオドゥス科 (絶滅)
　　　　Family Jablonnodontidae　ヤブロンノドゥス科 (絶滅)
　　　　Family Multioistodontidae　ムルティオイストドゥス科 (絶滅)
　　　　Family Oistodontidae　オイストドゥス科 (絶滅)　※Distacodontidaeより。→Ozarkodiniformes？、
　　　　Family Paracordylodontidae　パラコルディロドゥス科 (絶滅)
　　　　Family Polyplacognathidae　ポリプラコグナトゥス科 (絶滅)　※→Balognathidae。
　　　　Family Prioniodontidae　プリオニオドゥス科 (絶滅)　※＝Prioniodidae。
　　　　Family Pygodontidae　ピゴドゥス科 (絶滅)
　　　　Family Rhipidognathidae　リピドグナトゥス科 (絶滅)
　　Order Prioniodiniformes　プリオニオディナ目 (絶滅)　※＝Prioniodinida。→Ozarkodiniformes？
　　　　Family Ellisoniidae　エルリソニア科 (絶滅)
　　　　Family Oepikodontidae　オエピコドゥス科 (絶滅)　※Prioniodinidaeより分離独立。
　　　　Family Phragmodontidae　フラグモドゥス科 (絶滅)
　　　　Family Prioniodinidae　プリオニオディナ科 (絶滅)
　　　　Family Xaniognathidae　キサニオグナトゥス科 (絶滅)　※Ellisoniidaeより分離独立。
　　"Order Proconodontiformes　プロコノドントゥス目" (絶滅)　※＝Proconodontida。
　　　　Family Dapsilodontidae　ダプシロドゥス科 (絶滅)　※→Belodellida？
　　　　Family Fryxellodontidae　フリクセルロドントゥス科 (絶滅)
　　　　Family Proconodontidae　プロコノドントゥス科 (絶滅)
　　　　Family Pseudoonetodontidae　プセウドオネオトドゥス科 (絶滅)　※→Fryxellodontidae？
　　"Order Protopanderodontiformes　プロトパンデロドゥス目" (絶滅)　※＝Protopanderodontida。
　　　　Family Acanthodontidae　アカントドゥス科 (絶滅)　※←Belodontidaeより。
　　　　Family Clavohamulidae　クラウォハムルス科 (絶滅)
　　　　Family Cornuodontidae　コルヌオドゥス科 (絶滅)　※→Strachanognathidae？
　　　　Family Drepanoistodontidae　ドレパノイストドゥス科 (絶滅)　※←Distacodontidaeより。
　　　　Family Oneotodontidae　オネオトドゥス科 (絶滅)
　　　　Family Protopanderodontidae　プロトパンデロドゥス科 (絶滅)
　　　　Family Strachanognathidae　ストラカノグナトゥス科 (絶滅)　※→Belodontidae？
　　"Order Westergaardodiniformes　ウェステルガアルドディナ目" (絶滅)　※Westergaardodinida。
　　　　Family Furnishinidae　フルニシナ科 (絶滅)
　　　　Family Westergaardodinidae　ウェステルガアルドディナ科 (絶滅)
　　Order uncertain
　　　Family Nurrellidae　ヌルレルラ科 (絶滅)
　　　Family Playfordiidae　プライフォルディア科 (絶滅)
　　　Family Serratognathidae　セルラトグナトゥス科 (絶滅)
　　　Family uncertain
　　　　Genus Anticostiodus ZHANG & BARNES 2000　アンティコスティオドゥス属 (絶滅)
　　　　　Anticostiodus boltoni Zhang & Barnes 2000 (絶滅)
　　　　　Anticostiodus fahraeusi Zhang & Barnes 2000 (絶滅)
　　　　Genus Bajadontus ORCHARD, WHALEN, CARTER & TAYLOR 2007　バヤドントゥス属 (絶滅)
　　　　　Bajadontus unicornis Orchard, Whalen, Carter & Taylor 2007 (絶滅)
　　　　Genus Baodingodus AN & MEI 1993　バオディンゴドゥス属 (絶滅)
　　　　　Baodingodus papillatus An & Mei 1993 (絶滅)
　　　　Genus Didymodella MOSHER 1969　ディディモデルラ属 (絶滅)
　　　　　Didymodella alternata (Mosher 1968) (絶滅)
　　　　　　　syn.Dichodella alternata Mosher 1968
　　　　Genus Digitodontus HITCH 1990　ディギトドントゥス属 (絶滅)
　　　　　Digitodontus bellistriatus Hitch 1990 (絶滅)
　　　　Genus Dolabrodus AN 1982　ドラブロドゥス属 (絶滅)
　　　　　Dolabrodus prolongatus An & Mei 1993 (絶滅)
　　　　Genus Embsaygnathus METCALFE 1981　エムブサイグナトゥス属 (絶滅)
　　　　　Embsaygnathus asymmetricus Metcalfe 1981 (絶滅)
　　　　　Embsaygnathus crosbiei Jones 1991 (絶滅)
　　　　Genus Hamulosodina COOPER 1931　ハムロソディナ属 (絶滅)
　　　　　Hamulosodina bransoni Elias 1956 (絶滅)
　　　　　Hamulosodina brevis Elias 1956 (絶滅)
　　　　　Hamulosodina cooperi Elias 1956 (絶滅)
　　　　　Hamulosodina nodosa Cooper 1931 (絶滅)
　　　　Genus Hunanognathus DONG 1993　フナノグナトゥス属 (絶滅)
　　　　　Hunanognathus tricuspidatus Dong 1993 (絶滅)
　　　　Genus Iapetonudus NICOLL, MILLER, NOWLAN, REPETSKI & ETHINGTON 1999　イアペトヌドゥス属 (絶滅)
　　　　　Iapetonudus ibexensis Nicoll, Miller, Nowlan, Repetski & Ethington 1999 (絶滅)
　　　　Genus Icriognathus MÄNNIK 1992　イクリオグナトゥス属 (絶滅)
　　　　　Icriognathus cornutus Männik 1992 (絶滅)
　　　　Genus Kimognathus MASHKOVA 1978　キモグナトゥス属 (絶滅)
　　　　　Kimognathus alexeii Mashkova 1978 (絶滅)
　　　　Genus Laiwugnathus AN 1982　ライウグナトゥス属 (絶滅)
　　　　　Laiwugnathus curvatus An & Mei 1993 (絶滅)
　　　　　Laiwugnathus graoilentus An & Mei 1993 (絶滅)
　　　　　Laiwugnathus kouzhenensis An 1982 (絶滅)
　　　　　　Laiwugnathus kouzhenensis advanus An & Mei 1993 (絶滅)
　　　　　　Laiwugnathus kouzhenensis kouzhenensis An 1982 (絶滅)
　　　　　Laiwugnathus laiwuensis An 1982 (絶滅)
　　　　　　Laiwugnathus laiwuensis expansus An 1982 (絶滅)
　　　　　　Laiwugnathus laiwuensis laiwuensis An 1982 (絶滅)
　　　　　Laiwugnathus sagittatus An & Mei 1993 (絶滅)
　　　　　Laiwugnathus wanxianensis An & Mei 1993 (絶滅)
　　　　Genus Lepodus BRANSON & MEHL 1933　レポドゥス属 (絶滅)　※Bramidaeのsynonymあり。
　　　　　Lepodus minutus Branson & Mehl 1933 (絶滅)
　　　　Genus Minimodus RASMUSSEN 2001　ミニモドゥス属 (絶滅)
　　　　　Minimodus poulseni Rasmussen 2001 (絶滅)
　　　　Genus Montognathus JENKINS, CRANE & MORY 1993　モントグナトゥス属 (絶滅)
　　　　　Montognathus carinatus Jenkins, Crane & Mory 1993 (絶滅)
　　　　　Montognathus semicarinatus Jenkins, Crane & Mory 1993 (絶滅)
　　　　Genus Muellerina SZANIAWSKI 1971　ムエルレリナ属 (絶滅)　※同属名の植物有り。
　　　　　Muellerina pomeranensis Szaniawski 1971 (絶滅)
　　　　Genus Oleandodus VAN WAMEL 1974　オレアンドドゥス属 (絶滅)
　　　　　Oleandodus costatus van Wamel 1974 (絶滅)
　　　　Genus Onyxodus WATSON 1988　オニクソドゥス属 (絶滅)
　　　　　Onyxodus acuoliratus Watson 1988 (絶滅)
　　　　Genus Pachycladina STAESCHE 1964　パキクラディナ属 (絶滅)
　　　　　Pachycladina dicerodentata Wang & Dai 1981 (絶滅)
　　　　　Pachycladina multispinosa Thang 1989 (絶滅)
　　　　　Pachycladina obliqua Staesche 1964 (絶滅)
　　　　　Pachycladina planodentata Wang & Dai 1981 (絶滅)
　　　　　Pachycladina postdentata Wang & Cao 1981 (絶滅)
　　　　Genus Paibiconus DONG 1993　パイビコヌス属 (絶滅)
　　　　　Paibiconus proarcuatus Dong 1993 (絶滅)
　　　　Genus Polycaulodus BRANSON & MEHL 1933　ポリカウロドゥス属 (絶滅)
　　　　　Polycaulodus bidentatus Branson & Mehl 1933 (絶滅)
　　　　Genus Pteroconus BRANSON & MEHL 1933　プテロコヌス属 (絶滅)
　　　　　Pteroconus compressus Branson & Mehl 1933 (絶滅)
　　　　　　　syn.? Ptiloconus compressus Sweet 1955
　　　　　Pteroconus gracilis Branson & Mehl 1933 (絶滅)
　　　　　　　syn.? Ptiloconus gracilis Sweet 1955
　　　　　Pteroconus robustus Stauffer 1935 (絶滅)
　　　　　Pteroconus tortus Branson & Mehl 1933 (絶滅)
　　　　Genus Rhombocorniculum WALLISER 1958　ロムボコルニクルム属 (絶滅)
　　　　　Rhombocorniculum comleyense Walliser 1958 (絶滅)
　　　　Genus Scotlandia COSSMANN 1909　スコトランディア属 (絶滅)
　　　　Genus Serratocambria MÜLLER & HINZ 1991　セルラトカムブリア属 (絶滅)
　　　　　Serratocambria dacryoidea An & Mei 1993 (絶滅)
　　　　　Serratocambria minuta Müller & Hinz 1991 (絶滅)
　　　　Genus Shandongodus AN 1982　サンドンゴドゥス属 (絶滅)
　　　　　Shandongodus priscus An 1982 (絶滅)
　　　　Genus Stenothecopsis COBBOLD 1935　ステノテコプシス属 (絶滅)　※貝。
　　　　Genus Toxotodus SMITH 1991　トクソトドゥス属 (絶滅)
　　　　　Toxotodus amphigyus Smith 1991 (絶滅)
　　　　　Toxotodus carlae Repetski 1982 (絶滅)
　　　　　Toxotodus gabriellae Löfgren 1998 (絶滅)
　　　　Genus Weyerognathus DZIK 1997　ウェイェログナトゥス属 (絶滅)
　　　　　Weyerognathus triangulus Dzik 1997 (絶滅)
　　　　Genus Xuzhougnathus DING & WAN 1990　クスゾウグナトゥス属 (絶滅)
　　　　　Xuzhougnathus monoridgosus Ding & Wan 1990 (絶滅)
　　　　Genus Yongshunella DONG & BERGSTRÖM 2001　ヨングスネルラ属 (絶滅)
　　　　　Yongshunella polymorpha Dong & Bergström 2001 (絶滅)
　CLASS MYXINI ヌタウナギ綱（aka.メクラウナギ綱）　※＝Myxinomorphi。PTERASPIDOMORPHIとされることが有る。
　　Order Myxiniformes ヌタウナギ目（aka.メクラウナギ目）
　　　Family Myxinidae ヌタウナギ科（aka.メクラウナギ科）　※＋Homeidae。
　CLASS PETROMYZONTOMORPHI ヤツメウナギ綱　※＝HYPEROARTII、PETROMYZONTIDA。ケファラスピス綱と関連させる意見あり。
　　Order Myllokunmingiiformes　ミルロクンミンギア目 (絶滅)　※＝Myllokunmingiida。
　　　Family Myllokunmingiidae　ミルロクンミンギア科 (絶滅)
　　Order Petromyzontiformes ヤツメウナギ目
　　　Family Mayomyzonidae マヨミゾン科 (絶滅)　"ムカシヤツメ"　※＝Mayomyzontidae。
　　　Family Petromyzontidae ヤツメウナギ科
　　　　Sub-Family Geotrinae ミナミヤツメ亜科　※←Geotridae。
　　　　Sub-Family Petromyzontinae ヤツメウナギ亜科
　CLASS PTERASPIDOMORPHI　翼甲綱 (絶滅)
　　　　　※＝Pteraspida。
　　Order Astraspidiformes BERG 1940　星甲目 (絶滅)　※←Astraspida。
　　　Family Astraspididae　アストラスピス科 (絶滅)
　　　Family Obrucheviidae　オブルケウィア科 (絶滅)
　　Order Arandaspidiformes　アランダスピス目 (絶滅)
　　　Family Arandaspididae　アランダスピス科 (絶滅)
　　Order Eriptychiformes TARLO 1962　エリプティキウス目 (絶滅)
　　　　　※＝Eriptychiida ØRVIG 1958、Eriptychida STENSIÖ 1958。→Heterostraciformes。
　　　Family Eriptychiidae　エリプティキウス科 (絶滅)　※＝Eriptychiida。
　　　Family Tesseraspididae　テッセラスピス科 (絶滅)　※←Tesseraspidiformes。
　　Order Heterostraciformes　異甲目 (絶滅)　※＝Heterostraci Heterostraci POWRIE & LANKESTER 1868。
　　　Family Amphiaspididae　アムフィアスピス科 (絶滅)
　　　　　※＝Amphiaspidiformes BERG 1940、Amphiaspidida OBRUČHEV 1938。＋Olbiaspididae BROAD 1973。→Cyathaspididae。
　　　Family Anglaspididae　アングラスピス科 (絶滅)　※＝Anglaspidae。→Cyathaspididae。
　　　Family Ctenaspididae　クテナスピス科 (絶滅)
　　　　　※＝Ctenaspidae。→Cyathaspididae [Ctenaspinae DENISON 1953)]。亜目設定も（Ctenaspidida ZYCH 1931）。
　　　Family Cyathaspididae　キアタスピス科 (絶滅)
　　　　　※＝Cyathaspidae。＋Ariaspididae、Tolypaspididae KIÆR 1932。＋Diplaspididae KIÆR 1932。Cyathaspidiformes Berg 1940 (Cyathaspida KIÆR 1930))？
　　　Family Dinaspididae　ディナスピス科 (絶滅)　※＝Dinaspidae。→Cyathaspididae。
　　　Family Eglonaspididae　エグロナスピス科 (絶滅)　※→Amphiaspididae。
　　　Family Hibernaspididae　ヒベルナスピス科 (絶滅)　※→Amphiaspididae。
　　　Family Irregulareaspididae　イルレグラレアスピス科 (絶滅)　※→Cyathaspididae。
　　　Family Oniscolepididae　オニスコレピス科 (絶滅)　※Tesseraspididaeより分離独立。→Tolypelepididae。
　　　Family Poraspididae　ポラスピス科 (絶滅)
　　　　　※＝Poraspidae。亜目設定も（Poraspidida TARLO 1962）。
　　　Family Siberiaspididae　シベリアスピス科 (絶滅)　※→Amphiaspididae。
　　　Family Tolypelepididae　トリペレピス科 (絶滅)
　　　　　※Sub-Family Tolypelepidinae DENISON 1964。＋Oniscolepidae、＋Tolypaspididae KIÆR 1932。→Cyathaspididae？
　　Order Pteraspidiformes BERG 1940　翼甲目 (絶滅)
　　　　　※＝Pteraspidomorphi GOODRICH 1909。＋Psammosteiformes BERG 1940（Drepanaspida STENSIÖ 1958）。
　　　Family Anchipteraspididae　アンキプテラスピス科 (絶滅)
　　　Family Cardipeltididae　カルディペルティス科 (絶滅)
　　　Family Corvaspididae　コルウァスピス科 (絶滅)
　　　　　※＝Corvaspida STENSIÖ 1958。＋Lepidaspididae。→Psammosteidae。
　　　Family Guerichosteidae　グエリコステウス科 (絶滅)　※→Psammosteidae。
　　　Family Larnovaspididae　ラルノウァスピス科 (絶滅)　※→Pteraspididae。
　　　Family Natlaspididae　ナトラスピス科 (絶滅)
　　　Family Podolaspididae　ポドラスピス科 (絶滅)　※→Pteraspididae。
　　　Family Protaspididae　プロタスピス科 (絶滅)
　　　Family Protopteraspididae　プロトプテラスピス科 (絶滅)
　　　　　※＋Doryaspididae、Doryaspidida HEINTZ 1967。
　　　Family Psammolepididae　プサムモレピス科 (絶滅)　※→Psammosteidae。
　　　Family Psammosteidae　プサムモステウス科 (絶滅)
　　　　　※＋Amphiaspidae、Aspidosteidae BERG 1955、Drepanaspididae TRAQUAIR 1899、Obručheviidae、Siberiaspidae。亜目設定も（Psammosteida KIÆR 1932）。
　　　Family Pteraspididae　プテラスピス科 (絶滅)　※亜目設定も（Pteraspidida KIÆR 1932）。
　　　Family Pycnosteidae　ピクノステウス科 (絶滅)　※→Psammosteidae。
　　　Family Rhinopteraspididae　リノプテラスピス科 (絶滅)
　　　Family uncertain
　　　　Genus Pavloaspis VOICHYSHYN 1999　パウロアスピス属 (絶滅)
　　　　　Pavloaspis pasternaki Voichyshyn 1998 (絶滅)
　　Order Tesakoviaspidiformes　テサコウィアスピス目 (絶滅)　※＝Tesakoviaspidida KARATAJŪTĖ-TALIMAA & SMITH 2004。
　　　Family Tesakoviaspididae　テサコウィアスピス科 (絶滅)
　　Order Traquairaspidiformes TARLO 1962　トラクアイアスピス目 (絶滅)
　　　　　※＋Phialaspiformes BERG 1955,＝Traquairaspida STENSIÖ 1958。＋Weigeltaspididae。
　　　Family Phialaspididae　フィアラスピス科 (絶滅)
　　　Family Traquairaspididae　トラクアイラスピス科 (絶滅)
　　Order uncertain
　　　　Genus Anatolepis BROCKELIE & FORTEY 1976　アナトレピス属 (絶滅)　※カンブリア紀〜オルドビス紀。
　　　　　Anatolepis heintzi Brockelie & Fortey 1976 (絶滅)　※学名はノルウェーの古生物学者Anatol Heintzより。
　　　　Genus Athenaegis SOEHN & WILSON 1990　アテナエギス属 (絶滅)
　　　　　Athenaegis chattertoni Soehn & Wilson 1990 (絶滅)
　CLASS THELODONTI JAEKEL 1911　テロドゥス綱 (絶滅)
　　Order Archipelepidiformes WILSON & MÄRSS 2009 (絶滅)
　　　Family Archipelepididae　アルキペレピス科 (絶滅)
　　　Family Boothialepididae　ボオティアレピス科 (絶滅)
　　Order Furcacaudiformes WILSON & CALDWELL 1998　フルカカウダ目 (絶滅)
　　　Family Apalolepididae　アパロレピス科 (絶滅)
　　　Family Barlowodidae　バルロウォドゥス科 (絶滅)
　　　Family Drepanolepididae　ドレパノレピス科 (絶滅)
　　　Family Furcacaudidae　フルカカウダ科 (絶滅)
　　　Family Lanarkiidae　ラナルキア科 (絶滅)
　　　Family Nikoliviidae　ニコリウィア科 (絶滅)
　　　Family Pezopallichthyidae　ペゾパルリクティス科 (絶滅)
　　Order Loganelliiformes TURNER 1991　ロガネルリア目 (絶滅)
　　　Family Loganelliidae　ロガネルリア科 (絶滅)
　　　　　※＝Loganiidae。＋Angaralepididae、Sandiviidae、Stroinolepididae、Sandiviiformes。
　　　Family Nunavutiidae　ヌナウティア科 (絶滅)
　　Order Shieliiformes MÄRSS, WILSON & THORSTEINSSON 2002　シエリア目 (絶滅)　※→Loganelliidae。
　　　Family Shieliidae　シエリア科 (絶滅)　※＋Eestilepididae。
　　Order Phlebolepidiformes BERG 1937　フェレボレピス目 (絶滅)　※＋Katoporida KARATAJŪTĖ-TALIMAA 1978。
　　　Family Katoporodidae　カトポロドゥス科 (絶滅)　※＋Katoporidae。
　　　Family Helenolepididae　ヘレノレピス科 (絶滅)　※＋Katoporidae。
　　　Family Phlebolepididae　フレボレピス科 (絶滅)
　　Order Thelodontiformes　テロドゥス目 (絶滅)　※＝Thelodonti、ThelodontidaKIÆR 1932。＋COELOLEPIDIFORMES。
　　　Family Coelolepididae　コエロレピス科 (絶滅)
　　　Family Longodidae　ロンゴドゥス科 (絶滅)　※＝Longodidae。
　　　Family Talivaliidae　タリウァリア科 (絶滅)
　　　Family Thelodontidae　テロドゥス科 (絶滅)
　　　Family Turiniidae　トゥリニア科 (絶滅)
　　　Family uncertain
　　　　Genus Thulolepis BLOM 1999　トゥロレピス属 (絶滅)
　　　　　Thulolepis striaspina Blom 1999 (絶滅)
SUPER-CLASS PLACODERMI MCCOY 1848 板皮上綱 (絶滅)
　　　　　※以下全て（哺乳類まで）Vertebrata（脊椎動物）。以下Sub-Phylum Gnathostomata GEGENBAUR 1877。
　ORDER ACANTHOTHORACIFORMES　棘胸目 (絶滅) ＝Acanthothoraci STENSIÖ 1944。
　　　Family Brindabellaspididae　ブリンダベルラスピス科 (絶滅)
　　　　　※＝Brindabellaspidida、→Brindabellaspidiformes。→Rhenanidiformes？
　　　Family Palaeacanthaspididae　パラエアカンタスピス科 (絶滅)
　　　Family Weejasperaspididae　ウェエヤスペラスピス科 (絶滅)
　　　Family Wuttagoonaspididae　ウッタゴオナスピス属 (絶滅)　※Weejasperaspididaeより分離独立。
　　　Family uncertain
　　　　Genus Arabosteus OLIVE, GOUJET, LELÌEVRE & JANJOU 2011　アラボステウス属 (絶滅)
　　　　　Arabosteus variabilis Olive, Goujet, Lelìevre & Janjou 2011 (絶滅)
　　　　Genus Hagiangella RACHEBOEUF, JANVIER, PHUONG, VANNIER & SHANG-QI 2005　ハギアンゲルラ属 (絶滅)
　　　　　Hagiangella goujeti Racheboeuf, Janvier, Phuong, Vannier & Shang-Qi 2005 (絶滅)
　　　　Genus Xiejiawanaspis BRROW, TURNER & WANG 2000　キシエイアワナスピス属 (絶滅)
　　　　　Xiejiawanaspis pinus Brrow, Turner & Wang 2000 (絶滅)
　ORDER ANTIARCHIFORMES　胴甲目 (絶滅)
　　　　　　※＝ANTIARCHA COPE 1885、EUANTIARCHA JANVIER & PAN 1982、反肛類。
　　Sub-Order Bothriolepidoidei COPE 1886　ボトリオレピス亜目 (絶滅)
　　　Family Bothriolepididae　ボトリオレピス科 (絶滅)　※＋Tubalepididae。
　　　Family Dianolepididae　ディアノレピス科 (絶滅)
　　　Family Jiangxilepididae　イアングキシレピス科 (絶滅)
　　　Family Microbrachiidae　ミクロブランキウス科 (絶滅)
　　　Family Tubalepididae　トゥバレピス科 (絶滅)
　　　Family Wudinolepididae　ウディノレピス科 (絶滅)
　　Sub-Order Yunnanolepidoidei ZHANG 1978　ユンナノレピス亜目 (絶滅)　※＝Yunnanolepidoidea MILES 1968。
　　　Family Asterolepididae　アステロレピス科 (絶滅)
　　　Family Chuchinolepididae　クキノレピス科 (絶滅)　※＋Procondylolepididae、Procondylolepidiformes。
　　　Family Minicraniidae　ミニクラニア科 (絶滅)
　　　Family Pentathyraspididae　ペンタティラスピス科 (絶滅)
　　　Family Pterichthyodidae　プテリクティオデス科 (絶滅)
　　　Family Remigolepididae　レミゴレピス科 (絶滅)
　　　Family Sinolepididae　シノレピス科 (絶滅)　※＝Sinolepidoidei LONG 1983。
　　　Family Yunnanolepididae　ユンナノレピス科 (絶滅)　※＋Pentathyraspididae。
　　　Family uncertain
　　　　Genus Hyrcanaspis JANVIER & PAN 1982　ヒルカナスピス属 (絶滅)
　　　　　Hyrcanaspis bliecki Janvier & Pan 1982 (絶滅)
　ORDER ARTHRODIRIFORMES　節頸目 (絶滅) ＝Arthrodira WOODWARD 1891。
　　Sub-Order Actinolepidoidei MILES 1973　アクティノレピス亜目 (絶滅)
　　　Family Actinolepididae　アクティノレピス科 (絶滅)
　　　Family Kujdanowiaspididae　クユダノウィアスピス科 (絶滅)　※＝Kujdanowiaspidoidea BERG 1955。
　　　Family Mediaspididae　メディアスピス科 (絶滅)
　　　Family uncertain
　　　　Genus Edgellaspis HUNT & YOUNG 2010　エドゲレラスピス属 (絶滅)
　　　　　Edgellaspis gorteri Hunt & Young 2010 (絶滅)
　　Sub-Order Brachythoraci GROß 1932 (絶滅)
　　　Super-Family Brachydeiroidea DENISON 1975　ブラキデイルス上科 (絶滅)　※ Coccosteoidea より分離独立。
　　　　Family Brachydeiridae　ブラキデイルス科 (絶滅)　※＋Leptosteidae、Oxyosteidae、Synaucheniidae。
　　　Super-Family Buchanosteoidea　ブカノステウス上科 (絶滅)
　　　　Family Buchanosteidae　ブカノステウス科 (絶滅)　※＋Goodradigbeeonidae。
　　　　Family Homostiidae　ホモスティウス科 (絶滅)　※＝Homosteidae JAEKEL 1903。＋Euleptaspididae OBRUČHEV 1969。
　　　　Family Taemasosteidae　タエマソステウス科 (絶滅)
　　　Super-Family Coccosteoidea　コッコステウス上科 (絶滅)
　　　　Family Camuropiscidae　カムロピスキス科 (絶滅)
　　　　Family Coccosteidae　コッコステウス科 (絶滅)
　　　　Family Incisoscutidae　インキソスクトゥム科 (絶滅)　※→Phyllolepididae？
　　　　Family Pholidosteidae　フォリドステウス科 (絶滅)
　　　　Family Plourdosteidae　プロウロドステウス科 (絶滅)　※上科 Dunkleosteidea を立て、そちらへに移動させる意見あり。
　　　　Family Torosteidae　トロステウス科 (絶滅)
　　　Super-Family Dinichthyloidea VÉZINA 1990　ディニクティス上科 (絶滅)
　　　　Family Dinichthyidae　ディニクティス科 (絶滅)
　　　Super-Family Dunkleosteoidea　ドゥンクレオステウス上科 (絶滅)　※＝Pachyosteomorphi STENSIÖ 1944。
　　　　Family Bungartiidae　ブンガルティウス科 (絶滅)
　　　　Family Dunkleosteidae　ドゥンクレオステウス科 (絶滅)
　　　　Family Hadrosteidae　ハドロステウス科 (絶滅)　※→Dunkleosteidae。
　　　　Family Leiosteidae　レイオステウス科 (絶滅)
　　　　Family Mylostomatidae　ミロストマ科 (絶滅)
　　　　Family Pachyosteidae　パキオステウス科 (絶滅)
　　　　Family Panxiosteidae　パンクシオステウス科 (絶滅)　※→Dunkleosteidae。
　　　　Family Rhachiosteidae　ラキオステウス科 (絶滅)
　　　　Family Selenosteidae　セレノステウス科 (絶滅)　※＋Braunosteidae STENSIÖ 1959、Rhinosteidae STENSIÖ 1963。
　　　　Family Titanichthyidae　ティタニクティス科 (絶滅)
　　　　Family Trematosteidae　トレマトステウス科 (絶滅)
　　　Super-Family Gemuendenaspidoidea　ゲムエンデナスピス上科 (絶滅)　※→Buchanosteoidea。
　　　　Family Gemuendenaspididae　ゲムエンデナスピス科 (絶滅)
　　　Super-Family uncertain
　　　　Family Heterostiidae　ヘテロスティウス科 (絶滅)　※＝Heterosteidae。
　　　　Family uncertain
　　　　　Genus Confractamnis YOUNG 2005　コンフラクタムニス属 (絶滅)
　　　　　　Confractamnis johnjelli Young 2005 (絶滅)
　　Sub-Order Phlyctaenioidei MILES 1973　フリクタエニウス上科 (絶滅)　※＋Phlyctaenii MILES 1973。
　　　Family Antarctaspididae　アンタルクタスピス科 (絶滅)
　　　Family Arctaspididae　アルクタスピス科 (絶滅)
　　　Family Arctolepididae　アルクトレピス科 (絶滅)
　　　Family Groenlandaspididae　グロエンランダスピス科 (絶滅)
　　　Family Holonematidae　ホロネマ科 (絶滅)
　　　Family Phlyctaeniidae　フリクタエニウス科 (絶滅)　※＋Monaspididae HEINTZ 1929。
　　　Family Williamsaspididae　ウィルリアムサスピス科 (絶滅)
　　Sub-Order uncertain
　　　　Genus Alienacanthus KULCZYCKI 1957　アリエナカントゥス属 (絶滅)
　　　　　Alienacanthus malkowskii Kulczycki 1957 (絶滅)
　　　　Genus Antarctolepis WHITE 1968　アンタルクトレピス属 (絶滅)
　　　　　Antarctolepis gunni White 1968 (絶滅)
　　　　Genus Callognathus NEWBERRY 1889　カルログナトゥス属 (絶滅)
　　　　　Callognathus regularis Newberry 1889 (絶滅)
　　　　　Callognathus serratus Newberry 1889 (絶滅)
　　　　Genus Carolowilhelmina CARLS 1995　カロロウィルヘルミナ属 (絶滅)　※吻端突出。
　　　　　Carolowilhelmina geognostica Carls 1995 (絶滅)
　　　　Genus Cosmacanthus AGASSIZ 1845　コスマカントゥス属 (絶滅)
　　　　　Cosmacanthus bullatus (Saint John & Worthen 1875) (絶滅)
　　　　　　　syn.Geisacanthus bullatus Saint John & Worthen 1875
　　　　　Cosmacanthus humboldtensis Davidson 1919 (絶滅)
　　　　　Cosmacanthus malcolmsoni Agassiz 1845 non Denison 1979 (絶滅)
　　　　　　　※Genus Gyracanthus [Climatiidae, Acanthodii] にデニソンが記載した同名のシノニムがある。
　　　　　Cosmacanthus stellatus (Saint John & Worthen 1875) (絶滅)
　　　　　　　syn.Geisacanthus stellatus Saint John & Worthen 1875
　　　　Genus Dentognathus HLAVIN 1976　デントグナトゥス属 (絶滅)
　　　　　Dentognathus curvatus Hlavin 1976 (絶滅)
　　　　Genus Oestophorus MILLER 1892　オエストフォルス属 (絶滅)
　　　　　Oestophorus lilleyi (Newberry 1889) (絶滅)
　　　　　　　syn.Sphenophorus lilleyi Newberry 1889
　　　　Genus Overtonaspis WHITE 1961　オウェルトナスピス属 (絶滅)
　　　　　Overtonaspis billballi White 1961 (絶滅)
　　　　Genus Pinguosteus LONG 1990　ピングオステウス属 (絶滅)
　　　　　Pinguosteus thulborni Long 1990 (絶滅)
　　　　Genus Sentacanthus KULCZYCKI 1957　センタカントゥス属 (絶滅)
　　　　　Sentacanthus zelichowskae Kulczycki 1957 (絶滅)
　ORDER MACROPETALICHTHYIFORMES　マクロペタリクティス目 (絶滅)　※＝PETALICHTHYIDA JAEKEL 1911、Petalichthyiformes。
　　　Family Macropetalichthyidae　マクロペタリクティス科 (絶滅)　※＝Petalichthyidae。＝Quasipetalichthyidae。
　ORDER PHYLLOLEPIDIFORMES　フィルロレピス目 (絶滅)　※(＝Phyllolepida STENSIÖ 1934)。
　　　Family Gavinaspididae　ガウィナスピス科 (絶滅)
　　　Family Phyllolepididae　フィルロレピス科 (絶滅)
　ORDER PSEUDOPETALICHTHYIFORMES　プセウドペタリクティス目　(絶滅)　※(＝PSEUDOPETALICHTHYIDA)。
　　　Family Paraplesiobatidae　パラプレシオバティス科 (絶滅)　※＋Pseudopetalichthyidae。
　ORDER PTYCTODNTIFORMES　プティクトドゥス目 (絶滅)　※＝PTYCTODONTIDA GROß, I932。
　　　Family Ptyctodontidae　プティクトドゥス科 (絶滅)
　ORDER RHENANIFORMES　レナヌス目 (絶滅)　※＝RHENANIDA。
　　　Family Asterosteidae　アステロステウス科 (絶滅)
　　　Family uncertain
　　　　Genus Bolivosteus GOUJET, JANVIER & SUAREZ 1986　ボリウォステウス属 (絶滅)
　　　　　Bolivosteus chacomensis Goujet, Janvier & Suarez 1986 (絶滅)
　　　　Genus Ohioaspis WELLS 1944　オヒオアスピス属 (絶滅)
　　　　　Ohioaspis clavula (Wells 1944) (絶滅)
　　　　　　　syn.Ohioaspis tumulosa clavula Wells 1944
　　　　　Ohioaspis imposita Wells 1944 (絶滅)
　　　　　Ohioaspis lamellata Wells 1944 (絶滅)
　　　　　Ohiolepis newberryi Wells 1944 (絶滅)
　　　　　Ohiolepis stewartae Wells 1944 (絶滅)
　　　　　Ohioaspis tumulosa Wells 1944 (絶滅)
　　　　　　Ohioaspis tumulosa hystricosa Wells 1944 (絶滅)
　　　　　　Ohioaspis tumulosa turrita Wells 1944 (絶滅)
　　　　　　Ohioaspis tumulosa typica Wells 1944 (絶滅)
　ORDER STENSIOELLIFORMES GOUJET & YOUNG 2004　ステンシオエルラ目　(絶滅)　※＝STENSIOELLIDA。
　　　Family uncertain
　　　　Genus Stensioella BROILI 1933　ステンシオエルラ属 (絶滅)　※Stensioellidae？
　　　　　Stensioella heintzi Broili 1933 (絶滅)
　　　　Genus Sedowichthys BYSTROW 1957　セドウィクティス属 (絶滅)
　　　　　Sedowichthys terrae-boreae Bystrow 1957 (絶滅)
　ORDER UNCERTAIN
　　　Family uncertain
　　　　Genus Asiacanthus LIU 1948　アシアカントゥス属 (絶滅)
　　　　　Asiacanthus kaoi Pan 1964 (絶滅)
　　　　　Asiacanthus multituberculatus Liu 1948 (絶滅)
　　　　　Asiacanthus suni Pan 1964 (絶滅)
　　　　Genus Holopetalichthys VON KÖNEN 1895　ホロペタリクティス属 (絶滅)
　　　　　Holopetalichthys novaki von Könen 1895 (絶滅)
　　　　Genus Huaningichthys WANG & WANG 1999 　フアニンギクティス属 (絶滅)
　　　　　Huaningichthys omalodes Wang & Wang 1999 (絶滅)
　　　　Genus Hybosteus GROß 1933　ヒボステウス属 (絶滅)
　　　　　Hybosteus mirabilis (Groß 1930) (絶滅)
　　　　　　　syn.Coelosteus mirabilis Groß 1930　※属名は軟骨魚類。
　　　　Genus Platyaspis VON KÖNEN 1895　プラティアスピス属 (絶滅)
　　　　　Platyaspis tenuis von Könen 1895 (絶滅)
　　　　Genus Yunnanacanthus LIU 1973　ユンナナカントゥス属 (絶滅)
　　　　　Yunnanacanthus cuifengshanensis Liu 1973 (絶滅)
SUPER-CLASS GNATHOSTOMATA GEGENBAUR 1877 顎口上綱
　CLASS CHONDRICHTHYES HUXLEY 1880 軟骨魚綱　※＋Hypnosqualea。
　　SUB-CLASS HOLOCEPHALI BONAPARTE 1832 全頭亜綱　※＋Euchondrocephali。
　　　SERIES HOLOCEPHALIMORPHA　銀鮫系　※＝Bradyodonti。
　　　　ORDER CHIMAERIFORMES BUEN 1926　ギンザメ目
　　　　　Sub-Order Chimaeroidei PATTERSON 1965　ギンザメ亜目
　　　　　　Family Callorhinchidae　ゾウギンザメ科
　　　　　　Family Chimaeridae　ギンザメ科
　　　　　　Family Deltoptychiidae　デルトプティキウス科 (絶滅)　※→Menaspididae？
　　　　　　Family Edaphodontidae　エダフォドン科 (絶滅)　※Callorhynchidaeより分離独立。
　　　　　　Family Rhinochimaeridae　テングギンザメ科
　　　　　Sub-Order Echinochimaeroidei　アメリカムカシギンザメ亜目 (絶滅)
　　　　　　Family Echinochimaeridae　アメリカムカシギンザメ科 (絶滅)
　　　　　Sub-Order Myriacanthoidei　ミリアカントゥス亜目 (絶滅)　※＝Myriacanthoidea。
　　　　　　Family Acanthorhinidae　アカントリナ科 (絶滅)
　　　　　　Family Chimaeropsididae　キマエロプシス科 (絶滅)　※＝Chimaeropsidae。
　　　　　　Family Myriacanthidae　ミリアカントゥス科 (絶滅)　※＋Acanthorhinidae。
　　　　　Sub-Order Squalorajoidei　スクアロラヤ亜目 (絶滅)
　　　　　　Family Squalorajidae　スクアロラヤ科 (絶滅)
　　　　　Sub-Order uncertain
　　　　　　Genus Crookallia　クロオカルリア属 (絶滅)　※卵殻より。
　　　　　　Genus Vetacapsula MACKIE 1867　ウェタカプスラ属 (絶滅)　※卵殻より。
　　　　　　　Vetacapsula cooperi Mackie 1867 (絶滅)
　　　　　　　Vetacapsula johnsoni (Kidston 1885) (絶滅)
　　　　　　　　　syn.Palaeoxyris johnsoni Kidston 1885
　　　　ORDER CHONDRENCHELYIFORMES PATTERSON 1965　コンドレンケリス目 (絶滅)
　　　　　　Family Chondrenchelyidae　コンドレンケリス科 (絶滅)　※＋Traquairiidae。
　　　　　　Family Gregoriidae　グレゴリウス科 (絶滅)
　　　　ORDER COCHLIODONTIFORMES OBRUČHEV 1953　コクリオドゥス目 (絶滅)
　　　　　　Family Cochliodontidae　コクリオドゥス科 (絶滅)　※＋Psephodontidae。
　　　　　　Family Psephodontidae　プセフォドゥス科 (絶滅)
　　　　ORDER COPODONTIFORMES　コポドゥス目 (絶滅)
　　　　　　Family Copodontidae　コポドゥス科 (絶滅)
　　　　ORDER DEBEERIIFORMES　デベエリウス目 (絶滅)　※→INIOPTERYGIFORMES。
　　　　　　Family Debeeriidae　デベエリウス科 (絶滅)
　　　　ORDER HELODONTIFORMES PATTERSON 1965　ヘロドゥス目 (絶滅)
　　　　　　Family Helodontidae　ヘロドゥス科 (絶滅)
　　　　ORDER INIOPTERYGIFORMES　イニオプテリックス目 (絶滅)　※＝INIOPTERYGIA ZANGERL & CASE 1973。
　　　　　　Family Iniopterygidae　イニオプテリックス科 (絶滅)
　　　　　　Family Sibyrhynchidae　シビリンクス科 (絶滅)
　　　　ORDER MENASPIDIFORMES　メナスピス目 (絶滅)
　　　　　　Family Menaspididae　メナスピス科 (絶滅)　※＝Menaspidae。
　　　　　　Family Traquairiidae　トラクアイリウス科 (絶滅)
　　　　ORDER PETALODONTIFORMES　ペタロドゥス目 (絶滅)
　　　　　　Family Belantseidae　ベラントセア科 (絶滅)
　　　　　　Family Janassidae　ヤナッサ科 (絶滅)　※＝Janassiformes。→Petalodontidae？
　　　　　　Family Peripristididae　ペリプリスティス科 (絶滅)　※→Petalodontidae。
　　　　　　Family Petalodontidae　ペタロドゥス科 (絶滅)
　　　　　　Family Pristodontidae　プリストドゥス科 (絶滅)
　　　　ORDER PSAMMODONTIFORMES　プサムモドゥス目 (絶滅)
　　　　　　Family Lagarodontidae　プサムモドゥス科 (絶滅)
　　　　　　Family Psammodontidae　プサムモドゥス科 (絶滅)
　　　　Order uncertain
　　　　　　　Genus Pilolepis THORSTEINSSON 1973　ピロレピス属 (絶滅)
　　　　　　　　Pilolepis margaritifera Thorsteinsson 1973 (絶滅)
　　　　　　　Genus Pucapampella JANVIER & SUAREZ-RIGLOS 1986　プカパムペルラ属 (絶滅)
　　　　　　　　Pucapampella rodrigae Janvier & Suarez-Riglos 1986 (絶滅)
　　　SERIES PARASELACHIMORPHA　パラセラケ(真性鮫類近似)系 (絶滅)　※→Holocephalimorpha？
　　　　ORDER DESMIODONTIFORMES　デスミオドゥス目 (絶滅)
　　　　　　Family Desmiodontidae　デスミオドゥス科 (絶滅)　※＝Desmiodontida。
　　　　ORDER EUGENEODONTIFORMES　エウゲネオドゥス目 (絶滅)　※＝Eugeneodontida ZANGERL 1981、＋EDESTIFORMES。
　　　　　Super-Family Caseodontoidea ZANGERL 1981　カセオドゥス上科 (絶滅)
　　　　　　Family Caseodontidae　カセオドゥス科 (絶滅)
　　　　　Super-Family Edestoidea　エデストゥス上科 (絶滅)
　　　　　　Family Agassizodontidae　アガッシゾドゥス科 (絶滅)
　　　　　　Family Edestidae　エデストゥス科 (絶滅)
　　　　　　Family Helicopriidae　ヘリコプリオン科 (絶滅)　※＝Helicoprionidae。→AGASSIZODONTIDAE。
　　　　　Super-Family Eugeneodontoidea　エウゲネオドゥス上科
　　　　　　Family Eugeneodontidae　エウゲネオドゥス科 (絶滅)
　　　　ORDER ORODONTIFORMES　オロドゥス目 (絶滅)
　　　　　　Family Leiodontidae　レイオドゥス科 (絶滅)
　　　　　　Family Orodontidae　オロドゥス科 (絶滅)
　　　　ORDER SQUATINACTIFORMES ZANGERL 1981　スクアティナクティス目 (絶滅)　※＝Squatinactida。
　　　　　　Family Squatinactidae　スクアティナクティス科 (絶滅)
　　　SERIES uncertain
　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　Genus Cynopodius TRAQUAIR 1881　キノポディウス属 (絶滅)
　　　　　　　　Cynopodius crenulatus Traquair 1881 (絶滅)
　　SUB-CLASS ELASMOBRANCIHII Bonaparte 1838 板鰓亜綱　※＝Selachii RICHARDSON 1836。＋Euselachii HAY 1902、Neoselachii COMPAGNO 1977。
　　　SUPER-ORDER BATOIDEA CAPPETTA 1980 sensu NELSON 2006 エイ上目
　　　　　　　※＋Pristiorajea Carvalho 1996。＝Batomorphii CAPPETTA 1980。SQUALEAから分離独立。
　　　　ORDER RAJIFORMES BERG 1940 ガンギエイ目
　　　　　SUB-ORDER PRISTIDOIDEI ノコギリエイ亜目
　　　　　　　※Order Pristiformes sensu MCEACHRAN & ASCHILIMAN 2004 に格上げする意見もある。
　　　　　　Family Pristididae ノコギリエイ科　※＝Pristidae。CITES APPENDIX I１種除く。
　　　　　SUB-ORDER RAJOIDEI エイ亜目
　　　　　　Super-Family Myliobatidoidea トビエイ上科　※MYLIOBATIDIFORMES COMPAGNO 1973 に格上げする意見もある。
　　　　　　　Family Anacanthobatidae ホコカスベ科・"イトヒキエイ科"
　　　　　　　Family Dasyatididae アカエイ科　※＝Dasyatidae。＋Hypolophidae。
　　　　　　　Family Distobatidae　ディストバトゥス科 (絶滅)　※Dasyatidaeより分離独立。
　　　　　　　Family Gymnuridae ツバクロエイ科
　　　　　　　Family Hexatrygonidae ムツエラエイ科
　　　　　　　Family Myliobatididae トビエイ科　※＝Myliobatidae BONAPARTE 1838。
　　　　　　　　Sub-Family Mobulinae　イトマキエイ亜科　※←Mobulidae。
　　　　　　　　Sub-Family Myliobatidinae　トビエイ亜科
　　　　　　　　Sub-Family Rhinopterinae　ウシバナトビエイ亜科　※←Rhinopteridae。
　　　　　　　Family Plesiobatididae ウスエイ科　※Urotrygonidaeへの編入が検討される。
　　　　　　　Family Potamotrygonidae アマゾンタンスイエイ科
　　　　　　　Family Rhombodontidae　ロムボドゥス科 (絶滅)
　　　　　　　Family Urolophidae ヒラタエイ科　※本科は英名stingaree。
　　　　　　　Family Urotrygonidae　ウロトリゴン科
　　　　　　　Family Zygzabatididae　ジグザバティス科 (絶滅)　※＝Zygzabatidae MENDIOLA 1999。MYLIOBATIDAEより分離独立。
　　　　　　Super-Family Rajoidea ガンギエイ上科
　　　　　　　Family Cyclobatididae　キクロバティス科 (絶滅)　※＝Cyclobatidae CAPETTA 1980。
　　　　　　　Family Rajidae　ガンギエイ科
　　　　　SUB-ORDER RHINOBATOIDEI サカタザメ亜目　※目（RHINOBATIFORMES）に格上げする意見もある。
　　　　　　　Family Archaeobatididae　アルカエオバティス科 (絶滅)　※＝Archaeobatidae。
　　　　　　　Family Hypsobatididae　ヒプソバティス科 (絶滅)　※＝Hypsobatidae。
　　　　　　　Family Parapaleobatidae　パラパレオバテス科 (絶滅)
　　　　　　　Family Rhinobatidae　サカタザメ科
　　　　　　　　Sub-Family Platyrhininae　ウチワザメ亜科　※←Platyrhinidae。
　　　　　　　　Sub-Family Rhininae　シノノメサカタザメ亜科　※←Rhinidae。
　　　　　　　　Sub-Family Rhinobatinae　サカタザメ亜科
　　　　　　　　Sub-Family Rhynchobatinae　トンガリサカタザメ亜科　※←Rhynchobatidae。
　　　　　　　　Sub-Family Spathobatidinae　スパトバティス亜科
　　　　　SUB-ORDER PROTOSPINACHIOIDEI プロトスピナックス亜目 (絶滅)　※←Protospinaciformes。→Sclerorhynchoidei CAPPETTA 1980。
　　　　　　Family Protospinacidae　プロトスピナックス科 (絶滅)
　　　　　SUB-ORDER SCLERORHYNCHOIDEI CAPPETTA 1980 スクレロリンクス亜目 (絶滅)　※←Sclerorhynchiformes KRIWET 2004。
　　　　　　Family Ptychotrygonidae　プティコトリゴン科 (絶滅)
　　　　　　Family Sclerorhynchidae　スクレロリンクス科 (絶滅)
　　　　　SUB-ORDER uncertain
　　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　　Genus Agaleorhynchus GUINOT, CAPPETTA, UNDERWOOD & WARD 2012　アガレオリンクス属 (絶滅)
　　　　　　　　　Agaleorhynchus britannicus Guinot, Cappetta, Underwood & Ward 2012 (絶滅)
　　　　　　　　Genus Argoubia ADNET, CAPPETTA, GUINOT & DI SCIARA 2012　アルゴウビア属 (絶滅)
　　　　　　　　　Argoubia barbei Adnet, Cappetta, Guinot & di Sciara 2012 (絶滅)
　　　　　　　　Genus Cretaplatyrhinoidis GUINOT, CAPPETTA, UNDERWOOD & WARD 2012　クレタプラティリノイディス属 (絶滅)
　　　　　　　　　Cretaplatyrhinoidis ornata Guinot, Cappetta, Underwood & Ward 2012 (絶滅)
　　　　　　　　Genus Duwibatis CAPPETTA 1991　ドゥウィバティス属 (絶滅)
　　　　　　　　　Duwibatis problematica Cappetta 1991 (絶滅)
　　　　　　　　Genus Engolismaia VULLO, CAPPETTA & NÉRAUDEAU 2007　エンゴリスマイア属 (絶滅)
　　　　　　　　　Engolismaia couillardi Vullo, Cappetta & Néraudeau 2007 (絶滅)
　　　　　　　　Genus Erguitaia CAPPETTA 1989　エルグイタイア属 (絶滅)
　　　　　　　　　Erguitaia misrensis Cappetta 1991 (絶滅)
　　　　　　　　Genus Erythrobatis CAPPETTA 1991　エリトロバティス属 (絶滅)
　　　　　　　　　Erythrobatis cuspidata Cappetta 1991 (絶滅)
　　　　　　　　Genus Germanobatos MÜLLER & DIEDRICH 1991　ゲルマノバトゥス属 (絶滅)
　　　　　　　　　Germanobatos ornatus Müller & Diedrich 1991 (絶滅)
　　　　　　　　Genus Hamrabatis CAPPETTA 1991　ハムラバティス属 (絶滅)
　　　　　　　　　Hamrabatis ornata Cappetta 1991 (絶滅)
　　　　　　　　Genus Jurobatos THIES 1983　ユロバトス属 (絶滅)
　　　　　　　　　Jurobatos cappettai Thies 1983 (絶滅)
　　　　　　　　Genus Phosphatobatis CAPPETTA 1991　フォスファトバティス属 (絶滅)
　　　　　　　　　Phosphatobatis aegyptiaca Cappetta 1991 (絶滅)
　　　　　　　　Genus Pseudoplatyrhina GUINOT, CAPPETTA, UNDERWOOD & WARD 2012　プセウドプラティリナ属 (絶滅)
　　　　　　　　　Pseudoplatyrhina crispa Guinot, Cappetta, Underwood & Ward 2012 (絶滅)
　　　　　　　　Genus Safagaia CAPPETTA 1991　サファガイア属 (絶滅)
　　　　　　　　　Safagaia ptychodon Cappetta 1991 (絶滅)
　　　　　　　　Genus Tanoutia CAPPETTA & NOUBHANI 1995　タノウティア属 (絶滅)
　　　　　　　　　Tanoutia iminensis Cappetta & Noubhani 1995 (絶滅)
　　　　ORDER TORPEDINIFORMES シビレエイ目
　　　　　SUB-ORDER TORPEDOIDEI シビレエイ亜目
　　　　　　Super-Family Narcinoidea タイワンシビレエイ上科
　　　　　　　Family Narcinidae タイワンシビレエイ科
　　　　　　　Family Narkidae　シビレエイ科
　　　　　　Super-Family Torpedoidea ヤマトシビレエイ上科
　　　　　　　Family Hypnidae　豪州シビレエイ科
　　　　　　　Family Torpedinidae ヤマトシビレエイ科
　　　SUPER-ORDER GALEA SHIRAI 1996 ネズミザメ上目　※＝Galeomorphii COMPAGNO 1973。
　　　　ORDER ANTARCTILAMNIFORMES GINTER, LIAO & VALENZUELA-RIOS 2008 アンタルクティラムナ目 (絶滅)
　　　　　Family Antarctilamnidae アンタルクティラムナ科 (絶滅)
　　　　　Family Coronodontidae　コロノドゥス科 (絶滅)　※←Coronodontiformes、Coronodontida。←Phoebodontidae←Symmoriidae？
　　　　ORDER BRANSONELLIFORMES HAMPE & IVANOV 2007 ブランソネルラ目 (絶滅)
　　　　　Family uncertain
　　　　　　Genus Barbclabornia JOHNSON 2003　バルブクラボルニア属 (絶滅)
　　　　　　　Barbclabornia luedersensis Berman 1970) (絶滅)
　　　　　　　　　syn.Xenacanthus luedersensis Berman 1970
　　　　　　Genus Bransonella HARLTON 1933 　ブランソネルラ属 (絶滅)
　　　　　　　Bransonella lingulata Ivanov & Ginter 1996 (絶滅)
　　　　　　　Bransonella nebraskensis (Johnson 1984) (絶滅)
　　　　　　　　　syn.Xenacanthus nebraskensis Johnson 1984
　　　　　　　Bransonella tridentata Harlton 1933 (絶滅)
　　　　ORDER CARCHARHINIFORMES COMPAGNO 1973 メジロザメ目
　　　　　Family Carcharhinidae メジロザメ科　※＋Galeocerdidae、Triaenodonidae。
　　　　　Family Hemigaleidae　ヒレトガリザメ科
　　　　　Family Leptochariidae　レプトカリアス科
　　　　　Family Proscylliidae タイワンザメ科
　　　　　Family Pseudotriakidae チヒロザメ科（aka.オシザメ科）
　　　　　Family Scyliorhinidae トラザメ科
　　　　　Family Sphyrnidae シュモクザメ科
　　　　　Family Triakidae ドチザメ科
　　　　　　Sub-Family Galeorhininae　イコクエイラクブカ亜科　※←Galeorhinidae。
　　　　　　Sub-Family Triakinae　ドチザメ亜科
　　　　　Family uncertain
　　　　　　　Genus Corysodon SAINT-SEINE 1949　コリソドン属 (絶滅)
　　　　　　　　Corysodon cirinensis Saint-Seine 1949 (絶滅)
　　　　ORDER CLADOSELACHIFORMES クラドセラケ目 (絶滅)　※＝Cladoselachida DEAN 1894。
　　　　　Family Cladoselachidae　クラドセラケ科 (絶滅)
　　　　ORDER HETERODONTIFORMES BERG 1937 ネコザメ目　※＝Heterodontomorphi JACQUES & WAES 2012。
　　　　　Family Heterodontidae ネコザメ科
　　　　ORDER HYBODONTIFORMES MAISEY 1987　ヒボドゥス目 (絶滅)　※＝HYBODONTOIDEA ZANGERL 1981。
　　　　　Family Acrodontidae　アクロドゥス科 (絶滅)
　　　　　Family Hybodontidae　ヒボドゥス科 (絶滅)
　　　　　Family Lonchidiidae　ロンキディオン科 (絶滅)　※＝Lonchidionidae。
　　　　　Family Polyacrodontidae　ポリアクロドゥス科 (絶滅)
　　　　　Family Ptychodontidae　プティコドゥス科 (絶滅)
　　　　　Family Steinbachodontidae　ステインバコドゥス科 (絶滅)
　　　　　Family Wapitiodidae　ワピティオドゥス科 (絶滅)　※＋Homalodontidae。
　　　　　Family uncertain
　　　　　　Genus Cassisodus GINTER & SUN 2007　カッシソドゥス属 (絶滅)
　　　　　　　Cassisodus margaritae Ginter & Sun 2007 (絶滅)
　　　　　　Genus Changxingselache WANG, ZHU, JIN & WANG 2007　カングキシングセラケ属 (絶滅)
　　　　　　　Changxingselache wangi Wang, Zhu, Jin & Wang 2007 (絶滅)
　　　　　　Genus Gansuselache WANG, ZHANG, ZHU & ZHAO 2009　ガンスセラケ属 (絶滅)
　　　　　　　Gansuselache tungshengi Wang, Zhang, Zhu & Zhao 2009 (絶滅)
　　　　　　Genus Meishanselache WANG, ZHU, JIN & WANG 2007　メイサナセラケ属 (絶滅)
　　　　　　　Meishanselache liui Wang, Zhu, Jin & Wang 2007 (絶滅)
　　　　　　Genus Onychoselache DICK 1978　オニコセラケ属 (絶滅)　※→Ctenacanthiformes？
　　　　　　　Onychoselache traquairi Dick 1978 (絶滅)
　　　　　　Genus Rhomaleodus ANDREEV & CUNY 2012　ロマレオドゥス属 (絶滅)
　　　　　　　Rhomaleodus budurovi Andreev & Cuny 2012 (絶滅)
　　　　ORDER LAMNIFORMES BERG 1958 ネズミザメ目
　　　　　Family Alopiidae オナガザメ科
　　　　　Family Archaeolamnidae　アルカエオラムナ科 (絶滅)　※→Cretoxyrhinidae、＋Isuridae。HYBODONTIFORMES MAISEY 1987？
　　　　　Family Cardabiodontidae　カルダビオドン科 (絶滅)　※→Anacoracidae
　　　　　Family Cetorhinidae ウバザメ科
　　　　　Family Cretoxyrhinidae クレトキシリナ科 (絶滅)
　　　　　Family Eoptolamnidae エオプトラムナ科 (絶滅)
　　　　　Family Jaekelotodontidae ヤエケロトドゥス科 (絶滅)　※→ODONTASPIDIDAE MÜLLER & HENLE 1839。
　　　　　Family Lamnidae ネズミザメ科
　　　　　Family Megachasmatidae メガカスマ科　※＝Megachasmidae。
　　　　　Family Mitsukurinidae ミツクリザメ科　※＋Paranomotodontidae。
　　　　　Family Odontaspididae オオワニザメ科
　　　　　Family Otodontidae オトドゥス科 (絶滅)
　　　　　Family Pseudocarchariidae ミズワニ科
　　　　　Family Squalicoracidae　スクアリコラックス科 (絶滅)　※＝Anacoracidae CASIER 1947。
　　　　ORDER MONGOLEPIDIFORMES　モンゴレピス目 (絶滅)　※＝Mongolepidida KARATAJŪTĖ-TALIMAA 1998。最古の軟骨魚類。
　　　　　Family Mongolepididae モンゴレピス科 (絶滅)　※＋Polymerolepididae。
　　　　　Family Shiqianolepididae シクイアノレピス科 (絶滅)　※＝Shiqianolepidae。
　　　　　Family uncertain
　　　　　　Genus Elegestolepis KARATAJŪTĖ-TALIMAA 1973　エレゲストレピス属 (絶滅)　※シルル紀。
　　　　　　　Elegestolepis conica Karatajūtė-Talimaa 1986 (絶滅)
　　　　　　　Elegestolepis grossi Karatajūtė-Talimaa 1973 (絶滅)
　　　　　　Genus Polymerolepis KARATAJŪTĖ-TALIMAA 1977　ポリメロレピス属 (絶滅)　※Polymerolepididae。
　　　　　　　Polymerolepis whitei Karatajūtė-Talimaa 1977 (絶滅)
　　　　ORDER OMALODONTIFORMES オマロドゥス目 (絶滅)
　　　　　Family Aztecodontidae アズテコドゥス科 (絶滅)
　　　　　Family Omalodontidae オマロドゥス科 (絶滅)
　　　　ORDER ORECTOLOBIFORMES APPLEGATE 1972 オオセ目　※＝Orectolobomorphii HERMAN 2012。
　　　　　Family Brachaeluridae　ブラカエルルス科
　　　　　Family Ginglymostomatidae　コモリザメ科
　　　　　Family Hemiscylliidae　テンジクザメ科　※＋Scyllidae。
　　　　　Family Orectolobidae　オオセ科
　　　　　Family Parascylliidae　クラカケザメ科
　　　　　Family Rhincodontidae　ジンベエザメ科
　　　　　Family Stegostomatidae　トラフザメ科
　　　　　Family uncertain
　　　　　　Genus Akaimia REES 2010　アカイミア属 (絶滅)
　　　　　　　Akaimia altucuspis Rees 2010 (絶滅)
　　　　　　Genus Annea THIES 1983　アンネア属 (絶滅)
　　　　　　　Annea carinata Thies 1983 (絶滅)
　　　　　　　Annea maubeugei Delsate & Thies 1995 (絶滅)
　　　　　　Genus Columbusia CASE, SCHWIMMER, BORODIN & LEGGETT 2001　コルムブシア属 (絶滅)
　　　　　　　Columbusia fragilis Case, Schwimmer, Borodin & Leggett 2001 (絶滅)
　　　　　　Genus Cretascyllium MÜLLER & DIEDRICH 1991　クレタスキルリウム属 (絶滅)
　　　　　　　Cretascyllium expansum Müller & Diedrich 1991 (絶滅)
　　　　　　Genus Folipistrix KRIWET 2003　フォリピストリックス属 (絶滅)
　　　　　　　Folipistrix digitulus Kriwet 2003 (絶滅)
　　　　　　Genus Ornatoscyllium UNDERWOOD & WARD 2004　オルナトスキルリム属 (絶滅)
　　　　　　　Ornatoscyllium freemani Underwood & Ward 2004 (絶滅)
　　　　　　Genus Phorcynis THIOLLIÈRE 1852　フォルキニス属 (絶滅)
　　　　　　　Phorcynis catulina Thiollière 1852 (絶滅)
　　　　ORDER PHOEBODONTIFORMES GINTER, HAIRAPETIAN & KLUG 2002 フォエボドゥス目 (絶滅)　※→Symmoriiformes、Antarctilamniformes？
　　　　　Family Jalodontidae ヤロドゥス科 (絶滅)
　　　　　Family Phoebodontidae フォエボドゥス科 (絶滅)
　　　　　Family Thrinacodontidae　トリナコドゥス科 (絶滅)　※→Phoebodontidae WILLIAMS 1985。
　　　　ORDER SYNECHODONTIFORMES DUFFIN & WARD 1993　シネコドゥス目 (絶滅)　※Hybodontiformesより分離独立。
　　　　　Family Orthacodontidae　オルタコドゥス科 (絶滅)
　　　　　Family Palaeospinacidae　パラエオスピナックス科 (絶滅)
　　　　　Family Pseudonotidanidae　プセウドノティダヌス科 (絶滅)
　　　　　Family Synechodontidae　シネコドゥス科 (絶滅)
　　　　　Family Xenosynechodontidae　キセノシネコドゥス科 (絶滅)
　　　　　Family uncertain
　　　　　　Genus Rhomphaiodon DUFFIN 1993　ロムファイオドン属 (絶滅)
　　　　　　　Rhomphaiodon minor (Agassiz 1837) (絶滅)
　　　　　　　　　syn.Hybodonchus minor (Agassiz 1837)
　　　　　　　　　　　Hybodus minor Agassiz 1837
　　　　　　　Rhomphaiodon nicolensis Duffin 1993 (絶滅)
　　　　ORDER SYMMORIIFORMES ZANGERL 1981 シムモリウム目 (絶滅)　※＝SYMMORIIDA ZANGERL 1981。
　　　　　Family Denaeidae　デナエア科 (絶滅)　※→Symmoriidae。
　　　　　Family Falcatidae　ファルカトゥス科 (絶滅)
　　　　　Family Protacrodontidae　プロタクロドゥス科 (絶滅)　※→Tamiobatidae。
　　　　　Family Stethacanthidae　ステタカントゥス科 (絶滅)
　　　　　Family Symmoriidae シムモリウム科 (絶滅)
　　　　　Family Tamiobatidae　タミオバティス科 (絶滅)
　　　　　Family unknown
　　　　　　Genus Kawichthys PRADEL, TAFFOREAU, MAISEY & JANVIER 2011　カウィクティス属 (絶滅)
　　　　　　　Kawichthys moodiei Pradel, Tafforeau, Maisey & Janvier 2011 (絶滅)
　　　　ORDER XENACANTHIFORMES BERG 1940 古代淡水鮫目 (絶滅)　※＝XENACANTHIDA、Xenacanthimorpha。＋Protacrodontiformes。
　　　　　Family Diplodoselachidae　ディプロドセラケ科 (絶滅)
　　　　　Family Xenacanthidae キセナカントゥス科 (絶滅)　※＋Lebachacanthidae。
　　　　　Family uncertain
　　　　　　Genus Dittodus OWEN 1867　ディットドゥス属 (絶滅)　※→Phoebodontidae？Xenacanthidae？
　　　　　　　Dittodus compressus (Newberry 1856) (絶滅)
　　　　　　　　　syn.Diplodus compressus Newberry 1856
　　　　　　　　　　　Pleuracanthus compressus (Newberry 1856)
　　　　　　　　　　　Xenacanthus compressus (Newberry 1856)
　　　　　　　Dittodus gibbosus (Binney 1841) (絶滅)
　　　　　　　　　syn.Diplodus gibbosus Binney 1841
　　　　　　　Dittodus gracilis (Newberry 1856) (絶滅)
　　　　　　　　　syn.Diplodus gracilis Newberry 1856
　　　　　　　Dittodus latus (Newberry 1856) (絶滅)
　　　　　　　　　syn.Diplodus latus Newberry 1856
　　　　　　　Dittodus lucasi Hay 1900 (絶滅)
　　　　　　　Dittodus moorei (Woodward 1889) (絶滅)
　　　　　　　　　syn.Diplodus moorei Woodward 1889
　　　　　　　Dittodus parallelus Owen 1867 (絶滅)
　　　　　　　Dittodus penetrans (Dawson 1860) (絶滅)
　　　　　　　　　syn.Diplodus penetrans Dawson 1860
　　　　　　　Dittodus striatus (Eastman 1899) (絶滅)
　　　　　　　　　syn.Diplodus striatus Eastman 1899
　　　　ORDER UNCERTAIN
　　　　　Family Agaleidae　アガレウス科 (絶滅)　※LamniformesともOrectolobiformesとも言われる。
　　　　　Family Protodontidae プロトドゥス科 (絶滅)
　　　　　Family uncertain
　　　　　　Genus Dorsetoscyllium UNDERWOOD & WARD 2004　ドルセトスキルリム属 (絶滅)
　　　　　　　Dorsetoscyllium terraefullonicum Underwood & Ward 2004 (絶滅)
　　　　　　Genus Heterophorcynus UNDERWOOD & WARD 2004　ヘテロフォルキヌス属 (絶滅)
　　　　　　　Heterophorcynus microdon Underwood & Ward 2004 (絶滅)
　　　　　　Genus Lesnilomia GINTER 2008　レスニロミア属 (絶滅)
　　　　　　　Lesnilomia sandbergi Ginter 2008 (絶滅)　※濾過食性。
　　　　　　Genus Reifia DUFFIN 1980　レイフィア属 (絶滅)
　　　　　　　Reifia minuta Duffin 1980 (絶滅)
　　　SUPER-ORDER SQUALEA ツノザメ上目　※＝SQUALOMORPHII COMPAGNO 1973。
　　　　ORDER CTENACANTHIFORMES GLIKMAN 1964 クテナカントゥス目 (絶滅)　※＝Ctenacanthida、Ctenacanthoidea ZANGERL 1981。
　　　　　Family Bandringidae　バンドリンガ科 (絶滅)
　　　　　Family Ctenacanthidae クテナカントゥス科 (絶滅)　※＋Sphenacanthidae。
　　　　　Family Heslerodidae　ヘスレロドゥス科 (絶滅)
　　　　　Family Tristychiidae トリスティキウス科 (絶滅)　※→Ctenacanthidae。
　　　　　Family uncertain
　　　　　　Genus Arauzia MADER 1986　アラウジア属 (絶滅)
　　　　　　　Arauzia federicoi Mader 1986 (絶滅)
　　　　　　Genus Asteroptychius AGASSIZ 1843　アステロプティキウス属 (絶滅)
　　　　　　　Asteroptychius bellus Saint John & Worthen 1875 (絶滅)
　　　　　　　Asteroptychius elegans Newberry 1889 (絶滅)
　　　　　　　Asteroptychius gracilis Newberry 1897 (絶滅)
　　　　　　　Asteroptychius keokuk Saint John & Worthen 1875 (絶滅)
　　　　　　　Asteroptychius ornatus Agassiz 1843 (絶滅)
　　　　　　　Asteroptychius sancti-ludovici Saint John & Worthen 1875 (絶滅)
　　　　　　　Asteroptychius tenellus Saint John & Worthen 1883 (絶滅)
　　　　　　　Asteroptychius tenuis Saint John & Worthen 1875 (絶滅)
　　　　　　　Asteroptychius triangularis Newberry & Worthen 1870 (絶滅)
　　　　　　　Asteroptychius vetustus Saint John & Worthen 1875 (絶滅)
　　　　　　Genus Ertychius GINTER, HAIRAPETIAN & GRIGORYAN 2011　エルティキウス属 (絶滅)
　　　　　　　Ertychius intermedius Ginter, Hairapetian & Grigoryan 2011 (絶滅)
　　　　　　Genus Kaibabvenator HODNETT, ELLIOTT, OLSONC & WITTKE 2012　カイバブウェナトル属 (絶滅)
　　　　　　　Kaibabvenator swiftae Hodnett, Elliott, Olsonc & Wittke 2012 (絶滅)
　　　　　　Genus Nanoskalme HODNETT, ELLIOTT, OLSONC & WITTKE 2012　ナノスカルメ属 (絶滅)
　　　　　　　Nanoskalme natans Hodnett, Elliott, Olsonc & Wittke 2012 (絶滅)
　　　　ORDER HEXANCHIFORMES BUEN 1926 カグラザメ目
　　　　　Sub-Order Chlamydoselachoidei　ラブカ亜目　※目 Chlamydoselachiformes に格上げする意見あり。
　　　　　　Family Chlamydoselachidae　ラブカ科
　　　　　　Family Mcmurdodontidae　マクムルドドゥス科 (絶滅)
　　　　　Sub-Order Hexanchoidei　カグラザメ亜目
　　　　　　Family Crassodontidanidae　クラッソドンティダヌス科 (絶滅)　※＝Crassonotidae。
　　　　　　Family Hexanchidae　カグラザメ科　※＋Notidanidae、Pseudonotidanidae。
　　　　ORDER PRISTIOPHORIFORMES COMPAGNO 1973 ノコギリザメ目
　　　　　Family Pristiophoridae　ノコギリザメ科
　　　　ORDER SQUALIFORMES GOODRICH 1909 ツノザメ目
　　　　　Family Centrophoridae　アイザメ科
　　　　　Family Dalatiidae　ヨロイザメ科
　　　　　Family Echinorhinidae　キクザメ科
　　　　　Family Eoscymnidae　エオスキムヌス科 (絶滅)
　　　　　Family Etmopteridae　カラスザメ科
　　　　　Family Oxynotidae　オロシザメ科
　　　　　Family Pseudodalatiidae　プセウドダラティアス科 (絶滅)
　　　　　Family Somniosidae　オンデンザメ科
　　　　　Family Squalidae　ツノザメ科
　　　　ORDER SQUATINIFORMES カスザメ目　※SQUATINOMORPHII COMPAGNO 1973。
　　　　　Family Squatinidae カスザメ科
　　　Super-Order uncertain
　　　　　Family Anachronistidae　アナクロニステス科 (絶滅)
　　　　　Family Kannathalepididae　カンナタレピス科 (絶滅)
　　　　　Family Ostenoselachidae　オステノセラケ科 (絶滅)
　　　　　Family Wellingtonellidae　ウェルリングトネルラ科 (絶滅)
　　　　　Family uncertain
　　　　　　Genus Adamantina IVANOV 1999　アダマンティナ属 (絶滅)
　　　　　　　Adamantina foliacea Ivanov 1999 (絶滅)
　　　　　　Genus Altholepis KARATAJŪTĖ-TALIMAA 1997　アルトレピス属 (絶滅)
　　　　　　　Altholepis composita Karatajute-Talimaa 1997 (絶滅)
　　　　　　Genus Annulicorona CHEN & CUNY 2003　アンヌリコロナ属 (絶滅)
　　　　　　　Annulicorona pyramidalis Chen & Cuny 2003 (絶滅)
　　　　　　Genus Aussilepis DE POMEROY 1994　アウッシレピス属 (絶滅)
　　　　　　　Aussilepis lukaso de Pomeroy 1994 (絶滅)
　　　　　　Genus Carinasubcorona JOHNS, BARNES & ORCHARD 1997　カリナスブコロナ属 (絶滅)
　　　　　　　Carinasubcorona bamaolinensis Chen 2002 (絶滅)
　　　　　　Genus Complanicorona JOHNS, BARNES & ORCHARD 1997　コムプラニコロナ属 (絶滅)
　　　　　　　Complanicorona rugosimargines Johns, Barnes & Orchard 1997 (絶滅)
　　　　　　Genus Darbasodus AVERIANOV 1991　ダルバソドゥス属 (絶滅)
　　　　　　　Darbasodus olgae Averianov 1991 (絶滅)
　　　　　　Genus Eoantiarchilepis PAN & WANG 1978　エオアンティアルキレピス属 (絶滅)
　　　　　　　Eoantiarchilepis xitunensis Pan & Wang 1978 (絶滅)
　　　　　　Genus Eucentrurus TRAQUAIR 1905　エウケントルルス属 (絶滅)
　　　　　　　Eucentrurus paradoxus Traquair 1905 (絶滅)
　　　　　　Genus Fragilicorona JOHNS, BARNES & ORCHARD 1997　フラギリコロナ属 (絶滅)
　　　　　　　Fragilicorona asymmetriia Ji, Ji & Feng 2009 (絶滅)
　　　　　　　Fragilicorona labricuspis Johns, Barnes & Orchard 1997 (絶滅)
　　　　　　　Fragilicorona guizhouensis Ji, Ji & Feng 2009 (絶滅)
　　　　　　　Fragilicorona paralabritricuspis Chen 2002 (絶滅)
　　　　　　　Fragilicorona wanlantricuspis Zhang, Chen, Cheng & Zhang 2012 (絶滅)
　　　　　　Genus Glabrisubcorona JOHNS, BARNES & ORCHARD 1997　グラブリスブコロナ属 (絶滅)
　　　　　　　Glabrisubcorona arduidevexa Johns, Barnes & Orchard 1997 (絶滅)
　　　　　　　Glabrisubcorona tendibasis Johns, Barnes & Orchard 1997 (絶滅)
　　　　　　　Glabrisubcorona triridgecorona Zhang, Chen, Cheng & Zhang 2012 (絶滅)
　　　　　　Genus Gondwanalepis DE POMEROY 1994　ゴンドワナレピス属 (絶滅)
　　　　　　　Gondwanalepis grossi de Pomeroy 1994 (絶滅)
　　　　　　Genus Grozonodon CUNY, MARTIN, RAUSCHER & MAZIN 1998　グロゾノドン属 (絶滅)
　　　　　　　Grozonodon candaui Cuny, Martin, Rauscher & Mazin 1998 (絶滅)
　　　　　　Genus Hueneichthys REIF 1977　フエネイクティス属 (絶滅)
　　　　　　　Hueneichthys costatus Reif 1977 (絶滅)
　　　　　　Genus Ivanelepis KARATAJŪTĖ-TALIMAA 1997　イウァネレピス属 (絶滅)
　　　　　　　Ivanelepis costulata Karatajūtė-Talimaa 1997 (絶滅)
　　　　　　Genus Karksiodus IVANOV & MÄRSS 2011　カルクシオドゥス属 (絶滅)
　　　　　　　Karksiodus mirus Ivanov & Märss 2011 (絶滅)
　　　　　　Genus Kenderlichthys KAZANTZEVA-SELEZNEVA 1980　ケンデリクティス属 (絶滅)
　　　　　　　Kenderlichthys paluster Kazantseva-Selezneva 1980 (絶滅)
　　　　　　　Kenderlichthys tuberculatus Kazantseva-Selezneva 1980 (絶滅)
　　　　　　Genus Knerialepis HANKE & KARATAJŪTĖ-TALIMAA 2000　クネリアレピス属 (絶滅)　※ネズミギス目クネリア科から。
　　　　　　　Knerialepis angolensis (Hanke & Karatajūtė-Talimaa 2002) (絶滅)
　　　　　　　　　syn.Kneria angolensis Hanke & Karatajūtė-Talimaa 2002
　　　　　　　Knerialepis mashkovae (Karatajūtė-Talimaa 1997) (絶滅)
　　　　　　　　　syn.Kneria mashkovae Karatajūtė-Talimaa 1997
　　　　　　Genus Labascicorona JOHNS, BARNES & ORCHARD 1997　ラバスキコロナ属 (絶滅)
　　　　　　　Labascicorona alata Johns, Barnes & Orchard 1997 (絶滅)
　　　　　　　Labascicorona longifossae Johns, Barnes & Orchard 1997 (絶滅)
　　　　　　　Labascicorona mediflexura Johns, Barnes & Orchard 1997 (絶滅)
　　　　　　　Labascicorona nidifastigia Johns, Barnes & Orchard 1997 (絶滅)
　　　　　　　Labascicorona trifastigia Johns, Barnes & Orchard 1997 (絶滅)
　　　　　　Genus Labrilance JOHNS, BARNES & ORCHARD 1997　ラブリランケ属 (絶滅)
　　　　　　　Labrilance glabrisubcuspis Johns, Barnes & Orchard 1997 (絶滅)
　　　　　　Genus Lamnilance JI, JI & FENG 2009　ラムニランケ属 (絶滅)
　　　　　　　Lamnilance ovalis Ji, Ji & Feng 2009 (絶滅)
　　　　　　Genus Lobaticorona JOHNS, BARNES & ORCHARD 1997　ロバティコロナ属 (絶滅)
　　　　　　　Lobaticorona floriditurris Johns, Barnes & Orchard 1997 (絶滅)
　　　　　　Genus Nogueralepis WANG 1993　ノグエラレピス属 (絶滅)
　　　　　　　Nogueralepis teruelensis Wang 1994 (絶滅)
　　　　　　Genus Notiolepis DE POMEROY 1994　ノティオレピス属 (絶滅)
　　　　　　　Notiolepis dienemos de Pomeroy 1994 (絶滅)
　　　　　　Genus Odontorhytis BÖHM 1926　オドントリティス属 (絶滅)　※→ACANTHODII側。
　　　　　　　Odontorhytis cappettai Mendiola-Santamaria 1997(絶滅)
　　　　　　　Odontorhytis pappenheimi Böhm 1926 (絶滅)
　　　　　　Genus Ornathilabrilance JOHNS, BARNES & ORCHARD 1997　オルナティラブリランケ属 (絶滅)
　　　　　　　Ornathilabrilance circacarina Johns, Barnes & Orchard 1997 (絶滅)
　　　　　　Genus Parvicorona CHEN & CUNY 2003　パルウィコロナ属 (絶滅)
　　　　　　　Parvicorona dacrysulca Chen & Cuny 2003 (絶滅)
　　　　　　Genus Parvidiabolus JOHNS, BARNES & ORCHARD 1997　パルウィディアボルス属 (絶滅)
　　　　　　　Parvidiabolus convexus Johns, Barnes & Orchard 1997 (絶滅)
　　　　　　Genus Plesioselachus ANDERSON, LONG, GESS & HILLER 1999　プレシオセラクス属 (絶滅)
　　　　　　　Plesioselachus macracanthus Anderson, Long, Gess & Hiller 1999 (絶滅)
　　　　　　Genus Rugosicorona JOHNS, BARNES & ORCHARD 1997　ルゴシコロナ属 (絶滅)
　　　　　　　Rugosicorona circacarina Zhang, Chen, Cheng & Zhang 2012 (絶滅)
　　　　　　　Rugosicorona devexa Johns, Barnes & Orchard 1997 (絶滅)
　　　　　　Genus Sacrisubcorona JOHNS, BARNES & ORCHARD 1997　サクリスブコロナ属 (絶滅)
　　　　　　　Sacrisubcorona circabasis Johns, Barnes & Orchard 1997 (絶滅)
　　　　　　Genus Seretolepis KARATAJŪTĖ-TALIMAA 1968　セレトレピス属 (絶滅)
　　　　　　　Seretolepis elegans Karatajute-Talimaa 1968 (絶滅)
　　　　　　Genus Serratocorona CHEN 2002　セルラトコロナ属 (絶滅)
　　　　　　　Serratocorona halberdiformis Chen 2002 (絶滅)
　　　　　　Genus Tantalepis SANSOM, DAVIES, COATES, NICOLL & RITCHIE 2012　タンタレピス属 (絶滅)
　　　　　　　Tantalepis gatehousei Sansom, Davies, Coates, Nicoll & Ritchie 2012 (絶滅)
　　　　　　Genus Tassiliodus DERYCKE & GOUJET 2011　タッシリオドゥス属 (絶滅)
　　　　　　　Tassiliodus lessardi Derycke & Goujet 2011 (絶滅)
　　　　　　Genus Tsuifengshanolepis PAN & WANG 1978　ツイフェングサノレピス属 (絶滅)
　　　　　　　Tsuifengshanolepis diandongensis Pan & Wang 1978 (絶滅)
　　　　　　Genus Tuvalepis Zigaite & KARATAJŪTĖ-TALIMAA 2008　トゥウァレピス属 (絶滅)
　　　　　　　Tuvalepis schultzei Zigaite & Karatajūtė-Talimaa 2008 (絶滅)
　　　　　　Genus Vallisia DUFFIN 1982　ウァルリシア属 (絶滅)
　　　　　　　Vallisia coppi Duffin 1982 (絶滅)
　CLASS ACANTHODII OWEN 1846 棘魚綱 (絶滅)　※＝棘鮫綱。
　　ORDER ACANTHODIFORMES BERG 1940　棘魚目 (絶滅)　※＝Acanthodida BERG 1940。
　　　　Family Acanthodidae　棘魚科 (絶滅)
　　　　Family Cheiracanthidae　ケイラカントゥス科 (絶滅)
　　　　Family Howittacanthidae　ホウィッタカントゥス科 (絶滅)
　　　　Family Mesacanthidae　メサカントゥス科 (絶滅)
　　　　Family uncertain
　　　　　Genus Paucicanthus HANKE 2002　パウキカントゥス属 (絶滅)
　　　　　　Paucicanthus vanelsti Hanke 2002 (絶滅)
　　　　　Genus Yealepis BURROW & YOUNG 1999　イェアレピス属 (絶滅)
　　　　　　Yealepis douglasi Burrow & Young 1999 (絶滅)
　　ORDER CLIMATIIFORMES BERG 1940　クリマティウス目 (絶滅)　※＝Climatiida BERG 1940。
　　　Sub-Order Climatoidei MILES 1966　クリマティウス亜目 (絶滅)　※＝Climatiida。
　　　　Family Acritolepididae　アクリトレピス科 (絶滅)
　　　　Family Climatiidae　クリマティウス科 (絶滅)
　　　　Family Culmacanthidae　クルマカントゥス科 (絶滅)
　　　　Family Euthacanthidae　エウタカントゥス科 (絶滅)
　　　　Family Vesperaliidae　ウェスペラリア科 (絶滅)
　　　Sub-Order Diplacanthoidei WOODWARD 1891　ディプラカントゥス亜目 (絶滅)　※＝Diplacanthida、Diplacanthiformes BERG 1940。
　　　　Family Diplacanthidae　ディプラカントゥス科 (絶滅)
　　　　Family Gladiobranchidae　グラディオブランクス科 (絶滅)　※＋Gladiobranchidae。
　　　　Family Tetanopsyridae　テタノプシルス科 (絶滅)　※Diplacanthidaeに統合する意見あり。
　　　　Family uncertain
　　　　　Genus Striacanthus HILLS 1931　ストリアカントゥス属 (絶滅)
　　　　　　Striacanthus sicaeformis Hills 1931 (絶滅)
　　ORDER ISCHNACANTHIFORMES WOODWARD 1891　イスクナカントゥス目 (絶滅)　※＝Ischnacanthida BERG 1940。
　　　　Family Ischnacanthidae　イスクナカントゥス科 (絶滅)
　　　　Family Poracanthodidae　ポラカントデス科 (絶滅)
　　　　Family Sinacanthidae　シナカントゥス科 (絶滅)
　　ORDER TCHUNACANTHIFORMES　トクナカントゥス目 (絶滅)　※＝Tchunacanthida KARATAJŪTĖ-TALIMAA & Smith 2002。
　　　　Family Lenacanthidae　レナカントゥス科 (絶滅)
　　　　Family Tchunacanthidae　トクナカントゥス科 (絶滅)
　　Order uncertain
　　　　Family Gyracanthidae　ギラカントゥス科 (絶滅)
　　　　Family Machaeracanthidae　マカエラカントゥス科 (絶滅)
　　　　Family uncertain
　　　　　Genus Archaeacanthus KADE 1858　アルカエアカントゥス属 (絶滅)
　　　　　　Archaeacanthus quadrisulcatus Kade 1858 (絶滅)
　　　　　Genus Hunanacanthus PAN 1997　フナナカントゥス属 (絶滅)
　　　　　　Hunanacanthus lixianensis Pan 1997 (絶滅)
　　　　　Genus Obtusacanthus HANKE & WILSON 2004　オブトゥサカントゥス属 (絶滅)
　　　　　　Obtusacanthus corroconis Hanke & Wilson 2004 (絶滅)
　CLASS OSTEICHTHYES HUXLEY 1880 硬骨魚綱　※＝TELEOSTOMI（＋Acanthodii OWEN 1846）。
　　SUB-CLASS SARCOPTERYGII ROMER 1955 肉鰭亜綱　※＝Rhipidistia COPE 1887。
　　　SUPER-ORDER CHOANATA 肉鰭上目　"肺魚類"　※＝Dipnomorpha AHLBERG 1991。＋Dipneusta 、Dipnoi MÜLLER 1846。
　　　　Order Ceratodontiformes BERG 1940 ケラトドゥス目
　　　　　　※＝Ceratodontoidea APESTEGUIA, AGNOLIN & CLAESON 2007。＋Ceratodontoidei VOROBYEVA & OBRUČHEV 1964。
　　　　　Family Arganodontidae　アルガノドゥス科 (絶滅)
　　　　　Family Asiatoceratodontidae　アシアトケラトドゥス科 (絶滅)
　　　　　Family Ceratodontidae　ケラトドゥス科　※＋Arganodontidae。
　　　　　　Sub-Family Ceratodontinae　ケラトドゥス亜科 (絶滅)
　　　　　　Sub-Family Neoceratodontinae　豪州肺魚亜科　※←Neoceratodontidae MILES 1977。
　　　　　Family Gnathorhizidae　グナトリザ科 (絶滅)
　　　　　Family Ptychoceratodontidae　プティコケラトドゥス科 (絶滅)　※→Gnathorhizidae？
　　　　　Family uncertain
　　　　　　Genus Ameghinoceratodus APESTEGUÍA, AGNOLÍN & CLAESON 2007　アメギノケラトドゥス属 (絶滅)
　　　　　　　Ameghinoceratodus iheringi (Ameghino 1898) (絶滅)
　　　　　　　　　syn.Atlantoceratodus iheringi (Ameghino 1898)
　　　　　　　　　　　Ceratodus iheringi Ameghino 1898
　　　　　　Genus Arquatichthys LU & ZHU 2008　アルクアティクティス属 (絶滅)
　　　　　　　Arquatichthys parasus Lu & Zhu 2008 (絶滅)
　　　　　　Genus Chaoceratodus APESTEGUÍA, AGNOLÍN & CLAESON 2007　カオケラトドゥス属 (絶滅)
　　　　　　　Chaoceratodus portezuelensis Apesteguía, Agnolín & Claeson 2007 (絶滅)
　　　　Order Dipnoiformes CLOUTIER 1992　肺魚目 (絶滅)　※＝Speonesydrionina。
　　　　　Family Chirodipteridae　キロディプテルス科 (絶滅)　※Chirodipteroideaとして分離も。
　　　　　　Sub-Family Chirodipterinae　キロディプテルス亜科 (絶滅)
　　　　　　Sub-Family Pillararhynchinae　ピルララリンクス亜科 (絶滅)
　　　　　Family Fleurantiidae　フレウランティア科 (絶滅)　※→Rhynchodipteridae。
　　　　　Family Phaneropleuridae ファネロプレウロン科 (絶滅)　※＝Phaneropleurini Huxley 1861、Phaneropleuronidae。
　　　　　Family Rhynchodipteridae リンコディプテルス科 (絶滅)
　　　　　Family Sagenodontidae　サゲノドゥス科 (絶滅)
　　　　Order Dipteriformes　ディプテルス目 (絶滅)
　　　　　　※＋Dipnorhynchina CAMPBELL & BARWICK 1990、Holodontoidei SCHULTZE 1992。
　　　　　Family Conchopomatidae コンコポマ科 (絶滅)
　　　　　Family Ctenodontidae クテノドゥス科 (絶滅)
　　　　　Family Diabolepididae　ディアボレピス科 (絶滅)
　　　　　Family Dipnorhynchidae ディプノリンクス科 (絶滅)
　　　　　Family Dipteridae　ディプテルス科 (絶滅)
　　　　　Family Holodipteridae ホロディプテルス科 (絶滅)　※＝Holodipterida MOY-THOMAS & MILES 1971、Holodontidae GORIZDRO-KULCZYZKA 1950。
　　　　　Family Speonesydriidae スペオネシドリオン科 (絶滅)　※＝Speonesydrionidae。
　　　　　Family Stomiahykidae ストミアヒクス科 (絶滅)
　　　　　Family Uranolophidae　ウラノロフス科 (絶滅)
　　　　　Family Uronemidae ウロネムス科 (絶滅)　※→Dipnorhynchidae。
　　　　Order Lepidosireniformes 南米肺魚目
　　　　　Family Lepidosirenidae 南米肺魚科
　　　　　Family Protopteridae アフリカ肺魚科
　　　　Order Palaeospondyliformes パラエオスポンディルス目 (絶滅)
　　　　　Family Palaeospondylidae　パラエオスポンディルス科 (絶滅)
　　　　Order Powichthyiformes　ポウィクティス目 (絶滅)　※＝Youngolepidiformes GARDINER 1984。
　　　　　Family Powichthyidae　ポウィクティス科 (絶滅)
　　　　　Family Youngolepididae　ヨウンゴレピス科 (絶滅)　※→Powichthyidae。
　　　　Order uncertain
　　　　　Family uncertain
　　　　　　Genus Guiyu ZHU, ZHAO, JIA, LU, QIAO & QU 2009 グイユ属 (絶滅)
　　　　　　　Guiyu oneiros Zhu, Zhao, Jia, Lu, Qiao & Qu 2009 (絶滅)
　　　SUPER-ORDER CROSSOPTERYGII 総鰭上目　"シーラカンス類"　※＝Coelacanthini、Coelacanthinimorpha。
　　　　Order Coelacanthiformes コエラカントゥス目　"シーラカンス" ＋Actinistiiformes＝Actinista COPE 1871。
　　　　　Family Coelacanthidae　コエラカントゥス科 (絶滅)
　　　　　Family Diplocercididae　ディプロケルキデス科 (絶滅)　※＝Diplocercidae。
　　　　　Family Hadronectoridae　ハドロネクトル科 (絶滅)
　　　　　Family Latimeriidae ラティメリア科
　　　　　Family Laugiidae　ラウギア科 (絶滅)
　　　　　Family Mawsoniidae　マウソニア科 (絶滅)
　　　　　Family Miguashaiidae　ミグアサイア科 (絶滅)
　　　　　Family Rebellatricidae　レベルラトリックス科 (絶滅)
　　　　　Family Rhabdodermatidae　ラブドデルマ科 (絶滅)
　　　　　Family Rhizodopsididae　リゾドプシス科 (絶滅)
　　　　　Family Sasseniidae　サッセニア科 (絶滅)
　　　　　Family Whiteiidae　ウィテイア科 (絶滅)
　　　　　Family uncertain
　　　　　　Genus Bunoderma de SAEZ 1940　ブノデルマ属 (絶滅)　※硬骨魚の何れかレベル。
　　　　　　　Bunoderma haini de Saez 1940 (絶滅)
　　　　　　Genus Luopingcoelacanthus WEN, ZHANG, HU, BENTON, ZHOU, TAO, HUANG & CHEN 2012　ルオピングコエラカントゥス属 (絶滅)　※硬骨魚の何れかレベル。
　　　　　　　Luopingcoelacanthus eurylacrimalis Wen, Zhang, Hu, Benton, Zhou, Tao, Huang & Chen 2012 (絶滅)
　　　　　　Genus Meemannia ZHU, YU, WANG, ZHAO & JIA 2006　メエマンニア属 (絶滅)
　　　　　　　Meemannia eos Zhu, Yu, Wang, Zhao & Jia 2006 (絶滅)
　　　　　　Genus Reidus GRAF 2012　レイドゥス属 (絶滅)
　　　　　　　Reidus hilli Graf 2012 (絶滅)
　　　　　　Genus Youngichthys WANG & LIU 1981　ヨウンギクティス属 (絶滅)
　　　　　　　Youngichthys xinghuainsis Wang & Liu 1981 (絶滅)
　　　　　　Genus Yunnancoelacanthus WEN, ZHANG, HU, BENTON, ZHOU, TAO, HUANG & CHEN 2012　ユンナンコエラカントゥス属 (絶滅)
　　　　　　　Yunnancoelacanthus acrotuberculatus Wen, Zhang, Hu, Benton, Zhou, Tao, Huang & CHEN 2012 (絶滅)
　　　　Order Onychodontiformes (ANDREWS 1973) オニコドゥス目 (絶滅)　（＝Onychodontida ANDREWS 1973）
　　　　　Family Onychodontidae　オニコドゥス科 (絶滅)
　　　　Order Porolepidiformes JARVIK 1942　ポロレピス目 (絶滅)　※＋Gyrolepididae。狭義のRhipidistia COPE 1887。
　　　　　Family Holoptychiidae　ホロプティキウス科 (絶滅)　※→Osteolepidiformes。
　　　　　Family Porolepididae　ポロレピス科 (絶滅)
　　　SUPER-ORDER TETRAPODOMORPHA AHLBERG 1991　四肢様動物上目　※以降両生類・爬虫類・鳥類・哺乳類とも。
　　　　Order Eotetrapodiformes　始四肢様動物目 (絶滅)
　　　　　Family Canowindridae　カノウィンドラ科 (絶滅)
　　　　　Family Whatcheeriidae　ワトケエリア科 (絶滅)　※最初期の四肢動物という認識。
　　　　　Family uncertain
　　　　　　Genus Kenichthys CHANG & ZHU 1993　ケニクティス属 (絶滅)　※手袋。
　　　　　　　Kenichthys campbelli Chang & Zhu 1993 (絶滅)
　　　　　　Genus Metaxygnathus CAMPBELL & BELL 1977　メタクシグナトゥス属 (絶滅)　※手袋。
　　　　　　　Metaxygnathus denticulus Campbell & Bell 1977 (絶滅)
　　　　　　Genus Tinirau SWARTZ 2012　ティニラウ属 (絶滅)　※海水棲。
　　　　　　　Tinirau clackae Swartz 2012 (絶滅)
　　　　Order Osteolepidiformes JARVIK 1942　オステオレピス目 (絶滅)　※＝Osteolepiformes。狭義のRhipidistia COPE 1887。
　　　　　Family Megalichthyidae　メガリクティス科 (絶滅)
　　　　　　　　　※＝Megalichthyinae (HAY 1902) VOROBYEVA 1977 [Osteolepididae]。
　　　　　Family Osteolepididae　オステオレピス科 (絶滅)
　　　　　Family Tristichopteridae　トリスティコプテルス科 (絶滅)　＋Eusthenopteridae。
　　　　　Family uncertain　"有隣両生類様生物"　※以下は魚類と認識するのが困難な姿。魚類と両生類の中間的（腕のある魚）な存在（ミッシングリンク）。
　　　　　　Genus Tiktaalik　ティクタアリク属 (絶滅)　※オットセイ様。
　　　　　　　Tiktaalik roseae Daeschler, Shubin & Jenkins 2006 (絶滅)
　　　　　　　　　※淡水棲。肺（＋）。鰓（＋）
　　　　　　Genus Tungsenia　トゥングセニア属 (絶滅)
　　　　　　　Tungsenia paradoxa Lu, Zhu, Long, Zhao, Senden, Jia & Qiao 2012 (絶滅)
　　　　　　Genus Ventastega　ウェンタステガ属 (絶滅)　※手袋。
　　　　　　　Ventastega curonica Ahlberg, Lukševičs & Lebedev 1994(絶滅)
　　　　Order Panderichthyiformes　パンデリクティス目 (絶滅)　※＝Elpistostegalia、Panderichthyida。上陸直前、両生類に直結。
　　　　　Family Elpistostegidae　エルピストステゲ科 (絶滅)　※→Eotetrapodiformes。
　　　　　Family Panderichthyidae　パンデリクティス科 (絶滅)
　　　　Order Rhizodontiformes　リゾドゥス目 (絶滅)　※＝Rhizodontida ANDREWS & WESTOLL 1970。
　　　　　Family Rhizodontidae　リゾドゥス科 (絶滅)
　　SUB-CLASS ACTINOPTERYGII COPE 1871 条鰭亜綱
　　　DIVISION CHONDROSTEI 軟質区　※空気呼吸。
　　　　Order Acipenseriformes 蝶鮫目　CITES APPENDIX II　※２種除く。
　　　　　Sub-Order Acipenseroidei 蝶鮫亜目
　　　　　　Family Acipenseridae チョウザメ科
　　　　　　　Sub-Family Acipenserinae チョウザメ亜科
　　　　　　　Sub-Family Husinae オオチョウザメ亜科　※通常蝶鮫亜科に統合
　　　　　　　Sub-Family Scaphirhynchinae ソコヘラチョウザメ亜科　※←Scaphirhynchidae。
　　　　　Sub-Order Peipiaosteoidei ペイピアオステウス亜目 (絶滅)
　　　　　　Family Peipiaosteidae ペイピアオステウス科 (絶滅)
　　　　　　　Sub-Family Peipiaosteinae　ペイピアオステウス亜科 (絶滅)
　　　　　　　Sub-Family Spherosteinae　スファエロステウス亜科 (絶滅)
　　　　　　　Sub-Family Stichopterinae　スティコプテルス亜科 (絶滅)
　　　　　Sub-Order Polyodontoidei 箆蝶鮫亜目
　　　　　　Family Polyodontidae ヘラチョウザメ科
　　　　　　　Sub-Family Paleopsephurinae パレオプセフルス亜科
　　　　　　　Sub-Family Polyodontidae ヘラチョウザメ亜科
　　　　　　　Sub-Family Protopsephurinae プロトセフルス亜科
　　　　Order Aeduelliformes　アエデュエレルラ目 (絶滅)　※最古の条鰭類。
　　　　　　Family Aeduellidae アエデュエレルラ科 (絶滅)　※＋Platysellidae。
　　　　Order Asarotiformes　アサロトゥス目 (絶滅)　※→Holocephali？
　　　　　　Family Asarotidae　アサロトゥス科 (絶滅)
　　　　Order Chondrosteiformes　コンドロステウス目 (絶滅)　※チョウザメ目の亜科 Chondrosteinaeとし編入する考えがある。
　　　　　　Family Chondrosteidae コンドロステウス科 (絶滅)　(＝Sturiidae)。
　　　　Order Discordichthyiformes　ディスコルディクティス目 (絶滅)
　　　　　　Family Discordichthyidae　ディスコルディクティス科 (絶滅)
　　　　Order Haplolepidiformes　ハプロレピス目 (絶滅)　※Palaeonisciformesより分離独立。
　　　　　　Family Haplolepididae　ハプロレピス科 (絶滅)
　　　　Order Lophosteiformes　ロフォステウス目 (絶滅)　※分類学的位置は不安定。
　　　　　Family Lophosteidae　ロフォステウス科 (絶滅)
　　　　Order Luganoiiformes　ルガノイア目 (絶滅)　※ペルレイドゥス科に統合するのが普通。
　　　　　　Family Luganoiidae ルガノイア科 (絶滅)
　　　　Order Palaeonisciformes　パラエオニスクム目 (絶滅)
　　　　　Sub-Order Dorypteroidei ドリプテルス亜目 (絶滅)　※目に格上げも。
　　　　　　Family Amphicentridae アムフィケントルム科 (絶滅)　※→Platysomoidei？
　　　　　　Family Dorypteridae ドリプテルス科 (絶滅)
　　　　　Sub-Order Palaeoniscoidei パラエオニスクム亜目 (絶滅)
　　　　　　Family Acrolepididae　アクロレピス科 (絶滅)　※＋Boreolepididae。
　　　　　　Family Aesopichthyidae アエソピクティス科 (絶滅)　※→Redfieldiidae。
　　　　　　Family Amblypteridae アムブリプテルス科 (絶滅)　※＋Lawniidae、Eurynotoidiidae、Paramblypteridae。Elonichthyiformes。
　　　　　　Family Birgeriidae　ビルゲリア科 (絶滅)　※＋Canobiidae。Birgeriiformes→Saurichthyiformes。
　　　　　　Family Centrolepididae　ケントロレピス科 (絶滅)
　　　　　　Family Cheirolepididae　ケイロレピス科 (絶滅)
　　　　　　Family Coccocephalidae　コッコケファルス科 (絶滅)　※Coccocephalichthyidae。
　　　　　　Family Coccolepididae　コッコレピス科 (絶滅)　※→PALAEONISCIDAE。
　　　　　　Family Cornuboniscidae　コルヌボニクティス科 (絶滅)
　　　　　　Family Cosmoptychiidae コスモプティキウス科 (絶滅)
　　　　　　Family Cryphiolepididae　クリフィオレピス科 (絶滅)
　　　　　　Family Dicellopygidae ディケルロピゲ科 (絶滅)　※＋Brachydegmidae。
　　　　　　Family Dwykiidae　ドゥウィキア科 (絶滅)
　　　　　　Family Elonichthyidae エロニクティス科 (絶滅)　※→Elonichthyiformes？
　　　　　　Family Gonatodidae　ゴナトドゥス科 (絶滅)　※Elonichthyiformes。
　　　　　　Family Holuriidae　ホルルス科 (絶滅)
　　　　　　Family Igornichthyidae　イゴルニクティス科 (絶滅)　※＋Commentryidae。
　　　　　　Family Karaunguriidae　カラウングリア科 (絶滅)
　　　　　　Family Monesedeiphidae　モネセデイフス科 (絶滅)　※Coccocephalidae？
　　　　　　Family Palaeoniscidae　パラエオニスクム科 (絶滅)　※＋Atherstoniidae、Oxygnathidae、Thrissonotidae。
　　　　　　Family Pygopteridae ピゴプテルス科 (絶滅)
　　　　　　Family Rhabdolepididae ラブドレピス科 (絶滅)　※＋Osorioichthyidae。
　　　　　　Family Rhadinichthyidae ラディニクティス科 (絶滅)
　　　　　　Family Stegotrachelidae　ステゴトラケルス科 (絶滅)　※＋Moythomasiidae、Tegeolepidae。
　　　　　　Family Styracopteridae　スティラコプテルス科 (絶滅)
　　　　　　Family Varialepididae　ウァリアレピス科 (絶滅)　※Elonichthyiformes。
　　　　　　Family Willomorichthyidae　ウィルロモリクティス科 (絶滅)
　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　Genus Nozamichthys　ノザミクティス属 (絶滅)
　　　　　　　　Nozamichthys contortus Schultze & Bardack 1987 (絶滅)
　　　　　Sub-Order uncertain
　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　Genus Aliuslater SNYDER 2006　アリウスラテル属 (絶滅)
　　　　　　　　Aliuslater inmuri Snyder 2006 (絶滅)
　　　　　　　Genus Anaglyphus RZEHAK 1881　アナグリフス属 (絶滅)
　　　　　　　　Anaglyphus insignis Rzehak 1881 (絶滅)
　　　　　　　Genus Arratiaichthys RICHTER & BREITKREUZ 1997　アルラティアイクティス属 (絶滅)
　　　　　　　Genus Avamia　アウァミア属 (絶滅)
　　　　　　　　Avamia malovetskajae Kazantseva-Selezneva 1980 (絶滅)
　　　　　　　Genus Burguklia　ブルグクリア属 (絶滅)
　　　　　　　　Burguklia gdali Kazantseva-Selezneva 1980 (絶滅)
　　　　　　　Genus Cuneognathus　クネオグナトゥス属 (絶滅)
　　　　　　　　Cuneognathus gardineri Friedman & Blom 2006 (絶滅)
　　　　　　　Genus Kalops　カロプス属 (絶滅)
　　　　　　　　Kalops diophrys Poplin & Lund 2002 (絶滅)
　　　　　　　　Kalops monophrys Poplin & Lund 2002 (絶滅)
　　　　　　　Genus Limnomis　リムノミス属 (絶滅)
　　　　　　　　Limnomis delaneyi Daeschler 2000 (絶滅)
　　　　　Sub-Order Platysomoidei プラティソムス亜目 (絶滅)
　　　　　　Family Bobasatraniidae ボバサトラニア科 (絶滅)
　　　　　　　※目Bobasatraniiformesから格下げ。
　　　　　　Family Chirodontidae キロドゥス科 (絶滅)
　　　　　　　※→Bobasatraniiformes。
　　　　　　Family Platysomidae プラティソムス科 (絶滅)
　　　　　　　※＝Platysomatidae。＋Eurynotoididae, Eurynotoidiformes, Mesolepididae。
　　　　　Sub-Order Redfieldoidei レディフィエルディウス亜目 (絶滅)
　　　　　　　※目Redfieldiformesに格上げ、Ptycholepidiformesに統合など。
　　　　　　Family Redfieldiidae レディフィエルディウス科 (絶滅)
　　　　　　　※＋Pseudobeaconiidae、→Perleidiformes BERG 1937？
　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　Genus Diplospondichthys　ディプロスポンディクティス属 (絶滅)
　　　　　　　　Diplospondichthys moreaui Filleul & Dutheil 2004 (絶滅)
　　　　　　　Genus Rastrolepis　ラストロレピス属 (絶滅)
　　　　　　　　Rastrolepis latipinnata Lopez-Arbarello, Rogers & Puerta 2006 (絶滅)
　　　　　　　　Rastrolepis riojaensis Lopez-Arbarello, Rogers & Puerta 2006 (絶滅)
　　　　　Sub-Order uncertain
　　　　　　Family Andreolepididae　アンドレオレピス科 (絶滅)
　　　　　　Family Carbovelidae　カルボウェレス科 (絶滅)　※＋Phanerosteidae、Trissolepididae。
　　　　　　Family Chichiidae　キキア科 (絶滅)
　　　　　　Family Tienshaniscidae　ティエンサニスクス科 (絶滅)
　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　Genus Lawrenciella　ラウレンシエルラ属 (絶滅)
　　　　　　　　Lawrenciella schaefferi Poplin 1984 (絶滅)
　　　　Order Peltopleuriformes　ペルトプレウルス目 (絶滅)
　　　　　Family Peltopleuridae　ペルトプレウルス科 (絶滅)　※＋Habroichthyidae。→Thoracopteridae？
　　　　　Family Polzbergiidae　ポルズベルギア科 (絶滅)　※→Thoracopteridae、Polzbergiiformes？
　　　　　Family Thoracopteridae　トラコプテルス科 (絶滅)　※→Phanerorhynchiformes？
　　　　Order Perleidiformes BERG 1937　ペルレイドゥス目 (絶滅)
　　　　　　Family Aethodontidae アエトドントゥス科 (絶滅)
　　　　　　Family Cephaloxenidae ケファロキセヌス科 (絶滅)　※→Cephaloxeniformes？
　　　　　　Family Cleithrolepididae クレイトロレピス科 (絶滅)
　　　　　　Family Colobodontidae　コロボドゥス科 (絶滅)　※→Perleididae。
　　　　　　Family Gabanellidae ガバネルリア科 (絶滅)
　　　　　　Family Perleididae ペルレイドゥス科 (絶滅)　※＝COLOBODONTIDAE。
　　　　　　Family Platysiagidae プラティシアグム科 (絶滅)
　　　　Order Phanerorhynchiformes　ファネロリンクス目 (絶滅)
　　　　　　Family Phanerorhynchidae　ファネロリンクス科 (絶滅)
　　　　Order Pholidopleuriformes　フォリドプレウルス目 (絶滅)
　　　　　　Family Pholidopleuridae　フォリドプレウルス科 (絶滅)
　　　　Order Ptycholepidiformes　プティコレピス目 (絶滅)
　　　　　　Family Ptycholepididae　プティコレピス科 (絶滅)
　　　　Order Saurichthyiformes　サウリクティス目 (絶滅)
　　　　　　Family Saurichthyidae　サウリクティス科 (絶滅)
　　　　Order uncertain
　　　　　　Family Dorsolepididae　ドルソレピス科 (絶滅)
　　　　　　Family Eigiliidae　エイギリア科 (絶滅)
　　　　　　Family Fubarichthyidae　フバリクティス科 (絶滅)
　　　　　　Family Irajapintoseidontidae　イラヤピントセイドン科 (絶滅)
　　　　　　Family Uighuroniscidae　ウイグロニスクス科 (絶滅)
　　　　　　Family Urosthenidae　ウロステネス科 (絶滅)
　　　　　　Family Uydeniidae　ウイデニア科 (絶滅)
　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　Genus Akanichthys　アカニクティス属 (絶滅)　※詳細不明、取り敢えず。
　　　　　　　　Akanichthys minusculus Kazantseva 1980 (絶滅)
　　　　　　　　Akanichthys schevtschenkoi Kazantseva 1980 (絶滅)
　　　　　　　Genus Ameghinichthys　アメギニクティス属 (絶滅)
　　　　　　　　Ameghinichthys antarcticus Arratia, Scasso & Kiessling 2004 (絶滅)
　　　　　　　Genus Angatubichthys　アンガトゥビクティス属 (絶滅)
　　　　　　　　Angatubichthys mendesi de Figueiredo & Carvalho 2004 (絶滅)
　　　　　　　Genus Baoqingichthys　バオクインギクティス属 (絶滅)　※詳細不明、取り敢えず。
　　　　　　　　Baoqingichthys microdontus Wang, Jin, Wang & Zhu 2007 (絶滅)
　　　　　　　Genus Brazilichthys　ブラシリイクティス属 (絶滅)
　　　　　　　　Brazilichthys macrognathus Cox & Hutchinson 1991 (絶滅)
　　　　　　　Genus Caminchaia　カミンカイア属 (絶滅)
　　　　　　　　Caminchaia draghii Rusconi 1946 (絶滅)
　　　　　　　Genus Cenechoia　ケネコイア属 (絶滅)
　　　　　　　　Cenechoia paramillensis Rusconi 1946 (絶滅)
　　　　　　　　Cenechoia sulcata Rusconi 1947 (絶滅)
　　　　　　　Genus Ducanichthys　ドゥカニクティス属 (絶滅)
　　　　　　　　Ducanichthys aculeatus Bürgin, Eichenberger, Furrer & Tschanz 1991 (絶滅)
　　　　　　　Genus Gymnoichthys　ギムノイクティス属 (絶滅)　※詳細不明、取り敢えず。
　　　　　　　　Gymnoichthys inopinatus Tintori, Sun, Lombardo, Jiang, Sun & Hao 2010 (絶滅)
　　　　　　　Genus Leighiscus　レイギスクス属 (絶滅)
　　　　　　　　Leighiscus hillsi Wade 1953 (絶滅)
　　　　　　　Genus Luederia　ルエデリア属 (絶滅)　※大型種。
　　　　　　　　Luederia kempi Schaeffer & Dalquest 1978 (絶滅)
　　　　　　　Genus Naxilepis　ナクシレピス属 (絶滅)
　　　　　　　　Naxilepis gracilis Wang & Dong 1989 (絶滅)
　　　　　　　Genus Rubius　ルビウス属 (絶滅)
　　　　　　　　Rubius pascoalensis Richter 2002 (絶滅)
　　　　　　　Genus Terenolepis　テレノレピス属 (絶滅)
　　　　　　　　Terenolepis turnerae Burrow 1995 (絶滅)
　　　　　　　Genus Zhejiangichthys　ゼイアンギクティス属 (絶滅)　※詳細不明、取り敢えず。
　　　　　　　　Zhejiangichthys zhaoi Wang, Jin, Wang & Zhu 2007 (絶滅)
　　　DIVISION CLADISTIA　腕鰭区　※＝Brachiopterygii。空気呼吸。軟質区に編入する意見あり。
　　　　Order Guildayichthyiformes　グイルダイクティス目 (絶滅)
　　　　　Family Guildayichthyidae　グイルダイクティス科 (絶滅)
　　　　Order Polypteriformes 多鰭魚目
　　　　　Family Polypteridae ポリプテルス科
　　　　Order Tarrasiiformes　タッラシウス目 (絶滅)
　　　　　Family Tarrasiidae　タッラシウス科 (絶滅)
　　　DIVISION HALECOSTOMI　全骨区　※＝HALECOMORPHI、Holostei。新鰭区の亜区に格下げ・軟質区に編入するなどの意見もある。
　　　　Order Amiiformes HAY 1929 アミア目
　　　　　Family Amiidae　アミア科
　　　　　　Sub-Family Amiinae アミア亜科
　　　　　　Sub-Family Amiopsinae　アミオプシス亜科 (絶滅)
　　　　　　Sub-Family Solnhofenamiinae ソルノフェナミア亜科 (絶滅)
　　　　　　Sub-Family Vidalamiinae　ウィダラミア亜科 (絶滅)　※←Vidalamiidae。
　　　　　Family Liodesmidae　リオデスムス科 (絶滅)　※→Parasemionotidae？
　　　　　Family Palaeolabridae　パラエオラブルス科 (絶滅)
　　　　　Family Sinamiidae　シナミア科 (絶滅)
　　　　　Family uncertain
　　　　　　Genus Otomitla　オトミトラ属 (絶滅)
　　　　　　　Otomitla speciosa Felix 1891 (絶滅)
　　　　　　Genus Paraliodesmus DUNKLE 1969　パラリオデスムス属 (絶滅)　※ガーパイク？
　　　　　　　Paraliodesmus guadagnii Dunkle 1969 (絶滅)
　　　　　　Genus Tomognathus　トモグナトゥス属 (絶滅)
　　　　　　　Tomognathus gigeri Cavin & Giner 2012 (絶滅)
　　　　　　　Tomognathus leiodus Dixon 1850 (絶滅)
　　　　　　　Tomognathus mordax Dixon 1850 (絶滅)
　　　　　　Genus Xingyia　キシンギイア属 (絶滅)
　　　　　　　Xingyia gracilis Liu ex Liu, Yin, Wang, Luo & Wang 2003 (絶滅)
　　　　Order Aspidorhynchiformes　アスピドリンクス目 (絶滅)　※Teleosteomorpha。
　　　　　Family Aspidorhynchidae　アスピドリンクス科 (絶滅)　※ジュラ紀〜白亜紀。
　　　　Order Ionoscopiformes イオノスコプス目 (絶滅)
　　　　　Family Caturidae　カトゥルス科 (絶滅)　※＋Furidae、Eugnathidae。
　　　　　Family Ionoscopidae　イオノスコプス科 (絶滅)
　　　　　Family Ophiopsididae　オフィオプシス科 (絶滅)
　　　　　Family Oshuniidae　オスニア科 (絶滅)　※→Ionoscopidae。
　　　　Order Lepisosteiformes HAY 1930 鱗骨目　※＝Ginglymodi。Semionotiformesに統合させる意見がある。
　　　　　Family Lepisosteidae　レピソステウス科　"ガーパイク（北米）"
　　　　Order Macrosemiiformes　マクロセミウス目 (絶滅)　※→アミア目。
　　　　　Family Macrosemiidae　マクロセミウス科 (絶滅)
　　　　Order Pachycormiformes BERG 1940　パキコルムス目 (絶滅)　※Teleosteomorpha。
　　　　　Family Koonwarriidae　コオンワルリア科 (絶滅)
　　　　　Family Pachycormidae　パキコルムス科 (絶滅)
　　　　　Family Protosphyraenidae　プロトスフィラエナ科 (絶滅)　※→Pachycormidae。
　　　　　Family uncertain
　　　　　　Genus Atacamichthys ARRATIA & SCHULTZE 1987　アタカミクティス属 (絶滅)
　　　　　　　Atacamichthys greeni Arratia & Schultze 1987 (絶滅)
　　　　　　Genus Flugopterus　フルゴプテルス属 (絶滅)
　　　　　　　Flugopterus raiblianus (Kner 1866) (絶滅)
　　　　　　　　　syn.Megalopterus raiblianus Kner 1866　※属名は鳥類が使用中。
　　　　　　Genus Gigapteryx FOREY, YI, PATTERSON & DAVIES 2003　ギガプテリックス属 (絶滅)　※新生代。
　　　　　　　Gigapteryx lebanonensis Forey, Yi, Patterson & Davies 2003 (絶滅)
　　　　　　　Gigapteryx tethyestris Forey, Yi, Patterson & Davies 2003 (絶滅)
　　　　Order Parasemionotiformes　パラセミオノトゥス目 (絶滅)　※→アミア目。
　　　　　Family Parasemionotidae　パラセミオノトゥス科 (絶滅)　※＋Promecosominidae。
　　　　　Family Tungusichthyidae　トゥングシクティス科 (絶滅)
　　　　Order Pholidophoriformes BERG 1940　フォリドフォルス目 (絶滅)
　　　　　Family Archaeomaenidae　アルカエオマエネ科 (絶滅)
　　　　　Family Ichthyokentemidae　イクティオケンテマ科 (絶滅)　※＋Catervariolidae。
　　　　　Family Ligulelliidae　リグレリア科 (絶滅)　※Liglelliiformes。
　　　　　Family Lombardinidae　ロムバルディナ科 (絶滅)
　　　　　Family Majokiidae　マヨキア科 (絶滅)
　　　　　Family Oligopleuridae　オリゴプレウルス科 (絶滅)
　　　　　Family Pholidophoridae　フォリドフォルス科 (絶滅)　※＋Siyuichthyidae。
　　　　　Family Pleuropholididae　プレウロフォリス科 (絶滅)
　　　　　Family Signeuxellidae　シグネウクセルラ科 (絶滅)
　　　　Order Pycnodontiformes BERG 1940　ピクノドゥス目 (絶滅)
　　　　　Sub-Order Gyrodontoidei ギロドゥス亜目 (絶滅)
　　　　　　Family Gyrodontidae　ギロドゥス科 (絶滅)
　　　　　　Family Mesturidae　メストゥルス科 (絶滅)
　　　　　Sub-Order Pycnodontoidei ピクノドゥス亜目 (絶滅)
　　　　　　Family Brembodontidae　ブレムボドゥス科 (絶滅)
　　　　　　Family Coccodontidae　コッコドゥス科 (絶滅)　※＋Trewavasiidae。
　　　　　Family Nursallidae　ヌルサルリア科 (絶滅)
　　　　　　Family Palaeobalistidae　パラエオバリストゥム科 (絶滅)　※→Pycnodontidae（＝Nursallidae）。
　　　　　　Family Pycnodontidae　ピクノドゥス科 (絶滅)　※＋Hadrodontidae、Nursallidae、Propenserinae。
　　　　Order Scanilepiformes　スカニレピス目 (絶滅)　※→Amiiformes。
　　　　　Family Evenkiidae　エウェンキア科 (絶滅)
　　　　　Family Gyrolepididae　ギロレピス科 (絶滅)
　　　　　Family Scanilepididae　スカニレピス科 (絶滅)
　　　　Order Semionotiformes　セミオノトゥス目 (絶滅)
　　　　　Family Acentrophoridae　アケントロフォルス科 (絶滅)　※→Semionotidae。
　　　　　Family Dapediidae　ダペディウム科 (絶滅)
　　　　　Family Hadrodontidae　ハドロドゥス科 (絶滅)
　　　　　Family Semionotidae　セミオノトゥス科 (絶滅)　※＋Eosemionotidae。
　　　　　Family unknown
　　　　　　　Genus Corunegenys　コルネゲニス属 (絶滅)
　　　　　　　　Corunegenys bowralensis Wade 1941 (絶滅)
　　　　　　　Genus Kapokichthys　カポキクティス属 (絶滅)
　　　　　　　　Kapokichthys spinolepis Sytchevskaya 2005 (絶滅)
　　　DIVISION NEOPTERYGII 新鰭区　※亜綱に格上げする考えもある。
　　　　SUB-DIVISION TELEOSTEI MÜLLER 1846 真骨亜区
　　　　　INFRA-DIVISION ELOPIMORPHA カライワシ下区
　　　　　　ORDER ALBULIFORMES ソトイワシ目　※＝Albuloidei（Notacanthoidei＝NOTACANTHIFORMESが分離）。
　　　　　　　　Family Albulidae　ソトイワシ科
　　　　　　　　　Sub-Family Albulinae　ソトイワシ亜科
　　　　　　　　　Sub-Family Pterothrissinae　ギス亜科　※＋Pterothrissidae。
　　　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　　　　Genus Albuloideorum　アルブロイデオルム属 (絶滅)　※Otoliths＝耳石。
　　　　　　　　　　　Albuloideorum circurale (絶滅)
　　　　　　　　　　　Albuloideorum ventrale (絶滅)
　　　　　　ORDER ANGUILLIFORMES ウナギ目
　　　　　　　SUB-ORDER ANGUILLOIDEI ウナギ亜目
　　　　　　　　Family Anguillidae　ウナギ科
　　　　　　　　Family Anguilloididae　アングイルロデス科 (絶滅)
　　　　　　　　Family Heterenchelyidae　ザトウウナギ科
　　　　　　　　Family Milananguillidae　ミラナングイルラ科 (絶滅)
　　　　　　　　Family Moringuidae　ハリガネウミヘビ科
　　　　　　　　Family Paranguillidae　パラングイルラ科 (絶滅)　"ムカシウナギＢ"
　　　　　　　　Family Patavichthidae　パタウィクティス科 (絶滅)
　　　　　　　　Family Proteomyridae　プロテオミルス科 (絶滅)
　　　　　　　　Family Protoanguillidae　プロトアングイルラ科
　　　　　　　　Family Urenchelyidae　ウレンケリス科 (絶滅)
　　　　　　　SUB-ORDER CONGROIDEI アナゴ亜目
　　　　　　　　Family Colocongridae　フサアナゴ科
　　　　　　　　Family Congridae　アナゴ科
　　　　　　　　　Sub-Family Bathymyrinae　ホンメダマアナゴ亜科　※＝Ariosominae。＋Echelidae。
　　　　　　　　　Sub-Family Congrinae　クロアナゴ亜科　※＋Macrocephenchelyidae。
　　　　　　　　　Sub-Family Heterocongrinae　チンアナゴ亜科　※←Heterocongridae。
　　　　　　　　Family Derichthyidae　クビナガアナゴ科　※＋Nessorhamphidae。
　　　　　　　　Family Muraenesocidae　ハモ科
　　　　　　　　Family Nettastomatidae　クズアナゴ科
　　　　　　　　Family Ophichthidae　ウミヘビ科
　　　　　　　　　Sub-Family Asanoinae　アサノア亜科 (絶滅)
　　　　　　　　　Sub-Family Myrophinae　ニンギョウアナゴ亜科　※←Myrophidae。＋Aoteidae、Neenchelyidae。
　　　　　　　　　Sub-Family Ophichthinae　ウミヘビ亜科
　　　　　　　　Family Parechelidae　パレケルス科 (絶滅)
　　　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　　　Genus Congroideorum　コングロイデオルム属 (絶滅)　※Otoliths＝耳石。
　　　　　　　　　　Congroideorum obscurum Schwarzhans 1980 (絶滅)
　　　　　　　SUB-ORDER MURAENOIDEI ウツボ亜目　※→Anguilloidei。
　　　　　　　　Family Chlopsidae　カワリアナゴ科　※＋Xenocongridae。
　　　　　　　　Family Deprandidae　デプランドゥス科 (絶滅)
　　　　　　　　Family Georgidentidae　ゲオルギデンス科 (絶滅)
　　　　　　　　Family Muraenidae　ウツボ科
　　　　　　　　　Sub-Family Muraeninae　ウツボ亜科
　　　　　　　　　Sub-Family Uropterygiinae　キカイウツボ亜科　※←Uropterygiidae。
　　　　　　　　Family Myrocongridae　ヒレウツボ科
　　　　　　　SUB-ORDER NEMICHTHYOIDEI シギウナギ亜目
　　　　　　　　Family Nemichthyidae　シギウナギ科
　　　　　　　　Family Serrivomeridae　ノコバウナギ科
　　　　　　　SUB-ORDER SYNAPHOBRANCHOIDEI ホラアナゴ亜目
　　　　　　　　Family Synaphobranchidae　ホラアナゴ科
　　　　　　　　　Sub-Family Ilyophinae　リュウキュウホラアナゴ亜科（aka.メクラアナゴ亜科）　※←Ilyophidae。＋Dysommidae、Dysomminidae、Nettodaridae、Todaridae。
　　　　　　　　　Sub-Family Simenchelyinae　コンゴウアナゴ亜科　※←Simenchelyidae。
　　　　　　　　　Sub-Family Synaphobranchidae　ホラアナゴ亜科
　　　　　　　Sub-Order uncertain
　　　　　　　　　　Genus Anguilliformorum　アングイルリフォルモルム属 (絶滅)　※Otoliths＝耳石。
　　　　　　　　　　　Anguilliformorum obliquestriatum (Roedel 1930) (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　syn.Percidarum obliquestriatum Roedel 1930
　　　　　　　　　　Genus Luenchelys　ルエンケリス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Luenchelys minimus Belouze, Gayet & Atallah 2003 (絶滅)
　　　　　　ORDER ELOPIFORMES GREENWOOD, ROSEN, WEITZMAN & MEYERS 1966 カライワシ目
　　　　　　　　Family Anaethaliidae　アナエタリオン科 (絶滅)　※＝Anaethalionidae。
　　　　　　　　Family Elopidae　カライワシ科
　　　　　　　　Family Megalopidae　イセゴイ科　※←Megalopiformes。
　　　　　　　　Family Phyllodontidae　フィルロドゥス科 (絶滅)
　　　　　　　　　Sub-Family Paralbulinae　パラアルブラ亜科 (絶滅)
　　　　　　　　　Sub-Family Phyllodontinae　フィルロドゥス亜科 (絶滅)
　　　　　　　　Family Protelopidae　プロテロプス科 (絶滅)
　　　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　　　Genus Carsothrissops　カルソトリッソプス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　Carsothrissops delorenzi d'Erasmo 1946 (絶滅)
　　　　　　　　　Genus Echinelops　エキネロプス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　Echinelops ozcani Murray & Hoşgör 2012 (絶滅)
　　　　　　　　　Genus Flindersichthys　フリンデルシクティス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　Flindersichthys denmeadi Longman 1932 (絶滅)
　　　　　　　　　Genus Irenichthys　イレニクティス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　Irenichthys certus Jakovlev 1968 (絶滅)
　　　　　　ORDER NOTACANTHIFORMES ソコギス目　※←Notacanthoidei, ALBULIFORMES。
　　　　　　　　Family Halosauridae　トカゲギス科
　　　　　　　　Family Notacanthidae ソコギス科
　　　　　　ORDER SACCOPHARYNGIFORMES フウセンウナギ目
　　　　　　　　Family Cyematidae　ヤバネウナギ科（aka.セムシウナギ科）　※→Anguilliformes。
　　　　　　　　Family Eurypharyngidae　フクロウナギ科
　　　　　　　　Family Monognathidae　タンガクウナギ科
　　　　　　　　Family Saccopharyngidae　フウセンウナギ科
　　　　　INFRA-DIVISION OTOCEPHALA ニシン・骨鰾下区
　　　　　　SUPER-ORDER CLUPEOMORPHA　ニシン上目
　　　　　　　ORDER CLUPEIFORMES GOODRICH 1909　ニシン目　※＝Isospondyli。
　　　　　　　　Family Chirocentridae　オキイワシ科
　　　　　　　　Family Clupeidae　ニシン科
　　　　　　　　　Sub-Family Alosinae　ニシンダマシ亜科　※←Alosidae。＋Brevootiinae。
　　　　　　　　　Sub-Family Chirocentrinae　イヌバニシン亜科　※←Chirocentridae。
　　　　　　　　　Sub-Family Clupeinae　ニシン亜科
　　　　　　　　　Sub-Family Dorosomatinae　コノシロ亜科　※←Dorosomatidae。
　　　　　　　　　Sub-Family Dussumieriinae　ギンイワシ亜科　※←Dussumieriidae。
　　　　　　　　　Sub-Family Pellonuliinae　ペルロヌラ亜科　※←Pellonuliidae。
　　　　　　　　　Sub-Family Spratelloidinae　キビナゴ亜科　※Dussumieriinaeに統合する意見有り。
　　　　　　　　Family Denticepidae　デンティケプス科　※＝Denticipitidae。
　　　　　　　　Family Engraulidae　カタクチイワシ科
　　　　　　　　　Sub-Family Coilinae　エツ亜科　※←Coilidae。
　　　　　　　　　Sub-Family Engraulinae　カタクチイワシ亜科
　　　　　　　　Family Ganolytidae　ガノリテス科 (絶滅)
　　　　　　　　Family Pristigasteridae　ヒラ科　※ニシン科内Pristigasterinaeとすることも。
　　　　　　　　Family Sundasalangidae　スンダサランクス科　"シラウオモドキ"
　　　　　　　　Family Varasichthyidae　ウァラシクティス科 (絶滅)
　　　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　　　　Genus Clupeiformorum　クルペイフォルモルム属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Clupeiformorum planum Gaemers & van Hinsbergh 1978 (絶滅)
　　　　　　　ORDER CROSSOGNATHIFORMES クロッソグナトゥス目 (絶滅)　※→Tselfatiiformes NELSON 1994？
　　　　　　　　Sub-Order Crossognathoidei クロッソグナトゥス亜目 (絶滅)
　　　　　　　　　Family Crossognathidae　クロッソグナトゥス科 (絶滅)　※＋Apsopelicidae。
　　　　　　　　Sub-Order Pachyrhizodontoidei パキリゾドントゥス亜目 (絶滅)
　　　　　　　　　Family Chongichthyidae　コンギクティス科 (絶滅)
　　　　　　　　　Family Notelopidae　ノテロプス科 (絶滅)
　　　　　　　　　Family Pachyrhizodontidae　パキリゾドントゥス科 (絶滅)
　　　　　　　　　Family Raphiosauridae　ラフィオサウルス科 (絶滅)
　　　　　　　ORDER ELLIMMICHTHYIFORMES　エルリムミクティス目 (絶滅)
　　　　　　　　Family Clupavidae　クルパウス科 (絶滅)　※→Characiformes。
　　　　　　　　Family Ellimmichthyidae　エルリムミクティス科 (絶滅)
　　　　　　　　Family Paraclupeidae　パラクルペア科 (絶滅)　※→Ellimmichthyidae？
　　　　　　　　Family Sorbinichthyidae　ソルビニクティス科 (絶滅)
　　　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　　　Genus Codoichthys　コドイクティス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　Codoichthys carnavalii Silva-Santos 1994 (絶滅)
　　　　　　　　　Genus Histiurus COSTA 1850　ヒスティウルス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　Histiurus elatus　Costa 1850 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　syn.Histiurus serioloides Costa 1864
　　　　　　　ORDER LEPTOLEPIDIFORMES　レプトレピス目 (絶滅)
　　　　　　　　Family Leptolepididae　レプトレピス科 (絶滅)
　　　　　　　ORDER TSELFATIIFORMES NELSON 1994　トセルファティア目 (絶滅)
　　　　　　　　Family Eoplethodidae　エオプレトドゥス科 (絶滅)
　　　　　　　　Family Ferrifronsidae　フェルリフロンス科 (絶滅)
　　　　　　　　Family Plethodidae　プレトドゥス科 (絶滅)　※＋Bananogmiidae（Bananogmiiformes）、Thryptodontidae。
　　　　　　　　Family Protobramidae　プロトブラマ科 (絶滅)　※＋Digoriidae、Thryptodontidae。→Tselfatiidae。
　　　　　　　　Family Tselfatiidae　トセルファティア科 (絶滅)　※→Plethodidae。
　　　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　　　Genus Aethocephalichthys FIELITZ, STEWART & WIFFEN 1999　アエトケファリクティス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　Aethocephalichthys hyainarhinos Fielitz, Stewart & Wiffen 1999 (絶滅)
　　　　　　　　　Genus Concavotectum　コンカウォテクトゥム属 (絶滅)
　　　　　　　　　　Concavotectum moroccense Cavin & Forey 2008 (絶滅)
　　　　　　　Order uncertain
　　　　　　　　　Genus Leufuichthys　レウフイクティス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　Leufuichthys minimus Gallo, Calvo & Kellner 2011 (絶滅)
　　　　　　　　　Genus Spratticeps PATTERSON 1970　スプラッティケプス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　Spratticeps gaultina Patterson 1970 (絶滅)
　　　　　　　　　Genus Pseudoellimma DE FIGUEIREDO 2009　プセウドエリムマ属 (絶滅)
　　　　　　　　　　Pseudoellimma gallae de Figueiredo 2009 (絶滅)
　　　　　　SUPER-ORDER OSTEOGLOSSOMORPHA オステオグロッスム上目
　　　　　　　Order Icthyodectiformes　イクティオデクテス目 (絶滅)
　　　　　　　　Family Allothrissopidae　アルロトリッソプス科 (絶滅)
　　　　　　　　Family Cladocyclidae　クラドキクルス科 (絶滅)　※←Cladocyclinae, Ichthyodectidae。
　　　　　　　　Family Ichthyodectidae　イクティオデクテス科 (絶滅)
　　　　　　　　Family Saurodontidae　サウロドン科 (絶滅)　※←Saurodontinae, Ichthyodectidae。
　　　　　　　　Family Unamichthyidae　ウナミクティス科 (絶滅)　※←Unamichthyinae, Ichthyodectidae。
　　　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　　　Genus Arratiaelops TAVERNE 1999　アルラティアエロプス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　Arratiaelops vectensis Taverne 1999 (絶滅)
　　　　　　　　　Genus Dugaldia　ドゥガルディア属 (絶滅)　※同属名の植物有り。
　　　　　　　　　　Dugaldia emmelta Lees 1990 (絶滅)
　　　　　　　Order Osteoglossiformes オステオグロッスム目
　　　　　　　　Sub-Order Hiodontoidei ヒオドン亜目　"ハイオドン"　※目 Hiodontiformes に格上げする意見もある。
　　　　　　　　　Family Hiodontidae　ヒオドン科　"歯ニシン"
　　　　　　　　　Family Huashiidae　フアシア科 (絶滅)
　　　　　　　　　Family Jiaohichthyidae　イアオヒクティス科 (絶滅)　※→Hiodontidae。
　　　　　　　　　Family Kuyangichthyidae　クヤンギクティス科 (絶滅)
　　　　　　　　Sub-Order Mormyroidei　モルミルス亜目　※→ナギナタナマズ亜目。
　　　　　　　　　Family Gymnarchidae　ギムナルクス科　※モルミルス科の亜科に格下げする意見もある。
　　　　　　　　　Family Mormyridae　モルミルス科
　　　　　　　　Sub-Order Notopteroidei　ナギナタナマズ亜目　※ヒオドン亜目に関連付けられる。
　　　　　　　　　Family Kipalaichthyidae　キパライクティス科 (絶滅)　※→Bathyclupeidae？
　　　　　　　　　Family Notopteridae　ナギナタナマズ科
　　　　　　　　　Family Ostariostomidae　オスタリオストマ科 (絶滅)
　　　　　　　　　Family Wakinoichthiidae　ワキノイクティス科 (絶滅)
　　　　　　　　Sub-Order Osteoglossoidei　オステオグロッスム亜目
　　　　　　　　　Family Arapaimatidae　アラパイマ科　※＝Arapaimidae。
　　　　　　　　　　Sub-Family Arapaimatinae　アラパイマ亜科　※＝Arapaiminae。
　　　　　　　　　　Sub-Family Heterotidinae　ヘテロティス亜科　※←Heterotididae。
　　　　　　　　　Family Osteoglossidae　オステオグロッスム科　※＋Foreyichthyidae。
　　　　　　　　　Family Pantodontidae　パントドン科
　　　　　　　　　Family Phareodontidae　ファレオドゥス科 (絶滅)
　　　　　　　　　Family Singididae　シンギダ科 (絶滅)　※→PHAREODONTIDAE。
　　　　　　　　Sub-Order uncertain
　　　　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　　　　Genus Shuleichthys　スレイクティス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Shuleichthys brachypteryx Murray, You & Peng 2010 (絶滅)
　　　　　　　Order Lycopteriformes　リコプテラ目 (絶滅)
　　　　　　　　Family Jiuquanichthyidae　イウクアニクティス科 (絶滅)
　　　　　　　　Family Lycopteridae　リコプテラ科 (絶滅)
　　　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　　　Genus Xixiaichthys　キシキシアイクティス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　Xixiaichthys tongxinensis Zhang 2004 (絶滅)
　　　　　　SUPER-ORDER OSTARIOPHYSI 骨鰾上目
　　　　　　　SERIES AOTOPHYSI 前骨鰾系
　　　　　　　　Order Gonorynchiformes Regan 1909 ネズミギス目
　　　　　　　　　Sub-Order Chanoidei　サバヒー亜目
　　　　　　　　　　Family Chanidae サバヒー科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Chaninae　サバヒー亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Rubiesichthyinae　ルビエシクティス亜科 (絶滅)
　　　　　　　　　　Family Charitosomidae　カリトストムス科 (絶滅)　※→Chanidae。
　　　　　　　　　Sub-Order Gonorynchoidei　ネズミギス亜目
　　　　　　　　　　Family Apulichthyidae　アプリクティス科 (絶滅)
　　　　　　　　　　Family Gonorynchidae ネズミギス科
　　　　　　　　　　Family Halecopsididae　ハレコプシス科 (絶滅)
　　　　　　　　　　Family Judeichthyidae　ユデイクティス科 (絶滅)　※→Gonorynchidae。
　　　　　　　　　Sub-Order Knerioidei　クネリア亜目
　　　　　　　　　　Family Kneriidae　クネリア科
　　　　　　　　　　Family Phractolaemidae　フラクトラエムス科　※→しばしばクネリア科Phractolaeminae。
　　　　　　　　Order Sorbininardiformes ソルビニナルドゥス目 (絶滅)
　　　　　　　　　　Family Sorbininardidae　ソルビニナルドゥス科 (絶滅)
　　　　　　　SERIES OTOPHYSI 骨鰾系
　　　　　　　　Order Characiformes カラックス目（＝カラシン目）　※以前は電気ウナギ目と共にコイ目（これの亜目）に含められていた。
　　　　　　　　　Sub-Order Citharinoidei　キタリヌス亜目
　　　　　　　　　　Family Citharinidae　キタリヌス科
　　　　　　　　　　Family Distichodontidae　ディスティコドゥス科（＋Ichthyborinae）　※亜科Distichodontinaeが格上げ。
　　　　　　　　　Sub-Order Characoidei　カラックス亜目（＝カラシン亜目）
　　　　　　　　　　African (old-world) Characoids
　　　　　　　　　　　Family Alestidae　アレステス科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Alestinae　アレステス亜科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Hydrocyninae　ヒドロキヌス亜科　※←Hydrocynidae。
　　　　　　　　　　　Family Hepsetidae　ヘプセトゥス科
　　　　　　　　　　South-American (new-world) Characoids
　　　　　　　　　　　Super-Family Anostomoidea　アノストムス上科　※＋Curimatoidea。
　　　　　　　　　　　　Family Anostomidae　アノストムス科
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Anostominae　アノストムス亜科
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Leporellinae　レポレルルス亜科
　　　　　　　　　　　　Family Chilodontidae　キロドゥス科　※→Anostomidae・若しくはCurimatidae内Chilodontinae。
　　　　　　　　　　　　Family Curimatidae　クリマタ科
　　　　　　　　　　　　Family Prochilodontidae　プロキロドゥス科　※→Curimatidae内Prochilodontinae。
　　　　　　　　　　　Super-Family Caracoidea　カラックス上科（＝カラシン上科）
　　　　　　　　　　　　Family Characidae　カラックス科（＝カラシン科）
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Agoniatinae　アゴニアテス亜科
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Aphyocharacinae　アフィオカラックス亜科
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Aphyoditeinae　アフィオディテ亜科
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Brycinae　ブリコン亜科　※←Brycidae。
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Characinae　カラックス亜科（＝カラシン亜科）
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Cheirodontinae　ケイロドン亜科　※←Cheirodontidae。
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Clupeacharacinae　クルペオカラックス亜科
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Cynopotaminae　キノポタムス亜科　※←Cynopotamidae。→Characinae。
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Glandulocaudinae　グランデュロカウダ亜科　※←Glandulocaudidae。＋Stevardiinae。
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Gymnocharacinae　ギムノカラキヌス亜科
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Heterocharacinae　ヘテロカラックス亜科
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Iguanodectinae　イグアノデクテス亜科
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Rhoadsiinae　ロアドシア亜科
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Salmininae　サルミヌス亜科
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Serrasalminae　セルラサルムス亜科　※←Serrasalmidae。科への引き上げ機運上昇。
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Stethapriinae　ステタプリオン亜科　※＝Stethaprioninae。←Stethaprionidae。
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Tetragonopterinae　テトラゴノプテルス亜科　※←Tetragonopteridae。
　　　　　　　　　　　　Family Gasteropelecidae　ガステロペレクス科
　　　　　　　　　　　Super-Family Crenuchoidea　クレヌクス上科
　　　　　　　　　　　　Family Crenuchidae　クレヌクス科
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Characidiinae　カラキディウム亜科　※←Characidiidae。
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Crenuchinae　クレヌクス亜科
　　　　　　　　　　　Super-Family Cynodontoidea　キノドン上科
　　　　　　　　　　　　Family Acestrorhynchidae　アケストロリンクス科
　　　　　　　　　　　　Family Cynodontidae　キノドン科
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Cynodontinae　キノドン亜科
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Roestinae　ロエステス亜科
　　　　　　　　　　　Super-Family Erythrinoidea　エリトリヌス上科
　　　　　　　　　　　　Family Chalceidae　カルケウス科　→Bryconinae, Characidae？
　　　　　　　　　　　　Family Ctenoluciidae　クテノルキウス科
　　　　　　　　　　　　Family Erythrinidae　エリトリヌス科
　　　　　　　　　　　　Family Lebiasinidae　レビアシナ科
　　　　　　　　　　　Super-Family Parodontoidea　パロドン上科
　　　　　　　　　　　　Family Hemiodontidae　ヘミオドゥス科
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Anodinae　アノドゥス亜科　※→Hemiodontinae。
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Hemiodontinae　ヘミオドゥス亜科
　　　　　　　　　　　　Family Parodontidae　パロドン科
　　　　　　　　　Sub-Order uncertain
　　　　　　　　　　　Family Salminopsidae　サルミノプス科 (絶滅)　※→Gonorynchiformes。
　　　　　　　　　　　Family Sorbinicharacidae　ソルビニカラックス科 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　　　　　　Genus Arabocharax Micklich & ROSCHER 1990　アラボカラックス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　Arabocharax baidensis Micklich & Roscher 1990 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　Genus Eurocharax　エウロカラックス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　Eurocharax tourainei Gaudant 1980 (絶滅)
　　　　　　　　Order Cypriniformes GOODRICH 1909 コイ目
　　　　　　　　　Super-Family Cobitoidea　ドジョウ上科　※＋Catostomoidea。
　　　　　　　　　　Family Balitoridae　タニノボリ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Balitorinae　タニノボリ亜科　※＋Ellopostomatidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Nemacheilinae　フクドジョウ亜科
　　　　　　　　　　Family Catostomidae　カトストムス科　※＝Catostomatidae。Catostomoidea。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Catostominae　カトストムス亜科　※北米。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Cycleptinae　キクレプトゥス亜科　※北米。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Ictiobinae　イクティオブス亜科　※北米。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Myxocyprininae　ミクソキプリヌス亜科　※東アジア。
　　　　　　　　　　Family Cobitidae　ドジョウ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Botiinae　アユモドキ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Cobitinae　ドジョウ亜科
　　　　　　　　　　Family Gyrinocheilidae　ギリノケイルス科　※Catostomoidea。
　　　　　　　　　Super-Family Cyprinoidea　コイ上科　※＋Paedocypridoidea。
　　　　　　　　　　Family Cyprinidae　コイ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Abramidinae　アブラミス亜科　※ウグイ亜科へ統合する意見あり。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Acheilognathinae　タナゴ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Alburninae　アルブルヌス亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Barbinae　バルブス亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Chondrostominae　コンドロストマ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Cultrinae　カワヒラ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Cyprininae　コイ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Danioninae　シマヒメハヤ亜科　※→Rasborinae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Gobioninae　カマツカ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Labeoninae　ラベオ亜科　※→Barbinae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Leuciscinae　ウグイ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Rasborinae　ハエジャコ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Schizothoracinae　スキゾトラックス亜科　※→Barbinae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Squaliobarbinae　ソウギョ亜科　※→Cyprininae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Tincinae　ティンカ亜科　※→Cyprininae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Xenocyprinae　キセノキプリス亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Xenocyprioidinae　キセノキプリオイデス亜科
　　　　　　　　　　Family Psilorhynchidae　プシロリンクス科
　　　　　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　　　　　Genus Molinichthys モリニクティス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　Molinichthys inopinatus Gayet 1982 (絶滅)
　　　　　　　　Order Gymnotiformes デンキウナギ目　※コイ目・ナマズ目に含まれていた。
　　　　　　　　　Sub-Order Gymnotoidei デンキウナギ亜目
　　　　　　　　　　Family Electrophoridae デンキウナギ科　※→Gymnotidae。
　　　　　　　　　　Family Gymnotidae ギムノトゥス科
　　　　　　　　　Sub-Order Sternopygoidei ステルノピグス亜目
　　　　　　　　　　Super-Family Apteronotoidea　アプテロノトゥス上科
　　　　　　　　　　　Family Apteronotidae　アプテロノトゥス科
　　　　　　　　　　　Family Sternopygidae　ステルノピグス科
　　　　　　　　　　Super-Family Rhamphichthyoidea　ラムフィクティス上科
　　　　　　　　　　　Family Hypopomidae　ヒポポムス科
　　　　　　　　　　　Family Rhamphichthyidae　ラムフィクティス科
　　　　　　　　Order Siluriformes Hay 1929 ナマズ目
　　　　　　　　　SUPER-FAMILY ARIOIDEA　ハマギギ上科　※Bagridaeより分離独立。
　　　　　　　　　　Family Ariidae　ハマギギ科　※＋Doiichthyidae、Tachysuridae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Ariinae　ハマギギ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Galeichthyinae　ガレイクティス亜科
　　　　　　　　　　Family Anchariidae　アンカリウス科　※Ariidaeより分離独立。
　　　　　　　　　　Family Mochokidae サカサナマズ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Chiloglanidinae　キログラニス亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Mochokinae　サカサナマズ亜科
　　　　　　　　　SUPER-FAMILY BAGROIDEA　ギギ上科
　　　　　　　　　　Family Amphiliidae　アムフィリウス科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Amphiliinae　アムフィリウス亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Doumeinae　ドウメア亜科　※←Doumeidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Leptoglanidinae　レプトグラニス亜科　※←Leptoglanididae。
　　　　　　　　　　Family Austroglanididae　アウストログラニス科
　　　　　　　　　　Family Bagridae　ギギ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Bagrinae　ギギ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Ritinae　リタ亜科　※←Horabagridae。
　　　　　　　　　　Family Bachmanniidae　バクマンニア科 (絶滅)　※→Diplomystidae？
　　　　　　　　　　Family Claroteidae　クラロテス科　※Bagridaeより分離独立。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Auchenoglanidinae　アウケノグラニス亜科　※←Auchenoglanididae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Claroteinae　クラロテス亜科
　　　　　　　　　　Family Diplomystidae　ディプロミステス科
　　　　　　　　　　Family Lacantuniidae　ラカントゥニア科
　　　　　　　　　　Family Olyridae　オリラ科　※Bagridaeより分離独立。
　　　　　　　　　　Family Pangasiidae　メコンオオナマズ科
　　　　　　　　　　Family Schilbidae　スキルベ科　※＝Schilbeidae。
　　　　　　　　　SUPER-FAMILY CLARIOIDEA　ヒレナマズ上科　※Siluroideaより分離独立。
　　　　　　　　　　Family Clariidae　ヒレナマズ科
　　　　　　　　　　Family Heteropneustidae　ヘテロプネウステス科
　　　　　　　　　　Family Malapteruridae デンキナマズ科
　　　　　　　　　SUPER-FAMILY ICTALUROIDEA　アメリカナマズ上科　※BAGROIDEAより分離独立。
　　　　　　　　　　Family Cranoglanididae　クラノグラニス科　※Bagridaeより分離独立。
　　　　　　　　　　Family Ictaluridae　アメリカナマズ科
　　　　　　　　　SUPER-FAMILY SISOROIDEA　シソル上科→ギギ上科
　　　　　　　　　　Family Akysidae　アキシス科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Akysinae　アキシス亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Parakysinae　パラキシス亜科　※←Parakysidae。
　　　　　　　　　　Family Amblycepidae　アカザ科　※＝Amblycipitidae。
　　　　　　　　　　Family Chacidae　カカ科
　　　　　　　　　　Family Erethistidae　エレティステス科
　　　　　　　　　　Family Sisoridae　シソル科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Glyptosterinae　グリプトステルノン亜科　※←Glyptosteridae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Sisorinae　シソル亜科　※＋Bagarinae。
　　　　　　　　　SUPER-FAMILY DORADOIDEA　ドラス上科
　　　　　　　　　　Family Aspredonidae　アスプレド科　←＝Aspredinidae。SISOROIDEA（人為分類）より。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Aspredoninae　アスプレド亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Bunocephalinae　ブノケファルス亜科　※←Bunocephalidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Hoplomyzontinae　ホプロミゾン亜科
　　　　　　　　　　Family Auchenipteridae　アウケニプテルス科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Ageneiosinae　アゲネイオスス亜科　※←Ageneiosidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Auchenipterinae　アウケニプテルス亜科　※＋Asterophysidae、Trachycorystidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Centromochlinae　ケントロモクルス亜科　※←Centromochlidae。
　　　　　　　　　　Family Cetopsidae　ケトプシス科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Cetopsinae　ケトプシス亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Helogeninae　ヘロゲネス亜科　※←Helogenidae。
　　　　　　　　　　Family Doradidae　ドラス科　※Doridaeは軟体動物。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Astrodoradinae　アストロドラス亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Doradinae　ドラス亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Platydoradinae　プラティドラス亜科
　　　　　　　　　SUPER-FAMILY HYPSIDOROIDEA　ヒプシドリス上科 (絶滅)
　　　　　　　　　　Family Hypsidoridae　ヒプシドリス科 (絶滅)
　　　　　　　　　SUPER-FAMILY LORICARIOIDEA　ロリカリア上科
　　　　　　　　　　Family Astroblepidae　アストロブレプス科
　　　　　　　　　　Family Callichthyidae カワリナマズ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Callichthyinae　カワリナマズ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Corydoradinae　コリドラス亜科
　　　　　　　　　　　　Tribe Aspidoradini　アスピドラス連
　　　　　　　　　　　　Tribe Corydoradini　コリドラス連
　　　　　　　　　　Family Loricariidae ヒモナマズ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Ancistrinae アンキストルス亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Hypoptopominae ヒポプトポマ亜科 "オトキンクルス"
　　　　　　　　　　　Sub-Family Hypostominae ヒポストムス亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Lithogeneinae リトゲネス亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Loricariinae ヒモナマズ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Neoplecostominae ネオプレコストムス亜科　※←Neoplecostomidae。
　　　　　　　　　　Family Scoloplacidae　スコロプラックス科　※Loricariidae（内Scoloplacinae）より分離独立。Lacantuniidae？
　　　　　　　　　　Family Trichomycteridae　ヒルナマズ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Copionodontinae　コピオノドン亜科　※←Copionodontidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Glanapteryginae　グラナプテリクス亜科　※←Glanapterygidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Sarcoglanidinae　サルコグラニス亜科　※←Sarcoglanididae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Stegophilinae　ステゴフィルス亜科　※←Stegophilidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Trichomycterinae　トリコミクテルス亜科　※＋Pygidiidae、Trichogeninae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Tridentinae　トリデンス亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Vandelliinae　ウァンデリリア亜科
　　　　　　　　　　Family Nematogenyidae　ネマトゲニス科　※Trichomycteridaeから分離独立。
　　　　　　　　　SUPER-FAMILY PIMELODOIDEA　ピメロドゥス上科　※Bagroideaより分離独立。
　　　　　　　　　　Family Heptapteridae　ヘプタプテルス科　※Rhamdiinae, Pimelodidaeより分離独立。
　　　　　　　　　　Family Pimelodidae　ピメロドゥス科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Hypophthalminae　ヒポフタルムス亜科　※←Hypophthalmidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Pimelodinae　ピメロドゥス亜科
　　　　　　　　　　Family Pseudopimelodidae　プセウドピメロドゥス科　※Pimelodidaeより分離独立。
　　　　　　　　　SUPER-FAMILY SILUROIDEA　ナマズ上科
　　　　　　　　　　Family Plotosidae　ゴンズイ科
　　　　　　　　　　Family Siluridae　ナマズ科
　　　　　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　　　　　Genus Siluroideorum シルロイデオルム属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　Siluroideorum loricatorum (絶滅)
　　　　　　　　　SUPER-FAMILY uncertain
　　　　　　　　　　Family Andinichthyidae アンディニクティス科 (絶滅)
　　　　　　　　　　Family Vorhisiidae　ウォリシア科 (絶滅)　※最古のナマズ。
　　　　　INFRA-DIVISION EUTELEOSTEI 正真骨下区　※＝Euteleosteomorpha。
　　　　　　SUPER-ORDER PROTACANTHOPTERYGII 原棘鰭上目
　　　　　　　Order Esociformes カワカマス目　※Salmoniformes内Esocoideiより格上げ。
　　　　　　　　Family Esocidae　カワカマス科
　　　　　　　　Family Palaeoesocidae　パラエオエソックス科 (絶滅)　※クロウオ科より分離独立。
　　　　　　　　Family Umbridae　クロウオ科
　　　　　　　　　Sub-Family Novumbrinae　アメリカクロウオ亜科
　　　　　　　　　Sub-Family Umbrinae　クロウオ亜科
　　　　　　　　　　Genus Dallia　ダリリア属
　　　　　　　　　　Genus Umbra　クロウオ属
　　　　　　　　　　　Sub-Genus Melanura Agassiz 1853　メラヌラ亜属
　　　　　　　　　　　Sub-Genus Umbra Agassiz 1853　クロウオ亜属
　　　　　　　Order Salmoniformes Greenwood, Rosen, Weitzman & Myers 1966 サケ目
　　　　　　　　　Family Salmonidae　サケ科
　　　　　　　　　　Sub-Family Coregoninae　シナノユキマス亜科　※←Coregonidae。
　　　　　　　　　　Sub-Family Salmoninae　サケ亜科
　　　　　　　　　　Sub-Family Thymallinae　カワヒメマス亜科　※←Thymallidae。
　　　　　　　　　Family Spaniodontidae　スパニオドン科 (絶滅)
　　　　　　　　　Family Thaumaturidae　タウマトゥルス科 (絶滅)
　　　　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　　　　Genus Britoichthys ブリトイクティス属 (絶滅)　※詳細不明、取り敢えず。
　　　　　　　　　　　Britoichthys marizalensis de Figueiredo 2004 (絶滅)
　　　　　　　　　　Genus Chardonius TAVERNE 1975 カルドニウス属 (絶滅)　※同属名の植物あり。
　　　　　　　　　　　Chardonius longicaudatus Taverne 1975 (絶滅)　※記載年不明。
　　　　　　　　　　Genus Goudkoffia ゴウドコッフィア属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Goudkoffia delicata David 1946 (絶滅)
　　　　　　　　　　Genus Helgolandichthys ヘルゴランディクティス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Helgolandichthys schmidi Taverne 1981 (絶滅)
　　　　　　　　　　Genus Jilingichthys ZHOU 1976 イリンギクティス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Jilingichthys rapax Zhou 1976 (絶滅)
　　　　　　　　　　Genus Leucichthyops レウキクティオプス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Leucichthyops vagans Cockerell 1918 (絶滅)
　　　　　　　　　　Genus Natlandia ナトランディア属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Natlandia ornata David 1946 (絶滅)
　　　　　　　　　　Genus Procharacinus プロカラキヌス属 (絶滅)　※始新生。カラシンではない。
　　　　　　　　　　　Procharacinus arverniensis Piton 1938 (絶滅)
　　　　　　　　　　Genus Prohydrocyon プロヒドロキオン属 (絶滅)　※始新生。カラシンではない。
　　　　　　　　　　　Prohydrocyon pellegrini Piton 1938 (絶滅)
　　　　　　　　　　Genus Pseudoleptolepis　プセウドレプトレピス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Pseudoleptolepis minor Taverne 1975 (絶滅)
　　　　　　　　　　Genus Pyrenichthys　ピレニクティス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Pyrenichthys jauzaci Gayet 1985 (絶滅)
　　　　　　　　　　Genus Santanasalmo サンタナサルモ属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Santanasalmo elegans Gallo, de Figueiredo & Azevedo 2009 (絶滅)
　　　　　　　Order Osmeriformes キュウリウオ目
　　　　　　　　Sub-Order Alepocephaloidei セキトリイワシ亜目　※ニギス目 Argentiniformes を立て編入する意見もある。
　　　　　　　　　Family Alepocephalidae　セキトリイワシ科
　　　　　　　　　Family Bathylaconidae　バティラコ科
　　　　　　　　　Family Leptochilichthyidae　オ二イワシ科
　　　　　　　　　Family Orthogonikleithridae　オルトゴニクレイトルス科 (絶滅)
　　　　　　　　　Family Platytroctidae　ハナメイワシ科
　　　　　　　　Sub-Order Argentinoidei ニギス亜目　※目に格上げ・キュウリウオ目を立て編入する意見もある。
　　　　　　　　　Family Argentinidae　ニギス科
　　　　　　　　　Family Bathylagidae　ソコイワシ科
　　　　　　　　　Family Microstomatidae　サケイワシ科　※←Microstomatinae, Argentinidae。
　　　　　　　　　Family Opisthoproctidae　デメニギス科
　　　　　　　　　Family Pattersonellidae　パッテルソネルラ科 (絶滅)
　　　　　　　　Sub-Order Osmeroidei キュウリウオ亜目
　　　　　　　　　Super-Family Galaxioidea　ガラクシアス上科
　　　　　　　　　　Family Galaxiidae　ガラクシアス科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Aplochitinae　アプロキトン亜科　※＝Aplochitoninae。←Aplochitonidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Galaxiinae　ガラクシアス亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Lovettinae　ロウェッティア亜科　※→Aplochitinae。
　　　　　　　　　　Family Lepidogalaxiidae　レピドガラクシアス科　※Galaxiidaeの亜科Lepidogalaxiinaeより格上げ。
　　　　　　　　　　Family Retropinnidae　ミナミキュウリウオ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Prototroctinae　ニュージーランドミナミアユ亜科　※←Prototroctidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Retropinninae　レトロピンナ亜科
　　　　　　　　　Super-Family Osmeroidea　キュウリウオ上科
　　　　　　　　　　Family Osmeridae　キュウリウオ科
　　　　　　　　　　Family Plecoglossidae　アユ科
　　　　　　　　　　Family Salangidae　シラウオ科
　　　　　　　Order uncertain
　　　　　　　　　　　Genus Acanthopterygiorum　アカントプテリギオルム属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　Acanthopterygiorum acutirostrum (Nolf 1973) (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　　syn.? Otolithus acutirostrus Nolf & Nolf 1972 non Holec 1975
　　　　　　　　　　　Genus Euteleosteorum　エウテレオステオルム属 (絶滅)　※Otoliths＝耳石。
　　　　　　　　　　　　Euteleosteorum crassum (Weiler 1963) (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　　syn.Otolithus (Genus incertae sedis) crassus Weiler 1963
　　　　　　　　　　　　Euteleosteorum geometricum Nolf 2004 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Genus Protacanthopterygiorum　プロタカントプテリギオルム属 (絶滅)　※Otoliths＝耳石。
　　　　　　　　　　　　Protacanthopterygiorum scalpellum Nolf 2004 (絶滅)
　　　　　　SUPER-ORDER STENOPTERYGII 狭鰭上目
　　　　　　　Order Ateleopodiformes　シャチブリ目　※＝Ateleopodomorpha。
　　　　　　　　Family Ateleopodidae　シャチブリ科
　　　　　　　Order Stomiiformes　ワニトカゲギス目　※＝Stomiatiformes。
　　　　　　　　Sub-Order Gonostomatoidei　ヨコエソ亜目
　　　　　　　　　Family Gonostomatidae　ヨコエソ科
　　　　　　　　　Family Sternoptychidae　ムネエソ科
　　　　　　　　　　Sub-Family Maurolicinae　キュウリエソ亜科　※←Maurolicidae。
　　　　　　　　　　Sub-Family Sternoptychinae　ムネエソ亜科
　　　　　　　　Sub-Order Photichthyoidei　ギンハダカ亜目　※→Stomioidei。
　　　　　　　　　Family Phosichthyidae　ギンハダカ科　※＝Photichthyidae。
　　　　　　　　Sub-Order Stomioidei　ワニトカゲギス亜目　※＝Stomiatoidei。
　　　　　　　　　Family Stomiidae　ワニトカゲギス科　※＝Stomiatidae。
　　　　　　　　　　Sub-Family Astronesthinae　トカゲハダカ亜科　※←Astronesthidae。
　　　　　　　　　　Sub-Family Chauliodontinae　ホウライエソ亜科　※←Chauliodontidae。
　　　　　　　　　　Sub-Family Idiacanthinae　ミツマタヤリウオ亜科　※←Idiacanthidae。
　　　　　　　　　　Sub-Family Malacosteinae　オオクチホシエソ亜科　※←Malacosteidae。
　　　　　　　　　　Sub-Family Melanostomiinae　カンテントカゲギス亜科　※←Melanostomiidae。
　　　　　　　　　　Sub-Family Stomiinae　ワニトカゲギス亜科　※＝Stomiatinae。
　　　　　　　　Sub-Order uncertain
　　　　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　　　　　Genus Idrissia　イドリッシア属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　Idrissia turkmenica Prokofiev 2005 (絶滅)
　　　　　　SUPER-ORDER CYCLOSQUAMATA 円鱗上目
　　　　　　　Order Aulopiformes ROSEN 1973　ヒメ目　※＝ALEPISAURIFORMES。亜目に格下げする意見あり。
　　　　　　　　Sub-Order Alepisauroidei　ミズウオ亜目
　　　　　　　　　Family Alepisauridae　ミズウオ科
　　　　　　　　　Family Anotopteridae　ミズウオダマシ科
　　　　　　　　　Family Evermannellidae　ヤリエソ科
　　　　　　　　　Family Omosudidae　キバハダカ科
　　　　　　　　　Family Paralepididae　ハダカエソ科
　　　　　　　　　Family Scopelarchidae　デメエソ科
　　　　　　　　Sub-Order Aulopoidei　ヒメ亜目　※＝Aulopioidei、Synodontoidei。
　　　　　　　　　Family Aulopidae　ヒメ科
　　　　　　　　　Family Pseudotrichonotidae　ホタテエソ科
　　　　　　　　　Family Synodontidae　エソ科　※＝Synodidae。
　　　　　　　　　　Sub-Family Harpadontinae　ミズテング亜科　※←Harpadontidae。
　　　　　　　　　　Sub-Family Synodontinae　アカエソ亜科
　　　　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　　　　　Genus Aulopoideorum　アウロポイデオルム属 (絶滅)　※Otoliths＝耳石。
　　　　　　　　　　　　Aulopoideorum sp.'Tklkosteens' (絶滅)
　　　　　　　　　　　　Dabachania nebulosa (Daniltshenko 1962) (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　　syn.Prooargentina nebulosa Daniltshenko 1962
　　　　　　　　　　　Genus Synodontoideorum　シノドントイデオルム属 (絶滅)　※Otoliths＝耳石。
　　　　　　　　　　　　Synodontoideorum pseudosphyraenum Nolf 2004 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Genus Volcichthys　ウォルキクティス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　Volcichthys dainellii Goody 1968 (絶滅)
　　　　　　　　Sub-Order Chlorophthalmoidei　アオメエソ亜目　※Alepisauroideiに統合する意見がある。
　　　　　　　　　Family Bathysauroididae　オニアオメエソ科
　　　　　　　　　Family Bathysauropsidae　バティサウロプシス科
　　　　　　　　　Family Chlorophthalmidae　アオメエソ科
　　　　　　　　　Family Ipnopidae　チョウチンハダカ科　※＋Bathypteroidae。
　　　　　　　　　Family Notosudidae　フデエソ科
　　　　　　　　　Family Paraulopidae　モンアオメエソ科 ※Chlorophthalmidaeより分離独立。
　　　　　　　　Sub-Order Giganturoidei　望遠魚亜目
　　　　　　　　　Family Bathysauridae　シンカイエソ科　※＋Macristiidae, Ctenothrissiformes。
　　　　　　　　　Family Giganturidae　ボウエンギョ科
　　　　　　　　Sub-Order Enchodontoidei sensu NELSON 1994　エンコドゥス亜目 (絶滅)　※Salmoniformesより移動。
　　　　　　　　　Super-Family Cimolichthyoidea NELSON 1994　キモリクティス上科 (絶滅)　※＝Cimolichthyoidei, Salmoniformes。→Alepisauroidei？
　　　　　　　　　　Family Cimolichthyidae　キモリクティス科 (絶滅)
　　　　　　　　　　Family Dercetididae　デルケティス科 (絶滅)　※＝Dercetidae。
　　　　　　　　　　Family Prionolepididae　プリオノレピス科 (絶滅)　※→デルケティス科。
　　　　　　　　　Super-Family Enchodontoidea　エンコドゥス上科 (絶滅)　※＝Enchodontoidei, Salmoniformes。
　　　　　　　　　　Family Enchodontidae　エンコドゥス科 (絶滅)　"牙鮭類"
　　　　　　　　　　Family Eurypholidae　エウリフォリス科 (絶滅)　※←Eurypholinae, Enchodontidae。
　　　　　　　　　Super-Family Halecoidea　ハレク上科 (絶滅)　※＝Halecoidei, Salmoniformes。→Haleciformes？
　　　　　　　　　　Family Halecidae　ハレク科 (絶滅)
　　　　　　　　　　Family Nardorexidae　ナルドレックス科
　　　　　　　　　　Family Serrilepididae　セルリレピス科 (絶滅)　※→Halecidae。
　　　　　　　　　Super-Family Ichthyotringoidea　イクティオトリンガ上科 (絶滅)　※＝Ichthyotringoidei, Salmoniformes。
　　　　　　　　　　Family Apateopholidae　アパテオフォリス科 (絶滅)　※Ichthyotringidaeより分離独立。
　　　　　　　　　　Family Cheirothricidae　ケイロトリックス科 (絶滅)　※＋Derrhiidae。
　　　　　　　　　　Family Ichthyotringidae　イクティオトリンガ科 (絶滅)
　　　　　　　　Sub-Order uncertain
　　　　　　　　　　Genus Aulopiformorum　アウロピフォルモルム属 (絶滅)　※Otoliths＝耳石。
　　　　　　　　　　　Aulopiformorum pseudocentrolophum Nolf 2004 (絶滅)
　　　　　　SUPER-ORDER SCOPELOMORPHA　ハダカイワシ上目
　　　　　　　ORDER MYCTOPHIFORMES　ハダカイワシ目
　　　　　　　　Family Myctophidae　ハダカイワシ科
　　　　　　　　　Sub-Family Eomyctophinae　エオミクトフム亜科 (絶滅)　※←Eomyctophidae。
　　　　　　　　　Sub-Family Lampanyctinae　トミハダカ亜科　※←Lampanyctidae。
　　　　　　　　　Sub-Family Myctophinae　ハダカイワシ亜科
　　　　　　　　Family Neoscopelidae　ソトオリイワシ科
　　　　　　　　Family Osmeroididae　オスメロイデス科 (絶滅)　※→Sardinoididae。
　　　　　　　　Family Sardinoididae　サルディノイデス科 (絶滅)　※→Neoscopelidaeの亜科、若しくはAulopiformes。
　　　　　　SUPER-ORDER LAMPRIDIOMORPHA　アカマンボウ上目　※棘条のないAcanthomorpha？
　　　　　　　ORDER LAMPRIDIFORMES　アカマンボウ目　※＝Allotriognathi。
　　　　　　　　Sub-Order Lampridoidei　アカマンボウ亜目
　　　　　　　　　Family Lamprididae　アカマンボウ科　※＝Lampridae。
　　　　　　　　　Family Turkmenidae　トゥルクメネ科 (絶滅)
　　　　　　　　Sub-Order Trachipteroidei　フリソデウオ亜目
　　　　　　　　　Family Lophotidae　アカナマダ科
　　　　　　　　　Family Radiicephalidae　ラディイケファルス科　※Gadiformesに近縁、PARACANTHOPTERYGIIへ移動予定。
　　　　　　　　　Family Regalecidae　リュウグウノツカイ科
　　　　　　　　　Family Trachipteridae　フリソデウオ科
　　　　　　　　Sub-Order Veliferoidei　クサアジ亜目
　　　　　　　　　Family Palaeocentrotidae　パラエオケントロトゥス科 (絶滅)
　　　　　　　　　Family Veliferidae　クサアジ科
　　　　　　　ORDER STYLEPHORIFORMES　スティレフォルス目　※←Stylephoroidei, LAMPRIDIFORMESより。
　　　　　　　　　Family Stylephoridae　スティレフォルス科
　　　　　　SUPER-ORDER POLYMIXIOMORPHA　ギンメダイ上目
　　　　　　　ORDER CTENOTHRISSIFORMES　クテノトリッサ目 (絶滅)
　　　　　　　　Family Aulolepididae　アウロレピス科 (絶滅)
　　　　　　　　Family Ctenothrissidae　クテノトリッサ科 (絶滅)
　　　　　　　ORDER PATTERSONICHTHYIFORMES　パッテルソニクティス目 (絶滅)
　　　　　　　　Family Pattersonichthyidae　パッテルソニクティス科 (絶滅)
　　　　　　　ORDER POLYMIXIIFORMES LOWE 1838　ギンメダイ目
　　　　　　　　Family Digoriidae　ディゴリア科 (絶滅)
　　　　　　　　Family Polymixiidae　ギンメダイ科
　　　　　　SUPER-ORDER PARACANTHOPTERYGII 側棘鰭上目　※＝ACANTHOMORPHA ROSEN 1973。
　　　　　　　ORDER LOPHIIFORMES GARMAN 1899 アンコウ目
　　　　　　　　SUB-ORDER ANTENNARIOIDEI カエルアンコウ亜目（aka.イザリウオ亜目）
　　　　　　　　　Family Antennariidae　カエルアンコウ科（aka.イザリウオ科）
　　　　　　　　　Family Brachionichthyidae　ブラキオニクティス科
　　　　　　　　　Family Lophichthyidae　ロフィクティス科
　　　　　　　　　Family Tetrabrachiidae　テトラブラキウム科
　　　　　　　　SUB-ORDER LOPHIOIDEI アンコウ亜目
　　　　　　　　　Family Lophiidae　アンコウ科
　　　　　　　　SUB-ORDER OGCOCEPHALIOIDEI アカグツ亜目
　　　　　　　　　SUPER-FAMILY CERATIOIDEA　チョウチンアンコウ上科　※チョウチンアンコウ亜目 Ceratioidei から格下げ。
　　　　　　　　　　Family Caulophrynidae　ヒレナガチョウチンアンコウ科
　　　　　　　　　　Family Centrophrynidae　ケントロフリネ科
　　　　　　　　　　Family Ceratiidae　ミツクリエナガチョウチンアンコウ科
　　　　　　　　　　Family Diceratiidae　フタツザオチョウチンアンコウ科
　　　　　　　　　　Family Gigantactinidae　シダアンコウ科
　　　　　　　　　　Family Himantolophidae　チョウチンアンコウ科
　　　　　　　　　　Family Linophrynidae　オニアンコウ科
　　　　　　　　　　Family Melanocetidae　クロアンコウ科
　　　　　　　　　　Family Neoceratiidae　ネオケラティアス科
　　　　　　　　　　Family Oneirodidae　ラクダアンコウ科
　　　　　　　　　　Family Thaumatichthyidae　タウマティクティス科
　　　　　　　　　SUPER-FAMILY CHAUNACIOIDEA　フサアンコウ上科
　　　　　　　　　　Family Chaunacidae　フサアンコウ科
　　　　　　　　　SUPER-FAMILY OGCOCEPHALIOIDEA　アカグツ上科
　　　　　　　　　　Family Ogcocephalidae　アカグツ科
　　　　　　　　Sub-Order uncertain
　　　　　　　　　　　Genus Lophiiformorum　ロフィイフォルモルム属 (絶滅)　※Otoliths＝耳石。
　　　　　　　　　　　　Lophiiformorum canovae Girone & Nolf 2009 (絶滅)
　　　　　　　ORDER BATRACHOIDIFORMES BERG 1937 ガマアンコウ目　※LophiiformesよりもGadiformesに近縁。
　　　　　　　　Family Batrachoididae　ガマアンコウ科
　　　　　　　　　Sub-Family Batrachoidinae　ガマアンコウ亜科
　　　　　　　　　Sub-Family Halophryninae　ハロフリネ亜科　※→Batrachoidinae。
　　　　　　　　　Sub-Family Porichthyinae　イサリビガマアンコウ亜科　※←Porichthyidae。
　　　　　　　　　Sub-Family Thalassophryninae　フチガマアンコウ亜科　※←Thalassophrynidae。
　　　　　　　ORDER GADIFORMES GOODRICH 1909 タラ目
　　　　　　　　SUB-ORDER GADOIDEI タラ亜目
　　　　　　　　　Family Bregmacerotidae　サイウオ科
　　　　　　　　　Family Gadidae　タラ科　＋Ranicipitidae。
　　　　　　　　　Family Lotidae　カワメンタイ科
　　　　　　　　　Family Melanonidae　カワリヒレダラ科
　　　　　　　　　Family Merlucciidae　ホキ科
　　　　　　　　　　Sub-Family Merlucciinae　ホキ亜科
　　　　　　　　　　Sub-Family Steindachneriinae　ヒカリダラ亜科　※←Steindachneriidae。
　　　　　　　　　Family Moridae　チゴダラ科
　　　　　　　　　Family Phycidae　ミナミアシナガダラ科
　　　　　　　　SUB-ORDER MACROUROIDEI ソコダラ亜目
　　　　　　　　　Family Euclichthyidae　アシナガダラ科
　　　　　　　　　Family Macrouridae　ソコダラ科
　　　　　　　　　　Sub-Family Bathygadinae　アナダラ亜科　※←Bathygadidae。
　　　　　　　　　　Sub-Family Macrourinae　ソコダラ亜科
　　　　　　　　　　Sub-Family Macrouroidinae　バケダラ亜科　※←Macrouroididae。
　　　　　　　　　　Sub-Family Trachyrincinae　トラキリンクス亜科　※←Trachyrincidae。
　　　　　　　　SUB-ORDER MURAENOLEPIDOIDEI　ウナギダラ亜目
　　　　　　　　　Family Muraenolepididae　ウナギダラ科
　　　　　　　ORDER OPHIDIIFORMES BERG 1937 アシロ目
　　　　　　　　SUB-ORDER BYTHITOIDEI フサイタチウオ亜目
　　　　　　　　　Family Aphyonidae　ソコオクメウオ科
　　　　　　　　　Family Bythitidae　フサイタチウオ科
　　　　　　　　　　Sub-Family Bythitinae　フサイタチウオ亜科
　　　　　　　　　　Sub-Family Brosmophycinae　リュウキュウイタチウオ亜科
　　　　　　　　　Family Parabrotulidae　ニセイタチウオ科
　　　　　　　　SUB-ORDER OPHIDIOIDEI アシロ亜目　※卵生。
　　　　　　　　　Family Carapidae　カクレウオ科
　　　　　　　　　　Sub-Family Carapinae　カクレウオ亜科
　　　　　　　　　　Sub-Family Pyramodontinae　オ二カクレウオ亜科　※←Pyramodontidae。
　　　　　　　　　　Sub-Family Tetragondacninae　テトラゴンダクヌス亜科
　　　　　　　　　Family Ophidiidae　アシロ科
　　　　　　　　　　Sub-Family Brotulinae　イタチウオ亜科　※←Brotulidae。
　　　　　　　　　　Sub-Family Brotulotaeniinae　ブロトゥロタエニア亜科
　　　　　　　　　　Sub-Family Neobythitinae　シオイタチウオ亜科　※←Neobythitidae。
　　　　　　　　　　Sub-Family Ophidiinae　アシロ亜科
　　　　　　　　　　Sub-Family Sirembinae　ウミドジョウ亜科　※→Ophidiinae。
　　　　　　　ORDER PERCOPSIFORMES BERG 1937 サケスズキ目　※タラ・アシロ目に近縁。
　　　　　　　　Family Amblyopsidae　洞窟魚科　"メクラサケスズキ"類
　　　　　　　　Family Aphredoderidae　カイゾクスズキ科　※＝Aphredoderoidei。スズキ目の上科 Aphredoderoidea から分離。
　　　　　　　　Family Asineopidae　アシネオプス科 (絶滅)
　　　　　　　　Family Percopsidae　サケスズキ科　※＝Percopsoidei。
　　　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　　　Genus Percopsiformorum　ペルコプシフォルモルム属 (絶滅)　※Otoliths＝耳石。
　　　　　　　　　　Percopsiformorum enigmaticum Schwarzhans 2003 (絶滅)
　　　　　　　　　　Percopsiformorum resonum Schwarzhans 2004 (絶滅)
　　　　　　　ORDER SPHENOCEPHALIFORMES　スフェノケファルス目 (絶滅)　※Sphenocephaloidei, PERCOPSIFORMESより格上げ。
　　　　　　　　Family Mcconichthyidae　モッコニクティス科 (絶滅)
　　　　　　　　Family Sphenocephalidae　スフェノケファルス科 (絶滅)
　　　　　　SUPER-ORDER ACANTHOPTERYGII 棘鰭上目
　　　　　　　SERIES ZEIMORPHA マトウダイ系
　　　　　　　　Order Zeiformes Regan 1909 マトウダイ目
　　　　　　　　　Sub-Order Cyttoidei　キットゥス亜目
　　　　　　　　　　Family Cyttidae　シロマトウ科
　　　　　　　　　Sub-Order Zeioidei　マトウダイ亜目
　　　　　　　　　　Family Grammicolepididae　ヒシマトウダイ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Grammicolepidinae　ヒシマトウダイ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Macrurocyttinae　マクルロキットゥス亜科　※←Macrurocyttidae。
　　　　　　　　　　Family Oreosomatidae　オオメマトウダイ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Oreosomatinae　オオメマトウダイ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Pseudocyttinae　ヒョウマトウダイ亜科
　　　　　　　　　　Family Parazenidae　ベニマトウダイ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Cyttopsidinae　カゴマトウダイ亜科　※←Cyttopsidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Parazeninae　ベニマトウダイ亜科
　　　　　　　　　　Family Zeidae　マトウダイ科
　　　　　　　　　　Family Zeniidae　ソコマトウダイ科　※＝Zenionidae。
　　　　　　　　　Sub-Order uncertain
　　　　　　　　　　Genus Cretazeus　クレタゼウス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Cretazeus rinaldii Tyler, Bronzi & Ghiandoni 2000 (絶滅)
　　　　　　　　　　Genus Zeiformorum　ゼイフォルモルム属 (絶滅)　※Otoliths＝耳石。
　　　　　　　　　　　Zeiformorum janni Schwarzhans 2003 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Zeiformorum tyleri Schwarzhans 2003 (絶滅)
　　　　　　　SERIES SMEGMAMORPHA スメグマ系
　　　　　　　　SUB-SERIES SYNBRANCHOMORPHA タウナギ亜系
　　　　　　　　　Order Synbranchiformes タウナギ目
　　　　　　　　　　Family Chaudhuriidae　カウドゥリア科
　　　　　　　　　　Family Mastacembelidae　トゲウナギ科　※←Mastacembeloidei, Perciformes。
　　　　　　　　　　Family Synbranchidae　タウナギ科
　　　　　　　　SUB-SERIES GASTEROSTEOMORPHA トゲウオ亜系
　　　　　　　　　Order Gasterosteiformes　トゲウオ目　※＋Gasterosteoidei sensu Britz & Johnson 2002。
　　　　　　　　　　Family Aulorhynchidae　アウロリンクス科
　　　　　　　　　　Family Gasterosteidae トゲウオ科
　　　　　　　　　　Family Hypoptychidae シワイカナゴ科
　　　　　　　　　Order Indostomiformes　インドストムス目　※Gasterosteiformesより分離独立。
　　　　　　　　　　Family Indostomidae インドストムス科
　　　　　　　　　Order Pegasiformes　ウミテング目　※Gasterosteiformesより分離独立。
　　　　　　　　　　Family Pegasidae ウミテング科
　　　　　　　　　Order Syngnathiformes　ヨウジウオ目
　　　　　　　　　　Family Aulostomidae　ヘラヤガラ科
　　　　　　　　　　Family Centriscidae　ヘコアユ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Centriscinae　へコアユ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Macroramphosinae　サギフエ亜科　※←Macroramphosidae。＋Aulorhamphidae。
　　　　　　　　　　Family Fistulariidae　ヤガラ科　※＝Fistularioididae。
　　　　　　　　　　Family Gerpegezhidae ゲルペゲズス科 (絶滅)　※＝Centriscidae？
　　　　　　　　　　Family Paraeoliscidae　パラエオリスクス科 (絶滅)
　　　　　　　　　　Family Parasynarcualidae パラシナルクアリス科 (絶滅)
　　　　　　　　　　Family Ramphosidae ラムフォスス科 (絶滅)
　　　　　　　　　　Family Solenostomidae カミソリウオ科
　　　　　　　　　　Family Syngnathidae ヨウジウオ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Hippocampinae タツノオトシゴ亜科　※←Hippocampidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Syngnathinae ヨウジウオ亜科
　　　　　　　　　　Family Urosphenidae　ウロスフェン科 (絶滅)　※Aulostomidaeより分離独立。
　　　　　　　　SUB-SERIES MUGILMORPHA ボラ亜系
　　　　　　　　　Order Mugiliformes Günther 1880 ボラ目
　　　　　　　　　　Family Mugilidae　ボラ科
　　　　　　　　SUB-SERIES ATHERINOMORPHA トウゴロウイワシ亜系
　　　　　　　　　Order Atheriniformes Rosen 1964 トウゴロウイワシ目
　　　　　　　　　　Family Atherinidae トウゴロウイワシ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Atherininae　トウゴロウイワシ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Atheriinae　ムギイワシ亜科　※＝Atherioninae。←Atheriidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Bleheratherininae　ブレヘリテリナ亜科
　　　　　　　　　　Family Atherinopsidae　アテリノプシス科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Atherinopsinae　アテリノプシス亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Menidiinae　メニディア亜科
　　　　　　　　　　Family Bedotiidae ベドティア科
　　　　　　　　　　Family Dentatherinidae デンタテリナ科
　　　　　　　　　　Family Melanotaeniidae メラノタエニア科
　　　　　　　　　　Family Notocheiridae ナミノハナ科 ※＝Isonidae。
　　　　　　　　　　Family Phallostethidae トウゴロウメダカ科
　　　　　　　　　　Family Pseudomugilidae プセウドムギル科
　　　　　　　　　　Family Rhamphognathidae　ラムフォグナトゥス科 (絶滅)　※＋Mesogasteridae。→Atherinidae。
　　　　　　　　　　Family Telmatherinidae テルマテリナ科
　　　　　　　　　Order Beloniformes Berg 1937 ダツ目　※＝Synentognathiformes、Synentognathi。
　　　　　　　　　　Sub-Order Adrianichthyoidei メダカ亜目
　　　　　　　　　　　Family Adrianichthyidae　メダカ科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Adrianichthyinae　アドリアニクティス亜科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Oryziinae　メダカ亜科　※←Oryziidae。＋Horaichthyinae
　　　　　　　　　　Sub-Order Belonoidei ダツ亜目
　　　　　　　　　　　Super-Family Belonoidea　ダツ上科
　　　　　　　　　　　　Family Belonidae　ダツ科　※Belidaeはゾウムシ類。
　　　　　　　　　　　Super-Family Exocoetoidea　トビウオ上科
　　　　　　　　　　　　Family Exocoetidae　トビウオ科
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Cypselurinae　トビウオ亜科　※←Cypseluridae。
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Exocoetinae　イダテントビウオ亜科
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Fodiatorinae　フォディアトル亜科
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Parexocoetinae　ツマリトビウオ亜科
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Rhamphexocoetinae　ラムフェクソコエトゥス亜科 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　Family Hemiramphidae　サヨリ科　※＋Cobitopsididae。
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Hemiramphinae　サヨリ亜科
　　　　　　　　　　　　　Sub-Family Zenarchopterinae　コモチサヨリ亜科　※←Zenarchopteridae。
　　　　　　　　　　　Super-Family Scomberesocoidea　サンマ上科
　　　　　　　　　　　　Family Forfecidae　フォルフェックス科 (絶滅)　※＝Forficidae。→Scomberesocidae？
　　　　　　　　　　　　Family Scomberesocidae　サンマ科
　　　　　　　　　　　Super-Family uncertain
　　　　　　　　　　　　Family Rogenionidae　ロゲニオ科 (絶滅)　※＝Rogeniidae。
　　　　　　　　　Order Cyprinodontiformes sensu Parenti 1981 卵胎生メダカ目　※卵生魚種も多い。
　　　　　　　　　　Sub-Order Aplocheiloidei　アプロケイルス亜目
　　　　　　　　　　　Family Aplocheilidae　アプロケイルス科
　　　　　　　　　　　Family Nothobranchiidae　ノトブランキウス科
　　　　　　　　　　　Family Rivulidae　リウルス科
　　　　　　　　　　Sub-Order Cyprinodontoidei　キプリノドン亜目
　　　　　　　　　　　Family Anablepidae ヨツメウオ科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Anablepinae ヨツメウオ亜科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Jeninsiinae イェニンシア亜科　※←Jeninsiidae。→Anablepinae？
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Oxyzigonectinae オキシジゴネクテス亜科
　　　　　　　　　　　Family Cyprinodontidae　キプリノドン科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Cubanichthyinae　クバニクティス亜科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Cyprinodontinae　キプリノドン亜科
　　　　　　　　　　　Family Fundulidae　フンドゥルス科
　　　　　　　　　　　Family Goodeidae　ゴオデア科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Empetrichthyinae　エムペトリクティス亜科　※←Empetrichthyidae。
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Goodeinae　ゴオデア亜科
　　　　　　　　　　　Family Poeciliidae ニジメダカ科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Alfarinae アルファロ亜科　※→Poeciliinae。
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Aplocheilichthyinae　アプロケイリクティス亜科　※←Aplocheilichthyidae。
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Gambusiinae　カダヤシ亜科　※→Poeciliinae。
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Poeciliinae　ニジメダカ亜科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Procatopodinae　プロカトプス亜科
　　　　　　　　　　　Family Profundulidae　プロフンドゥルス科
　　　　　　　　　　　Family Valenciidae　ウァレンキア科
　　　　　　　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　　　　　　　Genus Cyprinodontoideorum　キプリノドントイデオルム属 (絶滅)
　　　　　　　SERIES PERCOMORPHA ROSEN 1973 スズキ系
　　　　　　　　Order Beryciformes キンメダイ目
　　　　　　　　　Sub-Order Berycoidei キンメダイ亜目
　　　　　　　　　　Super-Family Berycoidea　キンメダイ上科
　　　　　　　　　　　Family Berycidae　キンメダイ科
　　　　　　　　　　Super-Family Holocentroidea　イットウダイ上科
　　　　　　　　　　　Family Holocentridae　イットウダイ科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Holocentrinae　イットウダイ亜科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Myripristinae　アカマツカサ亜科　※←Myripristidae。
　　　　　　　　　　Super-Family Trachichthyoidea　ヒウチダイ上科
　　　　　　　　　　　Family Anomalopidae　ヒカリキンメダイ科
　　　　　　　　　　　Family Anoplogastridae　オニキンメ科
　　　　　　　　　　　Family Diretmidae　ナカムラギンメ科
　　　　　　　　　　　Family Monocentridae　マツカサウオ科
　　　　　　　　　　　Family Trachichthyidae　ヒウチダイ科
　　　　　　　　　　Super-Family uncertain
　　　　　　　　　　　　　Genus Cleidogonia STINTON & TORRENS 1967　クレイドゴニア属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　　Cleidogonia antiqua Stinton & Torrens 1967 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　Genus Cryptoberyx GAUDANT 1978　クリプトベリックス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　　Cryptoberyx minima Gaudant 1978 (絶滅)
　　　　　　　　　Sub-Order Dinopterygioidei Patterson 1964　ディノプテリックス亜目 (絶滅)
　　　　　　　　　　Family Aipichthyidae　アイピクティス科 (絶滅)
　　　　　　　　　　Family Aipichthyoididae　アイピクティオイデス科 (絶滅)　※Aipichthyidaeより分離独立。
　　　　　　　　　　Family Dinopterygidae　ディノプテリックス科 (絶滅)
　　　　　　　　　　Family Pharmacichthyidae　ファルマキクティス科 (絶滅)
　　　　　　　　　　Family Pycnosteroididae　ピクノステロイデス科 (絶滅)
　　　　　　　　　　Family Stichocentridae　スティコケントルス科 (絶滅)
　　　　　　　　　Sub-Order Stephanoberycoidei カンムリキンメダイ亜目　※←Stephanoberyciformes。
　　　　　　　　　　Family Gibberichthyidae　フシギウオ科
　　　　　　　　　　Family Hispidoberycidae　ヒスピドベリックス科
　　　　　　　　　　Family Melamphaidae　カブトウオ科
　　　　　　　　　　Family Stephanoberycidae　カンムリキンメダイ科
　　　　　　　　　Sub-Order Cetomimoidei クジラウオ亜目　※←Cetomimiformes。
　　　　　　　　　　Family Barbourisiidae　アカクジラウオダマシ科
　　　　　　　　　　Family Cetomimidae　クジラウオ科　※Megalomycteridae（お父さん）＋Mirapinnidae（子供たち）。
　　　　　　　　　　Family Rondeletiidae　アンコウイワシ科
　　　　　　　　Order Elassomatiformes　エラッソマ目　"ピグミーサンフィッシュ"
　　　　　　　　　Sub-Order Elassomatoidei　エラッソマ亜目　※Percoideiに統合する意見あり。
　　　　　　　　　　Family　Elassomatidae　エラッソマ科
　　　　　　　　Order Perciformes BLEEKER 1859 スズキ目
　　　　　　　　　Sub-Order Polynemoidei ツバメコノシロ亜目
　　　　　　　　　　Family Iosciidae　イオスキオン科 (絶滅)　※＝Ioscionidae。
　　　　　　　　　　Family Polynemidae　ツバメコノシロ科
　　　　　　　　　　Family Sciaenidae　ニベ科　※＝Otolithidae。
　　　　　　　　　Sub-Order Anabantoidei キノボリウオ亜目
　　　　　　　　　　Family Anabantidae キノボリウオ科
　　　　　　　　　　Family Badidae バディス科
　　　　　　　　　　Family Channidae タイワンドジョウ科　※亜目に格上げする意見もある。
　　　　　　　　　　Family Helostomatidae　ヘロストマ科
　　　　　　　　　　Family Nandidae ナンドゥス科　※Percoideiとする意見あり。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Nandinae ナンドゥス亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Pristolepidinae プリストレピス亜科　※←Pristolepididae。
　　　　　　　　　　Family Polycentridae コノハウオ科　※Percoideiとする意見あり。
　　　　　　　　　　Family Osphronemidae　オスフロネムス科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Belontiinae　ベロンティア亜科　※←Belontiidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Luciocephaliinae　トリガシラ亜科　※←Luciocephaliidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Macropodinae　タイワンキンギョ亜科　※←Macropodidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Osphroneminae　オスフロネムス亜科
　　　　　　　　　Sub-Order LABROIDEI BLEEKER 1859 ベラ亜目　※＝Labriformes sensu Kaufman & Liem 1982。
　　　　　　　　　　Family Cichlidae カワスズメ科　※＋Priscacaridae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Astronotinae アストロノトゥス亜科　※新大陸。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Cichlasomatinae キクラソマ亜科　※新大陸。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Cichlinae キクラ亜科　※新大陸
　　　　　　　　　　　Sub-Family Etroplinae エトロプルス亜科　※ユーラシア大陸・マダガスカル。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Geophaginae ゲオファグス亜科　※新大陸。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Heterochromidinae ヘテロクロミス亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Pseudocrenilabrinae プセウドクレニラブルス亜科　※アフリカ大陸・ユーラシア大陸。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Ptychochrominae　プティコクロミス亜科　※マダガスカル。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Retroculinae レトロクルス亜科　※新大陸
　　　　　　　　　　Family Embiotocidae ウミタナゴ科
　　　　　　　　　　Family Labridae ベラ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Bodianinae タキベラ亜科　※←Bodianidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Cheilininae モチノウオ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Clepticinae クレプティクス亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Corinae カンムリベラ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Labrinae ベラ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Pseudodacinae ブダイベラ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Trigonodontinae　トリゴノドン亜科 (絶滅)　※←Trigonodontidae。→Pseudodacinae？
　　　　　　　　　　　Sub-Family Xyrichtyinae　テンス亜科　※←Xyrichtyidae。
　　　　　　　　　　Family Odacidae オダックス科
　　　　　　　　　　Family Pomacentridae スズメダイ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Amphipriinae クマノミ亜科　※＝Amphiprioninae。←Amphipriidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Chrominae スズメダイ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Lepidozyginae ハナダイダマシ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Pomacentrinae ソラスズメダイ亜科
　　　　　　　　　　Family Priscacaridae プリスカカラ科 (絶滅)
　　　　　　　　　　Family Scaridae ブダイ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Scarinae アオブダイ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Sparisomatinae　ブダイ亜科　※←Sparisomatidae。
　　　　　　　　　　Family Tortonesiidae トルトネシア科 (絶滅)　※＝Tortonesidae。
　　　　　　　　　Sub-Order Percoidei スズキ亜目
　　　　　　　　　　Super-Family Percoidea　スズキ上科
　　　　　　　　　　　Family Acropomatidae ホタルジャコ科　※＝Acropomidae。Percichthyidaeより分離独立。
　　　　　　　　　　　Family Ambassidae タカサゴイシモチ科　※＝Chandidae。
　　　　　　　　　　　Family Apogidae テンジクダイ科　※＝Apogonidae。
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Apoginae　テンジクダイ亜科　※＝Apogoninae。
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Pseudaminae　ヌメリテンジクダイ亜科
　　　　　　　　　　　Family Arripidae　アルリピス科
　　　　　　　　　　　Family Banjosidae チョウセンバカマ科
　　　　　　　　　　　Family Bathyclupeidae ソコニシン科
　　　　　　　　　　　Family Bramatidae シマガツオ科　※＝Bramidae。
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Bramatinae　シマガツオ亜科　※＝Braminae。
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Pteraclinae　ベンテンウオ亜科　※←Pteraclidae、Pteraclididae。
　　　　　　　　　　　Family Callanthiidae シキシマハナダイ科
　　　　　　　　　　　Family Caristiidae ヤエギス科　※＋Elephenoridae。
　　　　　　　　　　　Family Caucasichthyidae カウカシクティス科 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Family Centrarchidae オオクチバス科　※＝サンフィッシュ科。
　　　　　　　　　　　Family Centrogenyidae オニハタ科
　　　　　　　　　　　Family Centropomidae　ホソアカメ科
　　　　　　　　　　　Family Datnioididae ダトニオイデス科　※＝Coiidae。マツダイ科より分離独立。
　　　　　　　　　　　Family Dinolestidae ディノレステス科
　　　　　　　　　　　Family Dinopercidae ディノペルカ科
　　　　　　　　　　　Family Dipterichthyidae ディプテリクティス科 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Family Emmelichthyidae ハチビキ科
　　　　　　　　　　　Family Enoplosidae エノプロスス科
　　　　　　　　　　　Family Epigonidae ヤセムツ科
　　　　　　　　　　　Family Gerreidae クロサギ科
　　　　　　　　　　　Family Grammatidae グラムマ科
　　　　　　　　　　　Family Howellidae　クシスミクイウオ科
　　　　　　　　　　　Family Lactariidae アクタウオ科
　　　　　　　　　　　Family Lateolabracidae スズキ科
　　　　　　　　　　　Family Latidae アカメ科　※Centropomidaeより分離独立。
　　　　　　　　　　　Family Leiognathidae ヒイラギ科
　　　　　　　　　　　Family Lobotidae マツダイ科
　　　　　　　　　　　Family Malacanthidae キツネアマダイ科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Branchiosteginae　アマダイ亜科　※＝Latilinae。←Branchiostegidae。
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Malacanthinae　キツネアマダイ亜科
　　　　　　　　　　　Family Monodactylidae ヒメツバメウオ科
　　　　　　　　　　　Family Moronidae シマスズキ科　※未判定外来生物指定（２種除く）。
　　　　　　　　　　　Family Mullidae ヒメジ科
　　　　　　　　　　　Family Nardoichthyidae　ナルドイクティス科 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Family Opistognathidae アゴアマダイ科　※口腔内孵化。
　　　　　　　　　　　Family Ostracoberycidae オニガシラ科
　　　　　　　　　　　Family Pentacerotidae カワビシャ科　※＋Histiopteridae。
　　　　　　　　　　　Family Percichthyidae オヤニラミ科 ＋ケツギョ科 Sinipercidae。
　　　　　　　　　　　Family Percidae ホソスズキ科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Etheostominae　エテオストマ亜科　※←Etheostomidae。
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Percinae　ペルカ亜科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Romanichthyinae　ホソスズキ亜科　※＝Luciopercinae、←Luciopercidae。
　　　　　　　　　　　Family Perciliidae　ペルキリア科　※Percichthyidaeより分離独立。
　　　　　　　　　　　Family Plesiopidae タナバタウオ科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Acanthoclininae トゲタナバタウオ亜科　※←Acanthoclinidae。
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Plesiopinae タナバタウオ亜科
　　　　　　　　　　　Family Polypriidae イシナギ科　※＝Polyprionidae。Percichthyidaeより分離独立。
　　　　　　　　　　　Family Pomacanthidae　サザナミヤッコ科　（＝キンチャクダイ科）
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Holacanthinae　キンチャクダイ亜科　※←Holacanthidae。通常Polacanthinaeと分離されない。
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Pomacanthinae　サザナミヤッコ亜科
　　　　　　　　　　　Family Pomatomidae オキスズキ科
　　　　　　　　　　　Family Priacanthidae キントキダイ科
　　　　　　　　　　　Family Pseudochromidae ニセスズメ科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Anisochrominae　アニソクロミス亜科　※←Anisochromidae。
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Congrogadinae センニンガジ亜科　※←Congrogadidae。
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Pseudochrominae ニセスズメ亜科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Pseudoplesiopinae　タナバタメギス亜科　※←Pseudoplesiopidae。
　　　　　　　　　　　Family Pseudaphritidae　プセウダフリティス科
　　　　　　　　　　　Family Scombropidae ムツ科
　　　　　　　　　　　Family Serranidae ハタ科　※ハタという標準和名はない。
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Anthiinae ハナダイ亜科　※←Anthiidae。
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Epinephelinae マハタ亜科　※←Epinephelidae sensu Smith & Craig 2007。
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Grammistinae ヌノサラシ亜科　※←Grammistidae。
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Liopropomatinae ハナスズキ亜科　※←Liopropomatidae。
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Serraninae ヒメスズキ亜科
　　　　　　　　　　　Family Symphysanodontidae カワリハナダイ科
　　　　　　　　　　　Family Toxotidae テッポウウオ科
　　　　　　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　　　　　　Genus Bannikovperca TAVERNE 2010　バンニコウペルカ属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　Bannikovperca apula Taverne 2010 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　Genus Johnsonperca TAVERNE 2010　ヨーンソンペルカ属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　Johnsonperca annavaccarii Taverne 2010 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　Genus Percoideorum　ペルコイデオルム属 (絶滅)　※Otoliths＝耳石。→Apogonidae。
　　　　　　　　　　　　　Percoideorum acuminatum (Posthumus 1923) (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　　　syn.Percidarum acuminatum Posthumus 1923
　　　　　　　　　　　　　Percoideorum andreevae Mueller & Rosenberg 2003 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　Percoideorum aquitanicum Nolf 1988 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　Percoideorum bilottei Nolf 2003 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　Percoideorum citreum Nolf, Rana & Prasad 2008 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　Percoideorum diagonale Nolf 2003 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　Percoideorum ellipticum Rana 1988 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　Percoideorum nagpurense (Rana & Sahni 1989) (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　　　syn.Serranidarum nagpurense Rana & Sahni 1989
　　　　　　　　　　　　　Percoideorum palaresanum Nolf 2003 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　Percoideorum pseudochandrum Nolf & Dockery 1990 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　Percoideorum rangapurense Rana 1988 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　Percoideorum sciaenoides Nolf & Bajpai 1992 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　Percoideorum severnense Nolf & Stringer 1996 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　Percoideorum thierrysmithi Nolf, Rana & Singh 2006 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　Percoideorum tietzei (Schubert 1906) (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　　　syn.Cantharus tietzei (Schubert 1906)
　　　　　　　　　　　　　　　　　Otolithus (Genus Cantharus) tietzei Schubert 1906
　　　　　　　　　　　　　Percoideorum validum (Stinton 1977) (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　　　syn.Umbra valida Stinton 1977
　　　　　　　　　　　　Genus Saldenoichthys LÓPEZ-ARBARELLO, ARRATIA & TUNIK 2003　サルデノイクティス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　Saldenoichthys remotus López-Arbarello, Arratia & Tunik 2003 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　Genus Vixperca DE LA PENA-ZARZUELO 1991　ウィックスペルカ属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　Vixperca corrochani de la Pena-Zarzuelo 1991 (絶滅)
　　　　　　　　　　Super-Family Cirrhitoidea　ゴンベ上科
　　　　　　　　　　　Family Aplodactylidae　アプロダクティルス科
　　　　　　　　　　　Family Cheilodactylidae　タカノハダイ科
　　　　　　　　　　　Family Chironemidae　キロネムス科
　　　　　　　　　　　Family Cirrhitidae　ゴンベ科　※ゴンベイではない！
　　　　　　　　　　　Family Latridae　ラトリス科
　　　　　　　　　　Super-Family Cepoloidea　アカタチ上科
　　　　　　　　　　　Family Cepolidae アカタチ科　※＋Arambourgellidae。
　　　　　　　　　　Super-Family uncertain
　　　　　　　　　　　Family Asianthidae　アシアントゥス科 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Family Repropcidae　レプロプカ科 (絶滅)
　　　　　　　　　Sub-Order Haemuloidei イサキ亜目　※Percoideiに統合も。
　　　　　　　　　　Family Haemulidae イサキ科。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Haemulinae　タイセイヨウイサキ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Plectorhinchinae　コショウダイ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Pomadasyinae　ミゾイサキ亜科　※←Pomadasyidae。→Haemulinae。
　　　　　　　　　　Family Hapalogenyidae　ヒゲダイ科　※Haemulidaeより分離独立。
　　　　　　　　　　Family Inermiidae　イネルミア科
　　　　　　　　　Sub-Order Kyphosioidei イスズミ亜目　※Percoideiより分離独立。
　　　　　　　　　　Family Kuhliidae　ユゴイ科　※＝Duleidae。
　　　　　　　　　　Family Kyphosidae　イスズミ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Girellinae メジナ亜科　※←Girellidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Kyphosiinae イスズミ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Microcanthinae カゴカキダイ亜科　※←Microcanthidae。→Scorpididae？
　　　　　　　　　　　Sub-Family Scorpidinae　タカベ亜科　※Chaetodontidaeから分離したScorpididaeが格下げ。
　　　　　　　　　　Family Oplegnathidae イシダイ科
　　　　　　　　　　Family Parascorpididae パラスコルピス科
　　　　　　　　　　Family Sillagonidae　キス科　※＝Sillagidae，Sillaginidae。
　　　　　　　　　　Family Terapidae シマイサキ科　※＝Teraponidae、Terapontidae。
　　　　　　　　　Sub-Order Sparoidei タイ亜目　※スズキ亜目に統合も。
　　　　　　　　　　Family Caesionidae タカサゴ科　※Lutjanidaeより分離独立。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Caesioninae タカサゴ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Gynmocaesioninae　ホソタカサゴ亜科
　　　　　　　　　　Family Centracanthidae ケントラカントゥス科
　　　　　　　　　　Family Lethrinidae フエフキダイ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Lethrininae フエフキダイ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Monotaxinae　メイチダイ亜科
　　　　　　　　　　Family Lutjanidae フエダイ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Apsilinae　アメフエダイ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Etelinae　ハマダイ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Lutjaninae フエダイ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Symphorinae　イトヒキフエダイ亜科　※＝Paradicichthyinae。
　　　　　　　　　　Family Menidae ギンカガミ科
　　　　　　　　　　Family Nemipteridae イトヨリダイ科
　　　　　　　　　　Family Sparidae タイ科　※タイという標準和名の魚種はない。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Boopsinae　ボオプス亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Dentecinae　セナガキダイ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Diplodinae　ディプロドゥス亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Pagellinae　アサヒダイ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Pagrinae　マダイ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Spariinae　ヘダイ亜科
　　　　　　　　　Sub-Order Pempheroidei ハタンポ亜目　※Percoideiより分離独立。
　　　　　　　　　　Family Glaucosomatidae アオバダイ科
　　　　　　　　　　Family Leptobramatidae レプトブラマ科　※＝Leptobramidae。
　　　　　　　　　　Family Pempheridae ハタンポ科
　　　　　　　　　Sub-Order Acanthuroidei ハギ亜目（＝ニザダイ亜目）
　　　　　　　　　　Family Acanthuridae ハギ科（＝ニザダイ科）
　　　　　　　　　　　Sub-Family Acanthurinae クロハギ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Nasinae テングハギ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Prionurinae ニザダイ亜科
　　　　　　　　　　Family Chaetodontidae チョウチョウウオ科　※トリクティス幼生期。Percoideiに残留が主。
　　　　　　　　　　Family Ephippidae マンジュウダイ科　※＝Ephippididae。
　　　　　　　　　　Family Exelliidae エクセルリア科 (絶滅)　※Ephippidaeより分離独立。
　　　　　　　　　　Family Kushlukiidae クスルキア科 (絶滅)
　　　　　　　　　　Family Luvaridae アマシイラ科
　　　　　　　　　　Family Scatophagidae クロホシマンジュウダイ科　※トリクティス幼生期。
　　　　　　　　　　Family Siganidae アイゴ科　※＋Opisthomyzonidae。
　　　　　　　　　　Family Zanclidae ツノダシ科　※＋Massalongiidae。
　　　　　　　　　Sub-Order Caproidei　ヒシダイ亜目　※＝Caproiformes sensu Rosen 1984。
　　　　　　　　　　Family Caproidae　ヒシダイ科　※＋Acanthonemidae。Zeiformesより移動。
　　　　　　　　　Sub-Order Dichistoidei スダレダイ亜目　※Percoideiより分離独立。
　　　　　　　　　　Family Dichistiidae ディキスティウス科　※＝Coracinidae。
　　　　　　　　　　Family Drepaneidae　スダレダイ科　※Ephippidaeより分離独立。
　　　　　　　　　Sub-Order Scombroidei サバ亜目　※＝Scombriformes sensu Johnson, 1986。TUNNIIFORMESとして独立させる意見もある。
　　　　　　　　　　Super-Family Scombroidea BLEEKER 1859　サバ上科
　　　　　　　　　　　Family Scombridae サバ科　※＋Cybiidae。
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Gasterochismatinae　ガステロキスマ亜科　※←Gasterochismatidae。
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Scomberomorinae　サワラ亜科　※←Scomberomoridae。
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Scombrinae　サバ亜科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Thunninae　マグロ亜科　※←Thunnidae。
　　　　　　　　　　Super-Family Trichiuroidea　タチウオ上科
　　　　　　　　　　　Family Euzaphlegidae　エウザフレゲス科 (絶滅)　※＋Propercarinidae。
　　　　　　　　　　　Family Gempylidae クロタチカマス科
　　　　　　　　　　　Family Sphyraenidae カマス科
　　　　　　　　　　　Family Trichiuridae タチウオ科
　　　　　　　　　Sub-Order Xiphioidei カジキ亜目
　　　　　　　　　　Family Blochiidae ブロキウス科 (絶滅)
　　　　　　　　　　Family Hemingwayidae ヘミングワヤ科 (絶滅)
　　　　　　　　　　Family Istiophoridae バショウカジキ科　※+Tetrapturidae。
　　　　　　　　　　Family Palaeorhynchidae パラエオリンクス科 (絶滅)　※＝Paleorhynchidae。
　　　　　　　　　　Family Xiphiidae メカジキ科
　　　　　　　　　　Family Xiphiorhynchidae 　キシフィオリンクス科 (絶滅)　※→XIPHIIDAE。
　　　　　　　　　Sub-Order Icosteoidei イレズミコンニャクアジ亜目
　　　　　　　　　　Family Icosteidae　イレズミコンニャクアジ科
　　　　　　　　　Sub-Order Kurtoidei コモリウオ亜目
　　　　　　　　　　Family Kurtidae　コモリウオ科
　　　　　　　　　Sub-Order Carangoidei アジ亜目　※＝Carangiformes Jordan 1923
　　　　　　　　　　Family Carangidae アジ科　※＋Seriolidae、Trachinotidae。
　　　　　　　　　　Family Coryphaenidae シイラ科
　　　　　　　　　　Family Ductoridae ドゥクトル科 (絶滅)　※→Carangidae。
　　　　　　　　　　Family Echeneidae コバンザメ科　※亜目に格上げする意見あり。
　　　　　　　　　　Family Nematistiidae オンドリアジ科
　　　　　　　　　　Family Rachycentridae スギ科　※＋Apolectidae。
　　　　　　　　　Sub-Order Stromateoidei イボダイ亜目　※アジ亜目より分離独立。＝Stromateiformes Jordan 1923
　　　　　　　　　　Family Amarsipidae　アマルシプス科
　　　　　　　　　　Family Ariommatidae　オオメメダイ科
　　　　　　　　　　Family Centrolophidae　イボダイ科
　　　　　　　　　　Family Nomeidae　エボシダイ科
　　　　　　　　　　Family Tetragonuridae　ドクウロコイボダイ科
　　　　　　　　　　Family Stromateidae　マナガツオ科
　　　　　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　　　　　Genus Stromateoidarum　ストロマテオイダルム属 (絶滅)　※Otoliths＝耳石。
　　　　　　　　　　　　Stromateoidarum sp.'Paleocene of Denmark' (絶滅)
　　　　　　　　　Sub-Order Scombrolabracoidei ムカシクロタチ亜目
　　　　　　　　　　Family Scombrolabracidae　ムカシクロタチ科
　　　　　　　　　Sub-Order Gobioidei ハゼ亜目　※＝Gobiiformes Günther 1880。
　　　　　　　　　　Family Eleotridae　カワアナゴ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Butidinae　ノコギリハゼ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Eleotrinae　カワアナゴ亜科
　　　　　　　　　　Family Gobiidae　ハゼ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Amblyopinae　ワラスボ亜科　※←Amblyopidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Gobiinae　ハゼ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Gobionellinae　マハゼ亜科　※←Gobionellidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Oxudercinae　トビハゼ亜科　※←Oxudercidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Sicydiinae　ボウズハゼ亜科　※←Sicydiidae。
　　　　　　　　　　Family Kraemeriidae　スナハゼ科
　　　　　　　　　　Family Microdesmidae　オオメワラスボ科　※＝Gunnellichthyidae。
　　　　　　　　　　Family Odontobutididae　ドンコ科　※＝Odontobutidae。
　　　　　　　　　　Family Ptereleotridae　クロユリハゼ科
　　　　　　　　　　Family Rhyacichthyidae　ツバサハゼ科
　　　　　　　　　　Family Schindleriidae　シラスウオ科
　　　　　　　　　　Family Xenisthmidae　ヤナギハゼ科
　　　　　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　　　　　　Genus Gobioidarum　ゴビオイダルム属 (絶滅)　※Otoliths＝耳石。
　　　　　　　　　　　　　Gobioidarum duorum Gill 1862 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　Genus Gobioideorum　ゴビオイデオルム属 (絶滅)　※Otoliths＝耳石。
　　　　　　　　　　　　　Gobioideorum nolfi (Bajpai & Kapur 2004) (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　　　syn.Gobiidarum nolfi Bajpai & Kapur 2004
　　　　　　　　　Sub-Order Blennioidei ギンポ亜目　※＝Blenniiformes sensu Springer 1993。
　　　　　　　　　　Family Blenniidae　イソギンポ科
　　　　　　　　　　Family Chaenopsidae　コケギンポ科
　　　　　　　　　　Family Clinidae　アサヒギンポ科
　　　　　　　　　　Family Dactyloscopidae　ダクティロスコプス科
　　　　　　　　　　Family Eleginopsidae　ダイリンノト科
　　　　　　　　　　Family Labrisomidae　ラブリソムス科
　　　　　　　　　　Family Tripterygiidae　ヘビギンポ科
　　　　　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　　　　　Genus Oncolepis BASSANI 1898　オンコレピス属 (絶滅)　※ウバウオの可能性あり。
　　　　　　　　　　　　Oncolepis isseli Bassani 1898 (絶滅)
　　　　　　　　　SUB-ORDER ZOARCOIDEI　ゲンゲ亜目　※目 ZOARCIFORMES としてPerciformesから独立させる意見がある
　　　　　　　　　　Family Anarhichadidae　オオカミウオ科
　　　　　　　　　　Family Bathymasteridae　メダマウオ科
　　　　　　　　　　Family Cryptacanthodidae　ハダカオオカミウオ科
　　　　　　　　　　Family Pholidae　ニシキギンポ科　(=Pholididae)
　　　　　　　　　　Family Ptilichthyidae　ハネガジ科
　　　　　　　　　　Family Scytalinidae　スキタリナ科
　　　　　　　　　　Family Stichaeidae　タウエガジ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Chirolophinae　フサギンポ亜科　※←Chirolophidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Lumpeninae　ウナギガジ亜科　※←Lumpenidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Neozoarcinae　ハナイトギンポ亜科　※←Neozoarcidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Opisthocentrinae　ガジ亜科　※←Opisthocentridae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Stichaeinae　タウエガジ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Xiphisterinae　キシフィステル亜科　※←Xiphisteridae。
　　　　　　　　　　Family Zaproridae　ボウズギンポ科
　　　　　　　　　　Family Zoarcidae　ゲンゲ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Lycodinae　マユガジ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Lycozoarcinae　セダカゲンゲ亜科　※←Lycozoarcidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Gymnelinae　ハダカゲンゲ亜科　※←Gymnelidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Zoarcinae　ナガガジ亜科
　　　　　　　　　SUB-ORDER NOTOTHENIOIDEI　南極カジカ亜目　※＝Nototheniiformes Jordan 1923。ゲンゲ目 ZOARCIFORMES を立ててそちらに編入させる意見がある。
　　　　　　　　　　Family Artedidraconidae　アルテディドラコ科　※Harpagiferidae科に編入も
　　　　　　　　　　Family Bathydraconidae　キバゴチ科
　　　　　　　　　　Family Bovichtidae　ウシオニカジカ科
　　　　　　　　　　Family Channichthyidae　コオリウオ科　※赤血球を欠く。
　　　　　　　　　　Family Harpagiferidae　ハルパギフェル科
　　　　　　　　　　Family Nototheniidae　ナンキョクカジカ科
　　　　　　　　　SUB-ORDER TRACHINOIDEI　ワニギス亜目　※＝Trachiniformes Bertin & Arambourg 1958。ゲンゲ目 ZOARCIFORMES を立ててそちらに編入させる意見もある。
　　　　　　　　　　Family Ammodytidae　イカナゴ科
　　　　　　　　　　Family Champsodontidae　ワニギス科
　　　　　　　　　　Family Cheimarrichthyidae　ケイマルリクティス科
　　　　　　　　　　Family Chiasmodontidae　クロボウズギス科
　　　　　　　　　　Family Creediidae　トビギンポ科
　　　　　　　　　　Family Leptoscopidae　レプトスコプス科
　　　　　　　　　　Family Percophidae　ホカケトラギス科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Bembropsinae　アイトラギス亜科　※←Bembropsidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Hemerocoetinae　ホカケトラギス亜科　※←Hemerocoetidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Percophinae　ペスパロ亜科
　　　　　　　　　　Family Pinguipedidae　トラギス科　※＝Mugiloidae、Mugiloididae。
　　　　　　　　　　Family Pholidichthyidae　フォリディクティス科
　　　　　　　　　　Family Trachinidae　ハチミシマ科
　　　　　　　　　　Family Trichodontidae　ハタハタ科
　　　　　　　　　　Family Trichonotidae　ベラギンポ科
　　　　　　　　　　Family Uranoscopidae　ミシマオコゼ科
　　　　　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　　　　　Genus Trachinoideorum　トラキノイデオルム属 (絶滅)　※Otoliths＝耳石。
　　　　　　　　　　　　Trachinoideorum latisulcatum (Frost 1931) (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　　syn.Macruridarum latisulcatum (Frost 1931)
　　　　　　　　　　　　　　　　Otolithus (Genus Macruridarum) latisulcatus Frost 1931
　　　　　　　　　　　　Trachinoideorum sagittiforme Schwarzhans 1980 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　Trachinoideorum ultimum Schwarzhans 1980 (絶滅)
　　　　　　　　　Sub-Order Callionymoidei ネズッポ亜目
　　　　　　　　　　Family Callionymidae　ネズッポ科
　　　　　　　　　　Family Draconettidae　イナカヌメリ科
　　　　　　　　　Sub-Order uncertain
　　　　　　　　　　Family Quasimullidae　クアシムルルス科 (絶滅)
　　　　　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　　　　　Genus Apscheronichthys PROKOFIEV 2001　アプスケロニクティス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　Apscheronichthys bogatshovi Prokofiev 2001 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Genus Epibatichthys PROKOFIEV 2002　エピバティクティス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　Epibatichthys corruptus Prokofiev 2002 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Genus Perciformorum　ペルキフォルモルム属 (絶滅)　※Otoliths＝耳石。
　　　　　　　　　　　　Perciformorum cepoloides Nolf & Dockery 1990 (絶滅)　※種小名からいくとCepolidae？
　　　　　　　　　　　　Perciformorum syltense Gaemers & Schwarzhans 1977 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　Perciformorum wheeleri Steurbaut 1979 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Genus Pietschellus BANNIKOV & CARNEVALE 2011　ピエトスケルルス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　Pietschellus aenigmaticus Bannikov & Carnevale 2011 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Genus Pirsagatia PROKOFIEV 2002　ピルサガティア属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　Pirsagatia sytchevskayae Prokofiev 2002 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Genus Platylaemus DIXON 1850　プラティラエムス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　Platylaemus colei Dixon 1850 (絶滅)
　　　　　　　　Order Gobiesociformes Gill 1872 ウバウオ目　※スズキ目の亜目・タウナギ亜系に移す意見等あり。
　　　　　　　　　Family Gobiesocidae　ウバウオ科
　　　　　　　　　　Sub-Family Alabetinae　アラベス亜科　※＝Cheilobranchinae。←Alabetidae、Cheilobranchidae。
　　　　　　　　　　Sub-Family Gobiesocinae　ウバウオ亜科
　　　　　　　　Order Scorpaeniformes カサゴ目
　　　　　　　　　Sub-Order Anoplopomatoidei ギンダラ亜目
　　　　　　　　　　Family Anoplopomatidae　ギンダラ科
　　　　　　　　　Sub-Order Cottoidei カジカ亜目　※＝Cottiformes sensu Wiley & Johnson 2011。
　　　　　　　　　　Super-Family Cyclopteroidea　ダンゴウオ上科
　　　　　　　　　　　Family Cyclopteridae　ダンゴウオ科
　　　　　　　　　　　Family Liparididae　クサウオ科　※＝Liparidae。
　　　　　　　　　　Super-Family Cottoidea　カジカ上科
　　　　　　　　　　　Family Abyssocottidae　バイカルカジカ科
　　　　　　　　　　　Family Agonidae　トクビレ科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Agoninae　ヤセトクビレ亜科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Anoplagoninae　ナメトクビレ亜科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Bathyagoninae　ソコトクビレ亜科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Bothragoninae　サイトクビレ亜科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Brachyopsinae　シチロウウオ亜科　※←Brachyopsidae。
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Hypsagoninae　ツノシャチウオ亜科
　　　　　　　　　　　Family Bathylutichthyidae　バティルティクティス科
　　　　　　　　　　　Family Comephoridae　アブラウオ科
　　　　　　　　　　　Family Cottidae　カジカ科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Cottinae　カジカ亜科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Icelinae　コオリカジカ亜科　※←Icelidae。
　　　　　　　　　　　Family Cottocomephoridae　コットコメフォルス科
　　　　　　　　　　　Family Ereuniidae　トリカジカ科
　　　　　　　　　　　Family Hemitripteridae　ケムシカジカ科
　　　　　　　　　　　Family Psychrolutidae　ウラナイカジカ科
　　　　　　　　　　　Family Rhamphocottidae　クチバシカジカ科
　　　　　　　　　　Super-Family uncertain
　　　　　　　　　　　Family Eocottidae　エオコットゥス科 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Bassanichthyinae　バッサニクティス亜科 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Eocottinae　エオコットゥス亜科 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　　　　　　　Genus Cottoideorum　コットイデオルム属 (絶滅)　※Otoliths＝耳石。
　　　　　　　　　　　　　　Cottoideorum suspectum Schwarzhans 1980 (絶滅)
　　　　　　　　　Sub-Order Dactylopteroidei セミホウボウ亜目
　　　　　　　　　　Family Dactylopteridae　セミホウボウ科　※＝Cephalacanthidae。＋Pterygocephalidae。
　　　　　　　　　Sub-Order Hexagrammoidei アイナメ亜目
　　　　　　　　　　Family Eschmeyeridae　エスクメイェル科
　　　　　　　　　　Family Hexagrammidae　アイナメ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Hexagramminae　アイナメ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Ophiodontinae　オフィオドン亜科　※←Ophiodontidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Oxylebiinae　オキシレビウス亜科　※←Oxylebiidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Pleurogramminae　ホッケ亜科　※←Pleurogrammidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Zaniolepidinae　ザニオレピス亜科　※←Zaniolepididae。
　　　　　　　　　Sub-Order Normanichthyoidei ノルマニクティス亜目
　　　　　　　　　　Family Normanichthyidae　ノルマニクティス科
　　　　　　　　　Sub-Order Platycephaloidei コチ亜目
　　　　　　　　　　Family Bembridae　アカゴチ科
　　　　　　　　　　Family Hoplichthyidae　ハリゴチ科
　　　　　　　　　　Family Parabembridae　ウバゴチ科
　　　　　　　　　　Family Platycephalidae　コチ科
　　　　　　　　　Sub-Order Scorpaenoidei sensu Imamura & Shinohara 1998 カサゴ亜目
　　　　　　　　　　Family Apistidae　ハチ科　※フサカサゴ科より分離独立。
　　　　　　　　　　Family Aploactinidae　イボオコゼ科
　　　　　　　　　　Family Caracanthidae　ダンゴオコゼ科
　　　　　　　　　　Family Congiopodidae　フエフキオコゼ科
　　　　　　　　　　Family Gnathanacanthidae　グナタナカントゥス科
　　　　　　　　　　Family Neosebastidae　ヒレナガカサゴ科
　　　　　　　　　　Family Pataecidae　タテガミオコゼ科
　　　　　　　　　　Family Plectrogenidae　ヒメキチジ科
　　　　　　　　　　Family Scorpaenidae　フサカサゴ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Pteroinae　ミノカサゴ亜科　※←Pteroidae。
　　　　　　　　　　　Sub-Family Scorpaeninae　フサカサゴ亜科
　　　　　　　　　　Family Sebastidae　メバル科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Sebastinae　メバル亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Sebastolobinae　キチジ亜科　※←Sebastolobidae。
　　　　　　　　　　Family Setarchidae　シロカサゴ科
　　　　　　　　　　Family Synanceiidae　オニダルマオコゼ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Choridactylinae　オニオコゼ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Minoinae　ヒメオコゼ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Synanceiinae　オニダルマオコゼ亜科
　　　　　　　　　　Family Tetrarogidae　ハオコゼ科
　　　　　　　　　Sub-Order Trigloidei ホウボウ亜目
　　　　　　　　　　Family Peristediidae　キホウボウ科
　　　　　　　　　　Family Triglidae　ホウボウ科
　　　　　　　　　Sub-Order uncertain
　　　　　　　　　　　　Genus Scorpaeniformorum　スコルパエニフォルモルム属 (絶滅)　※Otoliths＝耳石。
　　　　　　　　　　　　　Scorpaeniformorum agonoides Nolf 2003 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　Scorpaeniformorum sutilum Stinton 1970 (絶滅)
　　　　　　　　Order Pleuronectiformes BLEEKER 1859 カレイ目
　　　　　　　　　Sub-Order Pleuronectoidei カレイ亜目
　　　　　　　　　　Family Achiropsettidae　テナシビラメ科
　　　　　　　　　　Family Bothidae　ダルマガレイ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Bothinae　ダルマガレイ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Taeniopsettinae　イトヒキガンゾウビラメ亜科
　　　　　　　　　　Family Citharidae　コケビラメ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Brachypleurinae　ブラキプレウラ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Citharinae　コケビラメ亜科
　　　　　　　　　　Family Paralichthyidae　ヒラメ科
　　　　　　　　　　Family Pleuronectidae　カレイ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Eopsettinae　ムシガレイ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Hippoglossinae　アカガレイ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Hippoglossoidinae　カラスガレイ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Lyopsettinae　リオプセッタ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Paralichthodinae　パラリクトデス亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Pleuronectinae　マコガレイ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Poecilopsettinae　カワラガレイ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Rhombosoleinae　セダカシタビラメガレイ亜科
　　　　　　　　　　Family Samaridae　ハタタテガレイ科
　　　　　　　　　　Family Scophthalmidae　スコフタルムス科
　　　　　　　　　Sub-Order Psettodoidei　ボウズガレイ亜目
　　　　　　　　　　Family Psettodidae　ボウズガレイ科
　　　　　　　　　Sub-Order Soleoidei ウシノシタ亜目　※←Soleiformes。
　　　　　　　　　　Family Achiridae　アメリカカレイ科
　　　　　　　　　　Family Cynoglossidae　イヌノシタ科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Cynoglossinae　イヌノシタ亜科
　　　　　　　　　　　Sub-Family Symphurinae　アズマガレイ亜科
　　　　　　　　　　Family Soleidae　ササウシノシタ科
　　　　　　　　　Sub-Order uncertain
　　　　　　　　　　Family Amphistiidae　アムフィスティウム科 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Genus Imhoffius CHABANAUD 1962　イムホッフィウス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　Imhoffius lutetianus Chabanaud 1962 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　　syn.Imhoffichthys lutetianus (Chabanaud 1962)
　　　　　　　　　　　Genus Pleuronectiformorum　プレウロネクティフォルモルム属 (絶滅)　※Otoliths＝耳石。
　　　　　　　　　　　　Pleuronectiformorum tenue (Schubert 1906) (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　　syn.Otolithus (Genus Solea) tenuis Schubert 1906
　　　　　　　　　　　　　　　　Solea tenuis Schubert 1906
　　　　　　　　Order Tetraodontiformes REGAN 1929 フグ目
　　　　　　　　　Sub-Order Balistoidei モンガラカワハギ亜目
　　　　　　　　　　Super-Family Bolcabalistoidea　ボルカバリステス上科 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Family Bolcabalistidae　ボルカバリステス科 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Family Eospinidae　エオスピヌス科 (絶滅)
　　　　　　　　　　Super-Family Balistoidea　モンガラカワハギ上科
　　　　　　　　　　　Family Balistidae　モンガラカワハギ科
　　　　　　　　　　　Family Monacanthidae　カワハギ科
　　　　　　　　　　　Family Protobalistidae　プロバリストゥム科 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Family Spinacanthidae　スピナカントゥス科 (絶滅)
　　　　　　　　　　Super-Family Moclaybalistoidea　モクライバリステス上科 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Family Moclaybalistidae　モクライバリステス科 (絶滅)
　　　　　　　　　　Super-Family Ostracioidea　ハコフグ上科
　　　　　　　　　　　Family Aracanidae　イトマキフグ科
　　　　　　　　　　　Family Ostraciidae　ハコフグ科　※＝Ostracionidae・Ostraciontidae。
　　　　　　　　　　Super-Family Plectocretacicoidea TAYLER SORBINI 1996 プレクトクレタキクス上科 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Family Cretatriacanthidae　クレタトリアカントゥス科 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Family Plectocretacicidae　プレクトクレタキクス科 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Family Protriacanthidae　プロトリアカントゥス科 (絶滅)
　　　　　　　　　　Super-Family Triacanthoidea ギマ上科　※亜目に格上げも。
　　　　　　　　　　　Family Triacanthidae　ギマ科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Cryptobalistinae　クリプトバリステス亜科 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Protacanthodinae　プロタカントデス亜科 (絶滅)　"原始ギマ類"
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Triacanthinae　ギマ亜科
　　　　　　　　　　　Family Triacanthodidae　ベニカワムキ科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Hollardiinae　トゲカワムキ亜科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Triacanthodinae　ベニカワムキ亜科
　　　　　　　　　Sub-Order Tetraodontoidei BERG 1937 フグ亜目
　　　　　　　　　　　Family Diodontidae　ハリセンボン科
　　　　　　　　　　　Family Eoplectidae　エオプレクトゥス科 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Family Triodontidae　ウチワフグ科
　　　　　　　　　　　Family Tetraodontidae　フグ科
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Canthigasterinae　キンチャクフグ亜科　※←Canthigasteridae。
　　　　　　　　　　　　Sub-Family Tetraodontinae　フグ亜科
　　　　　　　　　　　Family Zignoichthyidae　ジグノイクティス科 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Family Molidae　マンボウ科
　　　　　　　　　Sub-Order uncertain
　　　　　　　　　　　Family Eotrigonodontidae　エオトリゴノドン科 (絶滅)　※・・・Labridae？
　　　　　　　　　　　Family Sorbinipercidae　ソルビニペルカ科 (絶滅)
　　　　　　　　　　　Family Zorzinichthyidae　ゾルジニクティス科 (絶滅)
　　　　　　　SERIES uncertain
　　　　　　　　　　　　Genus Acanthomorphorum　アカントモルフォルム属 (絶滅)　※Otoliths＝耳石。
　　　　　　　　　　　　　Acanthomorphorum forcallense Nolf 2004 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　Genus Muhichthys GONZÁLEZ-RODRÍGUEZ & FIELITZ 2008　ムヒクティス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　Muhichthys cordobai González-Rodríguez & Fielitz 2008 (絶滅)
　　　　　INFRA-DIVISION uncertain　※(＝Teleostei incertae sedis)
　　　　　　　　　Series uncertain
　　　　　　　　　　Order uncertain
　　　　　　　　　　　Family uncertain
　　　　　　　　　　　　Genus Antofagastaichthys ARRATIA 1986　アントファガスタイクティス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　Antofagastaichthys mandibularis Arratia 1986 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　Genus Fierasferoides SCHWARZHANS & BRATISHKO 2011　フィエラスフェロイデス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　Fierasferoides bucculentus Schwarzhans & Bratishko 2011 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　Genus Hama ZHOU 1976　ハマ属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　Hama macrostomum Zhou 1976 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　Genus Mylidaphus COPE 1876　ミリダフス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　Mylidaphus bibartitus Cope 1876 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　Genus Spinocaudichthys FILLEUL & DUTHEIL 2001　スピノカウディクティス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　Spinocaudichthys oumtkoutensis Filleul & Dutheil 2001 (絶滅)　※淡水棲。
　　　　　　　　　　　　Genus Teleosteorum　テレオステオルム属 (絶滅)　※Otoliths＝耳石。
　　　　　　　　　　　　　Teleosteorum ahlumense (Stolley 1910) (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　　　syn.Otolithus (Genus incertae sedis) ahlumensis Stolley 1910
　　　　　　　　　　　　　Teleosteorum bornkolmiense (Stolley 1910) (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　　　syn.Otolithus (Genus incertae sedis) bornkolmiensis Stolley 1910
　　　　　　　　　　　　　Teleosteorum crassirostre (Rzehak 1893) (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　　　syn.Otolithus (Genus incertae sedis) crassirostris Rzehak 1893
　　　　　　　　　　　　　Teleosteorum solitarium (Rzehak 1893) (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　　　syn.Otolithus (Genus incertae sedis) solitarius Rzehak 1893
　　　　　　　　　　　　　Teleosteorum neocomiense (Stolley 1910) (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　　　syn.Otolithus (Genus incertae sedis) neocomiensis Stolley 1910
　　　　　　　　　　　　　Teleosteorum pujoli Steurbaut 1984 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　Teleosteorum sagittiforme (Weiler 1958) (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　　　syn.Otolithus (Genus incertae sedis) sagittiformis Weiler 1958
　　　　　　　　　　　　　Teleosteorum trigonale (Stolley 1910) (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　　　syn.Otolithus (Genus incertae sedis) trigonalis Stolley 1910
　　　　　　　　　　　　　Teleosteorum zorraquinosi Huddleston 1981 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　Genus Tonghuaichthys MA & SUN 1988　トングアイクティス属 (絶滅)
　　　　　　　　　　　　　Tonghuaichthys sanyuanpuensis Ma & Sun 1988 (絶滅)
SUPER-CLASS uncertain
　Class uncertain
　　Order uncertain
　　　Family uncertain
　　　　Genus Fenhsiangia LONG & BURRETT 1989　フェンシアンギア属 (絶滅)
　　　　　　※微細な筒状脊椎動物なレベル。
　　　　　Fenhsiangia zhangwentangi Long & Burrett 1989 (絶滅)
　　　　Genus Undichna ANDERSON 1976　ウンディクナ属 (絶滅)
　　　　　　　※本属は棘や胸鰭・腹鰭（対鰭）及び尾鰭（欠く場合あり）の痕跡パターン。板皮類・棘魚類等と推測。それぞれ分類的なグループに非ず。
　　　　　Undichna bina Anderson 1976 (絶滅)
　　　　　Undichna britannica Higgs 1988 (絶滅)
　　　　　Undichna gosiutensis Gibert 2001 (絶滅)　※ジュラ紀。
　　　　　Undichna insolentia Anderson 1976 (絶滅)
　　　　　Undichna quina Trewin 2000 (絶滅)
　　　　　Undichna radnicensis Turek 1989 (絶滅)
　　　　　Undichna septemsulcata Wisshak, Volohonsky & Blomeier 2004 (絶滅)
　　　　　Undichna simplicitas Anderson 1976 (絶滅)
　　　　　Undichna tricosta Lu & Chen 1998 (絶滅)
　　　　　Undichna trisulcata Morrissey, Braddy, Bennett, Marriott, Susan & Tarrant 2004 (絶滅)
　　　　　Undichna unisulca Gibert, Buatois, Fregenal-Martinez, Mangano, Ortega, Poyato-ariza & Wenz 1999 (絶滅)
　　　　　Undichna westerbergensis Schweigert 2001 (絶滅)





★分類を追求する為に役立つウェブサイト★

◆http://www.fishbase.org/search.cfm
　現生魚全種の基本データ。分類の詳細(再編や移行)はほぼ完全。先ずはこちらを。
◆http://tolweb.org/tree?group=Vertebrata&contgroup=Craniata
　全生命の系統を追う壮大なプロジェクト。工事中も多いですが魚類に関しては殆ど追えます。各グループの詳細な解説があるので、初心者は先ずこちらで楽しく順を追うのがお薦めです。ちなみにトップはhttp://tolweb.org/tree/。
◆http://www.fmnh.helsinki.fi/users/haaramo/Metazoa/Deuterostoma/Chordata/Vertebrata.htm
　恐らく最強のツリー。｢何が居るか｣・｢何が居たか｣を全て追求出来るプロジェクト。解説は一切無しなので、頭の中に現生魚類の系統樹くらい無いときついです。ちなみにトップはhttp://www.fmnh.helsinki.fi/users/haaramo/default.htm#Basal_Eukaryotae。

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